More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0945 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0945  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 466 aa  932    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.564865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2013  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.37 
 
 		 490 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3441  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  48 
 
 		 489 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.687758  normal  0.0246351 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  48.09 
 
 		 486 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.22 
 
 		 482 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.848093  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3085  putative two-component sensor histidine kinase  47.63 
 
 		 486 aa  394  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1447  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.44 
 
 		 486 aa  394  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0274  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.52 
 
 		 469 aa  382  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3518  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.65 
 
 		 462 aa  383  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00833469  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5480  histidine kinase  47.6 
 
 		 481 aa  381  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814651  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0375  histidine kinase  47.83 
 
 		 476 aa  374  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0405  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.32 
 
 		 476 aa  371  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.152478  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3483  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.49 
 
 		 502 aa  368  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0636305  normal  0.224106 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2237  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.64 
 
 		 477 aa  367  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.128142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0328  ATPase domain-containing protein  47.29 
 
 		 476 aa  367  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1198  Signal transduction histidine kinase  45.53 
 
 		 486 aa  364  2e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.407159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2665  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.18 
 
 		 467 aa  362  1e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11798  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0190  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.61 
 
 		 487 aa  360  3e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.482621 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0903  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.99 
 
 		 468 aa  359  6e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.211263  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0613  sensor histidine kinase  43.68 
 
 		 467 aa  359  7e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.639539  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0612  sensor histidine kinase  43.68 
 
 		 467 aa  359  7e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3739  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.44 
 
 		 492 aa  355  1e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.38 
 
 		 465 aa  346  4e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.883894 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0926  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.07 
 
 		 469 aa  342  8e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.147036  decreased coverage  0.00245502 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1075  histidine kinase  42.86 
 
 		 469 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0944  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.44 
 
 		 477 aa  325  1e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.283053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1371  two component sensor kinase  41.79 
 
 		 468 aa  324  2e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0436  sensor histidine kinase  40.04 
 
 		 460 aa  322  7e-87  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.82 
 
 		 515 aa  318  1e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1525  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.73 
 
 		 472 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.35 
 
 		 488 aa  307  3e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3885  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.47 
 
 		 468 aa  290  4e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.573879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0784  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.69 
 
 		 481 aa  280  4e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 480 aa  246  9e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.179975 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2914  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  44.87 
 
 		 533 aa  243  5e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0312  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 469 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.029986  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2084  histidine kinase  35.6 
 
 		 463 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6012  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 		 463 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2065  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 		 463 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.920916  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0703  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 		 465 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.110579  normal  0.926009 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0766  histidine kinase  33.33 
 
 		 476 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.607957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3416  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 		 456 aa  211  3e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2951  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 467 aa  209  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.181714  normal  0.254929 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2906  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 463 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.136226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2785  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 463 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 463 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0406486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 463 aa  207  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.264302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 463 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.609757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2101  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 463 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3976  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 		 464 aa  204  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0918  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 461 aa  203  5e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.494723 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 		 461 aa  203  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.579785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4517  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.99 
 
 		 448 aa  203  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.233298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3240  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 		 464 aa  203  6e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.399255  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3970  two component transcriptional regulator  33.74 
 
 		 466 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.241078  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0015  histidine kinase  31.77 
 
 		 468 aa  200  5e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9847  two component sensor kinase  31.9 
 
 		 457 aa  197  5.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5712  histidine kinase  32.97 
 
 		 483 aa  195  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4799  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.82 
 
 		 449 aa  195  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.414847 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3446  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 		 488 aa  194  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.406283  normal  0.729768 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3520  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 464 aa  193  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3772  normal  0.45373 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3128  sensor histidine kinase  33.84 
 
 		 465 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.850731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4109  histidine kinase  33.12 
 
 		 445 aa  191  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0091  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 		 413 aa  191  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.70693  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0849  Two-component sensor histidine kinase protein  35.87 
 
 		 445 aa  190  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0452928  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 499 aa  187  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158171  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3298  sensor histidine kinase  33.04 
 
 		 465 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251019  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1242  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.89 
 
 		 468 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4782  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 445 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0132314  unclonable  0.0000000151604 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2953  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 451 aa  182  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.131709 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03340  Signal transduction histidine kinase  31 
 
 		 468 aa  178  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 419 aa  178  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00301262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4391  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 		 407 aa  172  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.61651  decreased coverage  0.00000664271 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0282  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 		 411 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000209269 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3739  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 		 411 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0303484 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0283  ATPase domain-containing protein  36.15 
 
 		 411 aa  172  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143698  hitchhiker  0.000000382002 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3535  sensor histidine kinase  36.79 
 
 		 419 aa  171  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0398  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 		 418 aa  168  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.675232  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0891  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 		 499 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00459895  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0663  histidine kinase  29.65 
 
 		 499 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00720978  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4427  sensor histidine kinase  35.14 
 
 		 418 aa  166  9e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3744  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 472 aa  166  9e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4624  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 472 aa  166  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.587522 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0110  ATP-binding region, ATPase-like protein  38.14 
 
 		 415 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0050254  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0299  histidine kinase  34.92 
 
 		 418 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0295  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 		 418 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0287  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 		 418 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 		 418 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0660  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.11 
 
 		 461 aa  162  9e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0129  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 		 465 aa  160  5e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00105437  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  35.97 
 
 		 466 aa  159  7e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0418  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 		 472 aa  159  7e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.14 
 
 		 459 aa  159  9e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5680  histidine kinase  30.36 
 
 		 443 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.534084 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0301  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 458 aa  155  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1600  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.4 
 
 		 468 aa  154  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.298704  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1236  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.79 
 
 		 386 aa  154  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.493129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4530  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.41 
 
 		 386 aa  150  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  32.68 
 
 		 466 aa  147  6e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 469 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>