31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0251 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0251  WxcM domain protein domain protein  100 
 
 		 127 aa  266  5e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3416  WxcM domain protein  54.17 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0289  WxcM domain protein  48.33 
 
 		 135 aa  134  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.213456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0404  WxcM domain protein  48.31 
 
 		 124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.461118 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3028  WxcM domain-containing protein  45.38 
 
 		 143 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.437654  normal  0.160839 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1550  WxcM domain protein  47.93 
 
 		 122 aa  113  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1784  WxcM domain protein  44.17 
 
 		 134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1400  WxcM domain-containing protein  44.35 
 
 		 132 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1300  WxcM domain protein domain protein  43.1 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2659  WxcM-like protein  42.37 
 
 		 304 aa  99.4  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2242  WxcM domain-containing protein  41.74 
 
 		 130 aa  94.7  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0636  WxcM domain protein  38.79 
 
 		 136 aa  92  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.72572 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3930  WxcM domain-containing protein  40.52 
 
 		 317 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.505027  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0690  WxcM-like  44.55 
 
 		 313 aa  91.7  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00207  NDP-hexose isomerase  40.87 
 
 		 143 aa  92  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0692  WxcM domain-containing protein  38.46 
 
 		 315 aa  89.7  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1238  WxcM-like  41.88 
 
 		 312 aa  90.1  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219256  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1699  WxcM domain-containing protein  40 
 
 		 136 aa  87  8e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00150  hypothetical protein  36.75 
 
 		 138 aa  86.7  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2772  WxcM domain-containing protein  39.17 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522279 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3191  WxcM domain-containing protein  40.17 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1070  lipopolysaccharide biosynthesis protein  36.75 
 
 		 316 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710053  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1424  hypothetical protein  39.18 
 
 		 138 aa  84.3  6e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2940  WxcM domain protein  41.74 
 
 		 145 aa  84  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1289  WxcM domain-containing protein  38.79 
 
 		 138 aa  83.6  9e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1609  WxcM domain protein  37.61 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.875347  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1324  WxcM-like protein  35.9 
 
 		 309 aa  82  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2309  WxcM domain-containing protein  37.84 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.132972 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3422  WxcM-like  39.66 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0396977  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1190  WxcM domain-containing protein  33.91 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.432823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2509  hypothetical protein  34.34 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>