More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0115 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0115  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 
244 aa  482  1e-135  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1899  uroporphyrin-III C-methyltransferase  86.42 
 
 
247 aa  419  1e-116  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.106927 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2251  uroporphyrin-III C-methyltransferase  74.49 
 
 
257 aa  360  1e-98  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.00937998  normal  0.18595 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1713  uroporphyrin-III C-methyltransferase  73.66 
 
 
248 aa  357  9.999999999999999e-98  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.116043 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  58.3 
 
 
248 aa  271  5.000000000000001e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.511728 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18851  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.49 
 
 
255 aa  199  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  49.19 
 
 
513 aa  198  7.999999999999999e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0457  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.76 
 
 
249 aa  195  5.000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000204102  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1787  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  44.49 
 
 
267 aa  193  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.159983  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18851  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.92 
 
 
267 aa  193  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1549  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.93 
 
 
258 aa  192  6e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1349  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.76 
 
 
258 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.758533  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1587  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.22 
 
 
258 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00363233  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3863  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.41 
 
 
258 aa  190  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.707668  hitchhiker  0.0000644403 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0407  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.48 
 
 
259 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19041  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.93 
 
 
267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.166851  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1481  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.92 
 
 
258 aa  189  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.8 
 
 
258 aa  187  9e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58633e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1335  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.8 
 
 
258 aa  187  9e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1308  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.8 
 
 
258 aa  187  9e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1445  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.8 
 
 
258 aa  187  9e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.51628  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1309  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.8 
 
 
258 aa  186  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0251  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.93 
 
 
490 aa  187  2e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1148  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.73 
 
 
258 aa  187  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.660594  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1124  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.24 
 
 
491 aa  186  4e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.219261  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2282  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  46.84 
 
 
264 aa  185  5e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1248  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  46.09 
 
 
520 aa  185  5e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.472521 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0051  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.74 
 
 
245 aa  185  7e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0142442  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3676  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.01 
 
 
272 aa  185  7e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2767  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.98 
 
 
503 aa  184  8e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2253  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.89 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal  0.0491456 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1290  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.22 
 
 
258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3559  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.41 
 
 
261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.895893  normal  0.323938 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0492  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.37 
 
 
246 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0343  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.08 
 
 
248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00230836  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2013  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.01 
 
 
283 aa  183  3e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.757619  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2375  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  47.86 
 
 
257 aa  182  5.0000000000000004e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.481294  normal  0.640366 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1682  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.4 
 
 
264 aa  181  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.577733 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2654  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45.57 
 
 
262 aa  181  7e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3111  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.8 
 
 
250 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1346  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.73 
 
 
511 aa  180  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.694338  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2603  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.22 
 
 
256 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.39 
 
 
512 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000123773  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1104  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.68 
 
 
275 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217718  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2492  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.07 
 
 
272 aa  179  4e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2922  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44 
 
 
260 aa  179  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.215743  normal  0.0409844 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2728  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.13 
 
 
277 aa  179  4.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1989  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  42.15 
 
 
246 aa  178  5.999999999999999e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.519237  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2189  uroporphyrin-III C-methyltransferase, putative  43.21 
 
 
259 aa  177  1e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1160  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.82 
 
 
473 aa  177  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.277445  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1546  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.13 
 
 
277 aa  177  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.746626  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18271  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.8 
 
 
261 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2286  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.48 
 
 
258 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2337  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.48 
 
 
258 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1175  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.88 
 
 
252 aa  177  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0224859 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1258  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.75 
 
 
508 aa  176  4e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.323904  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1443  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.28 
 
 
276 aa  175  7e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.224793  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.39 
 
 
505 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3656  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.17 
 
 
470 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3062  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.63 
 
 
512 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00105684  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3353  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.6 
 
 
504 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422788  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0796  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  44.81 
 
 
276 aa  173  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1616  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45.53 
 
 
475 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.512799  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  42.28 
 
 
473 aa  172  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  42.28 
 
 
473 aa  172  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1744  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.11 
 
 
263 aa  172  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  42.28 
 
 
470 aa  172  3.9999999999999995e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2837  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  42.15 
 
 
503 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1778  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.8 
 
 
250 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0293205  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29821  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.86 
 
 
261 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.564454 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2098  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.06 
 
 
253 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00176224  decreased coverage  0.00158802 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2207  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.23 
 
 
507 aa  169  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00880064  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3062  uroporphyrinogen-III methylase  42.86 
 
 
513 aa  169  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2093  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.58 
 
 
247 aa  169  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0878943  normal  0.0902648 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0322  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  43.22 
 
 
277 aa  169  5e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2236  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.77 
 
 
503 aa  168  6e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  42.32 
 
 
467 aa  168  8e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1761  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.08 
 
 
278 aa  168  9e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  42.49 
 
 
457 aa  168  9e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  42.49 
 
 
457 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.49 
 
 
457 aa  167  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  42.49 
 
 
457 aa  167  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03171  hypothetical protein  42.49 
 
 
457 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  42.49 
 
 
457 aa  167  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  42.49 
 
 
457 aa  167  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  42.49 
 
 
457 aa  167  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  42.49 
 
 
457 aa  167  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2052  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.67 
 
 
266 aa  166  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.754921 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1402  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.97 
 
 
261 aa  167  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.492452 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0687  hypothetical protein  42.19 
 
 
505 aa  165  5e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.943133  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0701  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.74 
 
 
504 aa  166  5e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  39.92 
 
 
516 aa  165  5.9999999999999996e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.325525 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0708  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.6 
 
 
464 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.7 
 
 
510 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3179  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  41.35 
 
 
264 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.525633  normal  0.911093 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0358  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.4 
 
 
510 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.2 
 
 
511 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3201  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.2 
 
 
519 aa  165  6.9999999999999995e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3562  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.18 
 
 
478 aa  165  8e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  42.19 
 
 
462 aa  165  8e-40  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>