26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1708 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1708  hypothetical protein  100 
 
 		 385 aa  762    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104403 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0541  hypothetical protein  39.75 
 
 		 332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682132  normal  0.522386 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4044  hypothetical protein  42.09 
 
 		 339 aa  209  6e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.948145  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7563  hypothetical protein  38.16 
 
 		 358 aa  205  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0496  hypothetical protein  38.8 
 
 		 382 aa  202  8e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0544  hypothetical protein  37.33 
 
 		 384 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.200606 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0285  hypothetical protein  37.26 
 
 		 359 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.106647 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0405  hypothetical protein  36.44 
 
 		 356 aa  192  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3072  hypothetical protein  37.24 
 
 		 339 aa  189  5e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3882  hypothetical protein  39.29 
 
 		 345 aa  185  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0183166 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0500  hypothetical protein  36.62 
 
 		 359 aa  176  6e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3589  hypothetical protein  38.46 
 
 		 340 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2558  putative signal peptide protein  37.16 
 
 		 330 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.290858  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1879  hypothetical protein  35.54 
 
 		 341 aa  146  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.237366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2327  hypothetical protein  31.58 
 
 		 352 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.519854  normal  0.378191 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4143  hypothetical protein  29.97 
 
 		 353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.980511  normal  0.981417 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2288  hypothetical protein  32.6 
 
 		 318 aa  103  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3339  hypothetical protein  30.92 
 
 		 293 aa  94.7  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0022  hypothetical protein  30.8 
 
 		 297 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2660  hypothetical protein  30.94 
 
 		 322 aa  88.6  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0986775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2751  hypothetical protein  30.48 
 
 		 332 aa  87  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.417793 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1364  hypothetical protein  31.32 
 
 		 283 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0032  hypothetical protein  31.67 
 
 		 296 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2664  hypothetical protein  27.27 
 
 		 308 aa  68.9  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4864  hypothetical protein  34.45 
 
 		 394 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.019631  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4386  hypothetical protein  26.07 
 
 		 390 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.47419 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>