More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4284 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_4284  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  100 
 
 		 408 aa  836    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.626941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1259  Alanine dehydrogenase  53.89 
 
 		 405 aa  451  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2439  pyridine nucleotide transhydrogenase, alpha subunit  55.12 
 
 		 382 aa  426  1e-118  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2994  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  49.87 
 
 		 403 aa  414  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0579773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4962  Alanine dehydrogenase  49.62 
 
 		 408 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.699914 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10273  alanine dehydrogenase  51.54 
 
 		 399 aa  407  1.0000000000000001e-112  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2909  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  51.43 
 
 		 399 aa  397  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.499459  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0465  alanine dehydrogenase  46.65 
 
 		 406 aa  378  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1939  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  43.8 
 
 		 390 aa  335  1e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0627  alanine dehydrogenase  41.1 
 
 		 411 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0875  L-alanine dehydrogenase  41.27 
 
 		 406 aa  310  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0767  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  40.51 
 
 		 403 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0761  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  40.97 
 
 		 406 aa  306  6e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.716267 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2150  Alanine dehydrogenase  40.85 
 
 		 406 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1700  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  41.48 
 
 		 406 aa  301  1e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000678625 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1878  alanine dehydrogenase  42.09 
 
 		 377 aa  297  2e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1049  alanine dehydrogenase  38.71 
 
 		 374 aa  268  1e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0104  alanine dehydrogenase  38.86 
 
 		 374 aa  268  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2087  L-alanine dehydrogenase  37 
 
 		 371 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2104  L-alanine dehydrogenase  37 
 
 		 371 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364817  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  37.1 
 
 		 372 aa  266  4e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2150  L-alanine dehydrogenase  37 
 
 		 371 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2698  alanine dehydrogenase  36.83 
 
 		 373 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2355  alanine dehydrogenase  37.06 
 
 		 371 aa  264  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470205 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1765  alanine dehydrogenase  37.13 
 
 		 372 aa  263  3e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1800  alanine dehydrogenase  37.13 
 
 		 372 aa  263  3e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3222  L-alanine dehydrogenase  39.57 
 
 		 372 aa  259  7e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0766245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2170  alanine dehydrogenase  37.91 
 
 		 369 aa  257  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.443019  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1288  L-alanine dehydrogenase  38.46 
 
 		 372 aa  257  3e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.109562  normal  0.0699401 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1557  alanine dehydrogenase  36.9 
 
 		 372 aa  256  4e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4741  alanine dehydrogenase  35.22 
 
 		 377 aa  255  9e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0509  alanine dehydrogenase  36.1 
 
 		 377 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153171  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2068  alanine dehydrogenase  38.44 
 
 		 371 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347962  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0504  alanine dehydrogenase  35.22 
 
 		 377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4731  alanine dehydrogenase  35.48 
 
 		 377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4758  alanine dehydrogenase  35.22 
 
 		 377 aa  253  3e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4521  alanine dehydrogenase  35.22 
 
 		 377 aa  253  3e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.693738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4357  alanine dehydrogenase  35.22 
 
 		 377 aa  253  3e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4368  alanine dehydrogenase  35.22 
 
 		 377 aa  253  3e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103175  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4873  alanine dehydrogenase  35.22 
 
 		 377 aa  253  3e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4752  alanine dehydrogenase  35.22 
 
 		 377 aa  253  3e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000212885  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0906  L-alanine dehydrogenase  38.12 
 
 		 367 aa  254  3e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4453  alanine dehydrogenase  35.48 
 
 		 377 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0857625  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3299  alanine dehydrogenase  35.22 
 
 		 377 aa  252  1e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4017  alanine dehydrogenase  38.07 
 
 		 371 aa  251  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737201 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3512  alanine dehydrogenase  37.7 
 
 		 377 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0055  L-alanine dehydrogenase  37.53 
 
 		 373 aa  249  4e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.161285  normal  0.147991 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0505  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  35.56 
 
 		 377 aa  249  8e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0484986  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4707  alanine dehydrogenase  35.56 
 
 		 377 aa  249  8e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.394656 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0659  alanine dehydrogenase  35.56 
 
 		 377 aa  249  9e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0561  alanine dehydrogenase  35.56 
 
 		 377 aa  249  9e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0503  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  35.56 
 
 		 377 aa  249  9e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0592  alanine dehydrogenase  35.56 
 
 		 377 aa  249  9e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0720  alanine dehydrogenase  35.56 
 
 		 377 aa  249  9e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0649  alanine dehydrogenase  35.56 
 
 		 377 aa  249  9e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197457 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0416  alanine dehydrogenase  35.05 
 
 		 390 aa  248  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.533057  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1995  L-alanine dehydrogenase  36.83 
 
 		 371 aa  248  1e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12793  secreted L-alanine dehydrogenase ald (40 kDa antigen)  34.88 
 
 		 371 aa  247  3e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74924 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1961  L-alanine dehydrogenase  37.53 
 
 		 371 aa  247  3e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000331426  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2015  L-alanine dehydrogenase  37.53 
 
 		 371 aa  247  3e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000641536  normal  0.0233457 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2048  L-alanine dehydrogenase  37.53 
 
 		 371 aa  247  3e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000213241  hitchhiker  0.00195154 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3605  alanine dehydrogenase  36.19 
 
 		 371 aa  247  3e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  37.17 
 
 		 372 aa  246  4e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0506  alanine dehydrogenase  35.83 
 
 		 377 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4356  alanine dehydrogenase  34.96 
 
 		 379 aa  246  6e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.80752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3804  alanine dehydrogenase  35.87 
 
 		 366 aa  246  6.999999999999999e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1520  alanine dehydrogenase  36.29 
 
 		 371 aa  246  6.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0484059  hitchhiker  0.000320344 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0630  alanine dehydrogenase  35.29 
 
 		 377 aa  245  8e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.936299  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1176  alanine dehydrogenase  36.59 
 
 		 371 aa  246  8e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5016  alanine dehydrogenase  38.13 
 
 		 372 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0921868 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0663  alanine dehydrogenase and pyridine nucleotide transhydrogenase  35.83 
 
 		 367 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0662308 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2325  alanine dehydrogenase  37.06 
 
 		 371 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0022  alanine dehydrogenase  34.4 
 
 		 372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1131  alanine dehydrogenase  36.76 
 
 		 370 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2565  Alanine dehydrogenase  35.26 
 
 		 371 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.502023 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2189  alanine dehydrogenase  36.99 
 
 		 371 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000553576  normal  0.0277936 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1155  alanine dehydrogenase  34.7 
 
 		 373 aa  243  6e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0320425  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1670  L-alanine dehydrogenase  35.36 
 
 		 371 aa  242  7e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.379169  hitchhiker  0.00928718 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2154  alanine dehydrogenase  36.99 
 
 		 371 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000415402  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2217  alanine dehydrogenase  36.71 
 
 		 371 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174643  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1099  L-alanine dehydrogenase  36.07 
 
 		 365 aa  241  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.305636  hitchhiker  0.000729988 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2630  alanine dehydrogenase  40.71 
 
 		 370 aa  241  2e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0012805  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1770  alanine dehydrogenase  36.99 
 
 		 370 aa  241  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000379801  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0203  alanine dehydrogenase  34.5 
 
 		 370 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193787  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2013  alanine dehydrogenase  36.16 
 
 		 371 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000175382  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1930  alanine dehydrogenase  36.44 
 
 		 376 aa  240  4e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.275818  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2109  L-alanine dehydrogenase  37.1 
 
 		 370 aa  240  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1847  alanine dehydrogenase  37.1 
 
 		 370 aa  239  5e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3119  alanine dehydrogenase  36.1 
 
 		 371 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1743  alanine dehydrogenase  34.42 
 
 		 371 aa  239  9e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.359397  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0822  alanine dehydrogenase  36.93 
 
 		 371 aa  238  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.709879 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1767  alanine dehydrogenase  37.1 
 
 		 370 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1368  alanine dehydrogenase  35.91 
 
 		 372 aa  237  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3131  alanine dehydrogenase  35.29 
 
 		 371 aa  237  4e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0048846  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1068  alanine dehydrogenase  34.44 
 
 		 371 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0568  alanine dehydrogenase  39.88 
 
 		 376 aa  235  9e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2292  alanine dehydrogenase  34.71 
 
 		 365 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1797  L-alanine dehydrogenase  36.99 
 
 		 371 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.297694 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1609  alanine dehydrogenase  37.73 
 
 		 363 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1635  alanine dehydrogenase  37.73 
 
 		 363 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.348616  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>