64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2926 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2926  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  817    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.812191  hitchhiker  0.000139992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4599  hypothetical protein  41.84 
 
 		 393 aa  303  3.0000000000000004e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107377  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13168  hypothetical protein  41.94 
 
 		 396 aa  301  2e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2262  hypothetical protein  38.83 
 
 		 396 aa  257  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.237582  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3389  hypothetical protein  39.15 
 
 		 399 aa  249  4e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.121637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4993  hypothetical protein  38.21 
 
 		 408 aa  248  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.513988 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1929  hypothetical protein  38.27 
 
 		 383 aa  238  1e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0557173  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2182  hypothetical protein  32.8 
 
 		 401 aa  204  2e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0324  SAM-dependent methyltransferase  31.84 
 
 		 431 aa  197  3e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.71025  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2822  hypothetical protein  31.44 
 
 		 420 aa  190  4e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2587  hypothetical protein  31.11 
 
 		 444 aa  186  7e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0026  hypothetical protein  31.41 
 
 		 433 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2452  hypothetical protein  31.07 
 
 		 402 aa  180  4e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.280378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2423  hypothetical protein  28.57 
 
 		 419 aa  176  7e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0021  hypothetical protein  29.55 
 
 		 399 aa  172  6.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0629415  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2063  hypothetical protein  30.1 
 
 		 417 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1098  hypothetical protein  32.01 
 
 		 407 aa  147  3e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.697484 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0077  hypothetical protein  26.11 
 
 		 392 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3266  hypothetical protein  26.64 
 
 		 399 aa  67.8  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0634  hypothetical protein  24.33 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4454  hypothetical protein  24.92 
 
 		 407 aa  65.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2590  hypothetical protein  26.39 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.709956  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2934  hypothetical protein  25.1 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0971  hypothetical protein  26.32 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2351  hypothetical protein  23.81 
 
 		 407 aa  56.6  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175675  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3648  hypothetical protein  25.66 
 
 		 388 aa  55.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2888  hypothetical protein  24.36 
 
 		 414 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00389281  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2375  hypothetical protein  36.36 
 
 		 199 aa  53.1  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0161405  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1860  hypothetical protein  22.19 
 
 		 412 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181101  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1841  hypothetical protein  22.19 
 
 		 369 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1907  hypothetical protein  22.19 
 
 		 412 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13053  hypothetical protein  22.83 
 
 		 358 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0682  hypothetical protein  25.91 
 
 		 418 aa  50.8  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601703  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2598  hypothetical protein  22.98 
 
 		 411 aa  50.8  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000882332 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1249  Methyltransferase type 11  28.26 
 
 		 385 aa  50.4  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.419487  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6063  hypothetical protein  23.67 
 
 		 383 aa  50.1  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4268  hypothetical protein  24.12 
 
 		 372 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0734  hypothetical protein  21.24 
 
 		 396 aa  47  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.386022  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1415  SAM-dependent methyltransferase-like protein  21.55 
 
 		 288 aa  47.4  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418397  normal  0.0960542 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1663  hypothetical protein  25.1 
 
 		 396 aa  46.6  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4259  hypothetical protein  25 
 
 		 415 aa  46.2  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4027  hypothetical protein  24.57 
 
 		 428 aa  46.2  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29160  hypothetical protein  25.28 
 
 		 438 aa  46.2  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3424  23S rRNA methyluridine methyltransferase  31.78 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3619  23S rRNA methyluridine methyltransferase  31.78 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.934094 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0146  putative SAM dependent methyltransferase  29.69 
 
 		 381 aa  45.8  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1544  RNA methyltransferase  36.25 
 
 		 435 aa  45.8  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.144945  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28440  hypothetical protein  22.33 
 
 		 399 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1783  RNA methyltransferase  33.73 
 
 		 446 aa  45.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0868  23S rRNA methyluridine methyltransferase  31.78 
 
 		 390 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3496  23S rRNA methyluridine methyltransferase  31.78 
 
 		 390 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0151  SAM dependent methyltransferase, putative  28.91 
 
 		 381 aa  44.7  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2446  methyltransferase  27.43 
 
 		 357 aa  44.3  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.949706  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00281  N6-adenine-specific methylase  31.58 
 
 		 199 aa  44.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2600  hypothetical protein  22.25 
 
 		 423 aa  44.7  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.590151  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1350  hypothetical protein  29.49 
 
 		 244 aa  44.3  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.656837  hitchhiker  0.0000326001 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002137  ribosomal RNA small subunit methyltransferase D  31.58 
 
 		 199 aa  44.3  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1152  hypothetical protein  23.94 
 
 		 388 aa  43.9  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  29.89 
 
 		 460 aa  43.9  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1409  protein of unknown function Met10  32.39 
 
 		 394 aa  43.5  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0994  RNA methyltransferase, TrmA family  32.1 
 
 		 457 aa  43.5  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0980  23S rRNA methyluridine methyltransferase  35.16 
 
 		 382 aa  43.1  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1035  23S rRNA methyluridine methyltransferase  28.46 
 
 		 375 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0987  23S rRNA methyluridine methyltransferase  28.46 
 
 		 375 aa  43.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197479  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>