23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0961 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0961  hypothetical protein  100 
 
 		 645 aa  1321    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.600462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4527  heparinase II/III family protein  34.47 
 
 		 646 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0598567 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2452  hypothetical protein  34.11 
 
 		 649 aa  373  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4959  hypothetical protein  34.41 
 
 		 644 aa  364  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5870  Heparinase II/III family protein  32.59 
 
 		 649 aa  346  6e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5337  Heparinase II/III family protein  35.46 
 
 		 597 aa  295  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5054  Heparinase II/III family protein  34.7 
 
 		 598 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21320  hypothetical protein  31.39 
 
 		 660 aa  270  8e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.12083  normal  0.0898044 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3564  heparinase II/III family protein  30.15 
 
 		 623 aa  266  1e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7349  hypothetical protein  32.53 
 
 		 601 aa  262  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29060  hypothetical protein  29.08 
 
 		 676 aa  248  2e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3868  Heparinase II/III family protein  27.63 
 
 		 628 aa  203  9e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103442  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2009  hypothetical protein  30.04 
 
 		 581 aa  168  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.077757 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0131  hypothetical protein  28.49 
 
 		 566 aa  151  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3961  hypothetical protein  22.61 
 
 		 647 aa  99  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.104475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2603  hypothetical protein  23.57 
 
 		 637 aa  95.9  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3390  coagulation factor 5/8 type domain protein  23.88 
 
 		 1246 aa  80.5  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.032281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3391  Heparinase II/III family protein  25.08 
 
 		 618 aa  69.7  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0366049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2455  Heparinase II/III family protein  23.97 
 
 		 628 aa  61.2  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2654  hypothetical protein  21.74 
 
 		 847 aa  57.8  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.246589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1685  hypothetical protein  22.76 
 
 		 629 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.238249  normal  0.0538261 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3947  thr operon leader peptide  20.62 
 
 		 624 aa  54.7  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1459  Heparinase II/III family protein  21.67 
 
 		 626 aa  52.4  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.230111  normal  0.696506 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>