189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3031 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_3031  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  100 
 
 
336 aa  692    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.857502  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4580  putative D-cysteine desulfhydrase  50.33 
 
 
319 aa  283  3.0000000000000004e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0753  D-cysteine desulfhydrase, PLP-dependent enzyme  43.83 
 
 
318 aa  250  3e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0431  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  41.67 
 
 
311 aa  244  1.9999999999999999e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1391  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.58 
 
 
306 aa  243  3e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.321363 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1912  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase-like protein  41.24 
 
 
302 aa  242  5e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1372  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  40.38 
 
 
307 aa  239  4e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0288734 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1781  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase-like protein  42.76 
 
 
312 aa  232  6e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3479  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  44.7 
 
 
302 aa  229  7e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03343  putative D-cysteine desulfhydrase  38.05 
 
 
307 aa  218  8.999999999999998e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2577  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  44.67 
 
 
287 aa  210  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00640  putative D-cysteine desulfhydrase (DcyD)  41.54 
 
 
289 aa  208  1e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1895  putative D-cysteine desulfhydrase (DcyD)  39.18 
 
 
310 aa  205  7e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0834874 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5444  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  37.63 
 
 
310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1914  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  43.4 
 
 
304 aa  199  7.999999999999999e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0953  putative D-cysteine desulfhydrase, DcyD  40.84 
 
 
314 aa  195  8.000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561188  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6027  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  40.45 
 
 
259 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.581609  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1730  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  39 
 
 
325 aa  182  5.0000000000000004e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24190  putative 1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  36.63 
 
 
310 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0268894  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1217  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.6 
 
 
290 aa  170  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.6801  normal  0.977815 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2947  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase-like protein  37.5 
 
 
314 aa  156  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.271855 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1541  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  34.78 
 
 
297 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.974247  normal  0.412213 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1569  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  35.45 
 
 
299 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.836174  normal  0.209686 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3733  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase-like protein  34.77 
 
 
297 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2009  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase, putative  34.45 
 
 
297 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.336209  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2048  ACC deaminase/D-cysteine desulfhydrase family protein  35.97 
 
 
310 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0600526  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3686  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase, putative  34.88 
 
 
312 aa  149  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1676  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase, putative  32.67 
 
 
314 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.334967  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3802  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase, putative  31.68 
 
 
314 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1404  D-cysteine desulfhydrase  31.01 
 
 
337 aa  129  7.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1802  D-cysteine desulfhydrase  30.7 
 
 
337 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.729924  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1185  pyridoxal phosphate-dependent enzymes, D-cysteine desulfhydrase family  30.92 
 
 
332 aa  127  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0389534  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1663  D-cysteine desulfhydrase  31.97 
 
 
336 aa  126  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000049313  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1784  D-cysteine desulfhydrase  29.75 
 
 
332 aa  125  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181648  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0723  D-cysteine desulfhydrase  29.84 
 
 
312 aa  124  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000361727  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0699  D-cysteine desulfhydrase  29.84 
 
 
312 aa  124  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000108217  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2162  D-cysteine desulfhydrase, PLP-dependent enzyme  29.71 
 
 
312 aa  123  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0392224 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1301  D-cysteine desulfhydrase  29.52 
 
 
336 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166023  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3180  D-cysteine desulfhydrase  29.81 
 
 
333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.526016  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2515  D-cysteine desulfhydrase  30.96 
 
 
340 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0413  D-cysteine desulfhydrase  28.42 
 
 
334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.486407  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0406  D-cysteine desulfhydrase  28.42 
 
 
334 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1727  pyridoxal phosphate-dependent enzymes, D-cysteine desulfhydrase family  27.76 
 
 
328 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00524906  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1263  D-cysteine desulfhydrase  27.76 
 
 
328 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0547515  normal  0.0193238 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2666  D-cysteine desulfhydrase  27.62 
 
 
330 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1836  D-cysteine desulfhydrase  28.01 
 
 
332 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1720  D-cysteine desulfhydrase  27.76 
 
 
328 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.628209 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2153  D-cysteine desulfhydrase  27.76 
 
 
342 aa  107  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0177604  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2693  D-cysteine desulfhydrase  27.76 
 
 
328 aa  107  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.102426  normal  0.0614251 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1047  D-cysteine desulfhydrase  27.76 
 
 
328 aa  107  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.106931  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1604  D-cysteine desulfhydrase  26.28 
 
 
340 aa  106  5e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.033923  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2018  D-cysteine desulfhydrase  28.35 
 
 
328 aa  106  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0820004  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1290  D-cysteine desulfhydrase  28.35 
 
 
328 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000290271 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2115  D-cysteine desulfhydrase  28.35 
 
 
328 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000146031 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2168  D-cysteine desulfhydrase  28.35 
 
 
328 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.406051  hitchhiker  0.0000160197 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1167  D-cysteine desulfhydrase  28.35 
 
 
328 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2109  D-cysteine desulfhydrase  28.35 
 
 
328 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.497431  normal  0.0120182 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2930  D-cysteine desulfhydrase  27.6 
 
 
331 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.398699  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3263  D-cysteine desulfhydrase  27.19 
 
 
331 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.374487  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1828  D-cysteine desulfhydrase  25.96 
 
 
340 aa  103  5e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3235  D-cysteine desulfhydrase  25.63 
 
 
331 aa  103  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2581  D-cysteine desulfhydrase  26.8 
 
 
333 aa  103  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.525939  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_3183  predicted protein  28.04 
 
 
327 aa  102  6e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0144015  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1432  D-cysteine desulfhydrase  29.93 
 
 
340 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.189366  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2030  D-cysteine desulfhydrase  28.71 
 
 
339 aa  102  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2377  D-cysteine desulfhydrase  28.71 
 
 
339 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2275  D-cysteine desulfhydrase  28.71 
 
 
330 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3241  D-cysteine desulfhydrase  27.27 
 
 
331 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5266  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, D- cysteine desulfhydrase family  26.81 
 
 
337 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3261  D-cysteine desulfhydrase  26.64 
 
 
331 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.238478  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2992  D-cysteine desulfhydrase  26.56 
 
 
331 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0245  D-cysteine desulfhydrase  27.66 
 
 
334 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.944644  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2011  D-cysteine desulfhydrase  26.95 
 
 
331 aa  100  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2951  D-cysteine desulfhydrase  27.27 
 
 
331 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.851709  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3005  D-cysteine desulfhydrase  26.56 
 
 
331 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0310  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  25.83 
 
 
335 aa  100  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3236  D-cysteine desulfhydrase  26.56 
 
 
331 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.387589  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2428  D-cysteine desulfhydrase  29.93 
 
 
340 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.551753  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4875  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  25.48 
 
 
331 aa  99  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338198  normal  0.0605398 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2937  D-cysteine desulfhydrase  25.23 
 
 
330 aa  99  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1439  D-cysteine desulfhydrase  26.13 
 
 
347 aa  97.8  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.457826  normal  0.632152 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2397  D-cysteine desulfhydrase  28.42 
 
 
337 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0339  D-cysteine desulfhydrase  27.46 
 
 
333 aa  97.8  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0969391  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0604  D-cysteine desulfhydrase  28.47 
 
 
332 aa  97.1  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2506  D-cysteine desulfhydrase  27.22 
 
 
361 aa  96.3  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.119507  normal  0.820205 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5179  pyridoxal phosphate-dependent deaminase, putative  28.62 
 
 
332 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5055  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  26.28 
 
 
331 aa  95.5  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0798685  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5397  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  25.54 
 
 
338 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0993744  normal  0.0379152 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4127  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  23.78 
 
 
339 aa  94  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.407958 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2010  D-cysteine desulfhydrase  25.72 
 
 
334 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.152874  decreased coverage  0.00891545 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0359  D-cysteine desulfhydrase  28.3 
 
 
332 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5856  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  24.69 
 
 
337 aa  92  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0688511  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5405  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  24.15 
 
 
338 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.828504 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0767  D-cysteine desulfhydrase  29.89 
 
 
322 aa  90.9  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0197666  hitchhiker  0.00499995 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6848  D-cysteine desulfhydrase  25.16 
 
 
342 aa  90.1  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.368469 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1212  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  24.46 
 
 
338 aa  89.7  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0968144  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0934  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  29.11 
 
 
338 aa  89.7  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4164  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  25.59 
 
 
339 aa  89  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3598  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  25.78 
 
 
338 aa  88.6  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.73002 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5479  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  24.07 
 
 
337 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0709789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>