25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3181 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3181  hypothetical protein  100 
 
 		 446 aa  906    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1673  hypothetical protein  39.55 
 
 		 446 aa  337  2.9999999999999997e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27195  normal  0.595527 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0146  hypothetical protein  37.61 
 
 		 439 aa  270  4e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0669  hypothetical protein  38.64 
 
 		 439 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0171669 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0371  hypothetical protein  36.56 
 
 		 457 aa  265  1e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.294814  normal  0.553229 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0418  membrane-fusion protein  38.43 
 
 		 436 aa  257  3e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0478  hypothetical protein  36.14 
 
 		 436 aa  252  8.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0389  hypothetical protein  35.68 
 
 		 439 aa  246  8e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.478293  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1154  hypothetical protein  32.48 
 
 		 490 aa  241  1e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0568  hypothetical protein  34.09 
 
 		 442 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0299  hypothetical protein  30.91 
 
 		 450 aa  233  4.0000000000000004e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.251177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0473  hypothetical protein  33.94 
 
 		 442 aa  233  5e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.796891  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0680  hypothetical protein  34.79 
 
 		 451 aa  231  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3073  hypothetical protein  33.11 
 
 		 448 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0908  hypothetical protein  36.49 
 
 		 451 aa  223  7e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2055  hypothetical protein  33.89 
 
 		 442 aa  202  8e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3740  HlyD family secretion protein  31 
 
 		 441 aa  183  6e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5410  hypothetical protein  29.89 
 
 		 449 aa  178  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288703  normal  0.36048 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1408  membrane-fusion protein-like  22.56 
 
 		 631 aa  57  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.382309  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2177  GAF domain-containing protein  27.44 
 
 		 611 aa  53.1  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266529 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3236  GAF domain-containing protein  23.86 
 
 		 578 aa  47.4  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2611  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.21 
 
 		 549 aa  45.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0619  M50 family peptidase  25.81 
 
 		 715 aa  45.8  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06917  hypothetical protein  29.07 
 
 		 356 aa  45.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3803  RND family efflux transporter MFP subunit  29.94 
 
 		 376 aa  43.1  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>