280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0719 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1015  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  59.56 
 
 		 556 aa  672    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.103701  normal  0.772735 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2346  putative electron transfer flavoprotein dehydrogenase  62.54 
 
 		 552 aa  722    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.398943  normal  0.0520477 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2208  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  62.27 
 
 		 551 aa  692    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2473  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  60.82 
 
 		 551 aa  699    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0824  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  60.11 
 
 		 556 aa  682    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5421  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  63.59 
 
 		 554 aa  689    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0428869  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2658  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  65.13 
 
 		 568 aa  729    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2708  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.22 
 
 		 554 aa  686    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.599219 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0942  putative electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  60.29 
 
 		 557 aa  696    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.367234  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1715  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  60.29 
 
 		 581 aa  697    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4203  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.63 
 
 		 560 aa  709    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1567  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  58.08 
 
 		 562 aa  669    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3686  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  56.61 
 
 		 553 aa  657    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.708418  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0621  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  66.67 
 
 		 563 aa  732    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.994915  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1116  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, putative  60.29 
 
 		 557 aa  696    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000360257  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3527  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.22 
 
 		 554 aa  694    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2167  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  68.34 
 
 		 557 aa  757    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.068758  normal  0.0582717 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1788  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  62.66 
 
 		 557 aa  705    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1994  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  60.65 
 
 		 551 aa  691    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1750  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  58.62 
 
 		 533 aa  675    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.109424 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0228  FAD dependent oxidoreductase:electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  57.89 
 
 		 547 aa  669    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1936  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  61.52 
 
 		 548 aa  705    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000473381  normal  0.135998 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1262  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  60.07 
 
 		 562 aa  697    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.12476  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2595  FAD dependent oxidoreductase  64.04 
 
 		 553 aa  735    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.399286 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1869  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  60.29 
 
 		 557 aa  696    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0418968  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4118  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  59.75 
 
 		 554 aa  685    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.186712  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1777  putative electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase precursor  61.18 
 
 		 551 aa  706    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.964971  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6873  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  62.48 
 
 		 557 aa  701    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.100379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4606  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  62.66 
 
 		 557 aa  703    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.142327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5364  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  62.48 
 
 		 557 aa  700    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.798054  normal  0.228806 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4247  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  63.31 
 
 		 557 aa  670    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.05315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0265  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  59.09 
 
 		 545 aa  676    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0224484  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3775  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.94 
 
 		 554 aa  707    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4100  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  63.02 
 
 		 549 aa  685    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0620  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  66.31 
 
 		 563 aa  730    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2613  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  59.93 
 
 		 557 aa  696    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1650  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.63 
 
 		 560 aa  709    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1084  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  60.04 
 
 		 552 aa  688    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.29604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1781  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  60.58 
 
 		 549 aa  680    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.420074  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0484  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.84 
 
 		 548 aa  717    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2269  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  58.92 
 
 		 587 aa  671    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.487157  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3018  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  58.74 
 
 		 572 aa  671    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0545377  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4163  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  58.74 
 
 		 572 aa  672    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1999  S6 modification enzyme RimK  60.83 
 
 		 545 aa  685    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.329248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4358  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  62.37 
 
 		 552 aa  692    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0903296  normal  0.0136742 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4310  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.81 
 
 		 566 aa  654    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.744462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0725  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.89 
 
 		 549 aa  717    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1895  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  58.26 
 
 		 591 aa  649    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0158  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.18 
 
 		 569 aa  663    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1362  electron transferring flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  60.84 
 
 		 557 aa  690    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.61271  normal  0.825058 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0378  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  60.66 
 
 		 563 aa  689    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0719  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  100 
 
 		 557 aa  1149    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2714  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  60.07 
 
 		 558 aa  685    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.95062  normal  0.490703 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5532  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  62.11 
 
 		 557 aa  699    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6767  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.93 
 
 		 557 aa  697    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1211  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.11 
 
 		 552 aa  698    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1612  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  58.17 
 
 		 551 aa  645    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.249988  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3218  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  64.4 
 
 		 580 aa  744    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1192  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.53 
 
 		 561 aa  643    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1146  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  58.97 
 
 		 561 aa  684    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0276165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1986  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.55 
 
 		 561 aa  668    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3745  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  64.44 
 
 		 549 aa  728    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1185  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  62.98 
 
 		 551 aa  706    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.068389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0979  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  62.11 
 
 		 557 aa  699    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.438928  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1554  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.93 
 
 		 557 aa  698    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935108  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2147  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.86 
 
 		 549 aa  659    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.962634  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0911  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  65.26 
 
 		 568 aa  737    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3268  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  63.67 
 
 		 563 aa  711    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.545567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1567  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.02 
 
 		 557 aa  703    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1439  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  62.11 
 
 		 557 aa  699    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0282  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.4 
 
 		 555 aa  659    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00443387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2188  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  67.26 
 
 		 557 aa  790    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1346  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.93 
 
 		 557 aa  695    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5772  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.93 
 
 		 557 aa  693    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.412443 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25840  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  62.45 
 
 		 551 aa  694    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0252767  normal  0.104283 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1461  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  62.11 
 
 		 557 aa  699    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6275  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.93 
 
 		 557 aa  698    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1386  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  62.11 
 
 		 557 aa  698    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4075  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  63.31 
 
 		 557 aa  704    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.556531  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4827  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  60.14 
 
 		 555 aa  696    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0425  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  64.26 
 
 		 548 aa  723    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3523  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.04 
 
 		 550 aa  642    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0649  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  65.6 
 
 		 554 aa  716    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.480515 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1472  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.01 
 
 		 550 aa  708    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00301285  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3139  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  59.03 
 
 		 568 aa  661    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.148772  normal  0.669387 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2374  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  66.67 
 
 		 557 aa  771    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.694979 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2679  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  59.17 
 
 		 561 aa  650    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3283  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  58.8 
 
 		 561 aa  645    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.856599 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1950  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  58.5 
 
 		 568 aa  675    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.477795 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1039  electron transfer flavoprotein-ubiquinone dehydrogenase  58.68 
 
 		 553 aa  669    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.245059  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1558  putative electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  60.29 
 
 		 557 aa  696    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000216807  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3981  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.76 
 
 		 566 aa  640    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0944928 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3075  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  62.25 
 
 		 549 aa  709    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.816418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2765  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.2 
 
 		 557 aa  694    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.126018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0219  putative electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  60.29 
 
 		 557 aa  696    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0829315  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2069  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  59.17 
 
 		 561 aa  659    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00388318 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0424  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  60.82 
 
 		 551 aa  704    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.349819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6919  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  62.11 
 
 		 556 aa  700    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2259  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.9 
 
 		 549 aa  647    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.581035 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1691  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  60.29 
 
 		 581 aa  697    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>