291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3075 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2167  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  63.54 
 
 
557 aa  681    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.068758  normal  0.0582717 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2374  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  60 
 
 
557 aa  695    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.694979 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0649  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  62.71 
 
 
554 aa  684    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.480515 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0620  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  61.08 
 
 
563 aa  687    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1091  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  63.62 
 
 
554 aa  709    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.358633 
 
 
-
 
NC_004310  BR0621  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  61.08 
 
 
563 aa  687    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.994915  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2595  FAD dependent oxidoreductase  58.79 
 
 
553 aa  673    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.399286 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1777  putative electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase precursor  78.83 
 
 
551 aa  885    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.964971  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3075  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  100 
 
 
549 aa  1134    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.816418  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1229  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.61 
 
 
552 aa  647    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1781  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.38 
 
 
549 aa  657    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.420074  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0484  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  82.15 
 
 
548 aa  931    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0444  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  58.65 
 
 
557 aa  636    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4358  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.61 
 
 
552 aa  644    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0903296  normal  0.0136742 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0725  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.36 
 
 
549 aa  638    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1392  electrotransfer ubiquinone oxidoreductase  64.72 
 
 
553 aa  721    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0719  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  62.25 
 
 
557 aa  720    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136312  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0942  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  63.99 
 
 
554 aa  734    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.589953  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6299  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  64.48 
 
 
549 aa  732    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1211  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.06 
 
 
552 aa  646    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3218  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  58.79 
 
 
580 aa  670    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3745  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  80 
 
 
549 aa  896    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0911  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  60.25 
 
 
568 aa  700    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2473  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  77.37 
 
 
551 aa  872    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.163  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2188  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  59.86 
 
 
557 aa  687    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2346  putative electron transfer flavoprotein dehydrogenase  59.89 
 
 
552 aa  686    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.398943  normal  0.0520477 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0425  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  75.27 
 
 
548 aa  841    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2658  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.08 
 
 
568 aa  689    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1039  electron transfer flavoprotein-ubiquinone dehydrogenase  56.31 
 
 
553 aa  668    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.245059  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0424  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  78.65 
 
 
551 aa  884    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.349819  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1084  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.15 
 
 
552 aa  632  1e-180  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.29604  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0942  putative electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  55.29 
 
 
557 aa  625  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.367234  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1715  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  55.29 
 
 
581 aa  626  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1116  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, putative  55.29 
 
 
557 aa  625  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000360257  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4075  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.55 
 
 
557 aa  628  1e-178  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.556531  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1869  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  55.29 
 
 
557 aa  625  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0418968  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4827  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.37 
 
 
555 aa  626  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1691  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  55.29 
 
 
581 aa  626  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1567  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.84 
 
 
557 aa  625  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1558  putative electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  55.29 
 
 
557 aa  625  1e-178  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000216807  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0219  putative electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  55.29 
 
 
557 aa  625  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0829315  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2613  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  55.11 
 
 
557 aa  623  1e-177  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3268  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.17 
 
 
563 aa  618  1e-176  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.545567  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0265  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.45 
 
 
545 aa  615  1e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0224484  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6076  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  57.3 
 
 
554 aa  615  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1185  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.71 
 
 
551 aa  617  1e-175  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.068389  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5772  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.02 
 
 
557 aa  617  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.412443 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1386  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.2 
 
 
557 aa  617  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5532  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.02 
 
 
557 aa  617  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2765  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.02 
 
 
557 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.126018  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1262  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.54 
 
 
562 aa  614  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.12476  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6873  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.66 
 
 
557 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.100379  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4606  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.84 
 
 
557 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.142327  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5421  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.3 
 
 
554 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0428869  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1362  electron transferring flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  55.84 
 
 
557 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.61271  normal  0.825058 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2714  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.72 
 
 
558 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.95062  normal  0.490703 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1554  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.02 
 
 
557 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935108  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1346  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.84 
 
 
557 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6275  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.02 
 
 
557 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6919  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.84 
 
 
556 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76503  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1439  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.84 
 
 
557 aa  611  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1788  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.66 
 
 
557 aa  610  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236528  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1936  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  54.08 
 
 
548 aa  610  1e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000473381  normal  0.135998 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0378  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.47 
 
 
563 aa  610  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0979  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.84 
 
 
557 aa  611  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.438928  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1461  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.84 
 
 
557 aa  611  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6767  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.84 
 
 
557 aa  611  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0228  FAD dependent oxidoreductase:electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  53.99 
 
 
547 aa  607  9.999999999999999e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4100  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.92 
 
 
549 aa  607  9.999999999999999e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5364  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.47 
 
 
557 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.798054  normal  0.228806 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1146  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  55.27 
 
 
561 aa  606  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0276165  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1750  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.76 
 
 
533 aa  605  9.999999999999999e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.109424 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1950  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.88 
 
 
568 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.477795 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4203  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  53.96 
 
 
560 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3775  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.32 
 
 
554 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1650  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  53.96 
 
 
560 aa  601  1e-170  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0158  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  53.79 
 
 
569 aa  600  1e-170  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1994  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  52.8 
 
 
551 aa  598  1e-169  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2069  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.64 
 
 
561 aa  595  1e-169  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00388318 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4453  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, putative  53.08 
 
 
549 aa  594  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4310  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.76 
 
 
566 aa  592  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.744462  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4767  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.19 
 
 
557 aa  592  1e-168  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0272  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  52.72 
 
 
549 aa  592  1e-168  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000698819 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3749  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  52.72 
 
 
549 aa  592  1e-168  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.986729  normal  0.0743978 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0273  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  52.72 
 
 
549 aa  592  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.134326  hitchhiker  0.000000385441 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3139  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.92 
 
 
568 aa  595  1e-168  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.148772  normal  0.669387 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0280  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  51.81 
 
 
549 aa  588  1e-167  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1751  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.56 
 
 
568 aa  588  1e-167  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3527  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  53.6 
 
 
554 aa  591  1e-167  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1999  S6 modification enzyme RimK  53.19 
 
 
545 aa  588  1e-167  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.329248  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0388  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  52.17 
 
 
549 aa  588  1e-167  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.817996  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2208  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  54.61 
 
 
551 aa  589  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25840  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  54.43 
 
 
551 aa  589  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0252767  normal  0.104283 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4403  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  52.54 
 
 
549 aa  589  1e-167  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273823 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0284  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  51.99 
 
 
549 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4121  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  53.08 
 
 
549 aa  590  1e-167  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00995  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  53.28 
 
 
544 aa  587  1e-166  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00336804  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4794  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  52.54 
 
 
549 aa  586  1e-166  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0795464  hitchhiker  0.00000316317 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1472  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  51.81 
 
 
550 aa  587  1e-166  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00301285  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0283  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  51.81 
 
 
549 aa  588  1e-166  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.440242  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>