More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3989 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3989  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 		 374 aa  752    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1031  Ppx/GppA phosphatase  75.8 
 
 		 378 aa  546  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1413  Ppx/GppA phosphatase  75.53 
 
 		 378 aa  545  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.899781  normal  0.999952 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2771  putative exopolyphosphatase  75.27 
 
 		 378 aa  543  1e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.571811  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1183  Ppx/GppA phosphatase  73.37 
 
 		 370 aa  524  1e-148  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1673  phosphatase  76.04 
 
 		 393 aa  511  1e-144  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.131499  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1980  Ppx/GppA phosphatase  67.35 
 
 		 393 aa  494  9.999999999999999e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.307298 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1166  Ppx/GppA phosphatase  43.01 
 
 		 446 aa  286  5.999999999999999e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0471  Ppx/GppA phosphatase  47.98 
 
 		 413 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3811  Ppx/GppA phosphatase  43.41 
 
 		 504 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000504204  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0685  Ppx/GppA family phosphatase  43.94 
 
 		 498 aa  273  3e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0641  Ppx/GppA family phosphatase  43.94 
 
 		 498 aa  273  3e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0251449  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3629  Ppx/GppA phosphatase  44.31 
 
 		 380 aa  265  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67253  normal  0.0833507 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0427  Ppx/GppA phosphatase  45.83 
 
 		 520 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1516  Ppx/GppA phosphatase  45.81 
 
 		 376 aa  264  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219937  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3433  Ppx/GppA phosphatase  44.31 
 
 		 375 aa  263  3e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.513976 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3742  Ppx/GppA phosphatase  44.31 
 
 		 375 aa  263  4e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535373  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0472  Ppx/GppA phosphatase  45.51 
 
 		 433 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0888  exopolyphosphatase  44.54 
 
 		 603 aa  261  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00574973  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0659  Ppx/GppA phosphatase  44.04 
 
 		 367 aa  261  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3082  Ppx/GppA phosphatase  40.96 
 
 		 366 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417724  normal  0.0483754 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0372  Ppx/GppA phosphatase  45.3 
 
 		 509 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2550  Ppx/GppA phosphatase  42.94 
 
 		 331 aa  259  6e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0836  Ppx/GppA phosphatase  44.61 
 
 		 441 aa  258  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0246  Ppx/GppA phosphatase  44.06 
 
 		 399 aa  256  5e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.944048  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1331  Ppx/GppA phosphatase  43.36 
 
 		 389 aa  256  7e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2151  Ppx/GppA phosphatase  42.57 
 
 		 355 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0142  Ppx/GppA phosphatase  44.41 
 
 		 360 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279399  normal  0.170586 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2210  Ppx/GppA phosphatase  42.57 
 
 		 375 aa  253  3e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0781544  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0473  Ppx/GppA phosphatase  42.43 
 
 		 435 aa  253  4.0000000000000004e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1927  Ppx/GppA phosphatase  43.1 
 
 		 378 aa  252  9.000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2489  Ppx/GppA phosphatase  41.97 
 
 		 355 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.552862  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3596  Ppx/GppA phosphatase  40.71 
 
 		 357 aa  249  4e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137051  normal  0.0418911 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1170  Ppx/GppA phosphatase  42.34 
 
 		 373 aa  247  2e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.854732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2258  Ppx/GppA phosphatase  43.27 
 
 		 325 aa  245  8e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.613366 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3197  Ppx/GppA phosphatase  43.7 
 
 		 358 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.366219  normal  0.365881 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4719  Ppx/GppA phosphatase  44.25 
 
 		 355 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0584151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2753  Ppx/GppA phosphatase  40.34 
 
 		 363 aa  233  5e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363903  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0093  Ppx/GppA phosphatase  39.71 
 
 		 377 aa  213  3.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0904257  normal  0.209158 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2012  Ppx/GppA phosphatase  37.39 
 
 		 364 aa  208  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00540  Exopolyphosphatase  28.92 
 
 		 305 aa  126  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000336687  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0810  Ppx/GppA phosphatase  28.75 
 
 		 305 aa  124  3e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.11092  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0132  Ppx/GppA phosphatase  30.9 
 
 		 311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0238  Ppx/GppA phosphatase  25.99 
 
 		 300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.218725  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1965  exopolyphosphatase  28.77 
 
 		 549 aa  118  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.363541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4014  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  32.24 
 
 		 498 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1566  polyPpx/GppA family phosphatase  29.61 
 
 		 308 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000258002  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0123  Ppx/GppA phosphatase  28.87 
 
 		 296 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1573  Ppx/GppA phosphatase  33.85 
 
 		 505 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0912  Ppx/GppA phosphatase  32.37 
 
 		 330 aa  114  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.694762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4206  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  31.94 
 
 		 498 aa  114  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1739  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  30.09 
 
 		 532 aa  114  4.0000000000000004e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22047  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04581  putative exopolyphosphatase  30.03 
 
 		 539 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1953  Ppx/GppA phosphatase  28.87 
 
 		 491 aa  112  8.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0404  Ppx/GppA phosphatase  30.59 
 
 		 505 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01029  exopolyphosphatase  27.83 
 
 		 501 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0474  Ppx/GppA phosphatase  27.11 
 
 		 508 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  28.12 
 
 		 513 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004382  exopolyphosphatase  27.33 
 
 		 501 aa  110  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0226  Ppx/GppA phosphatase  28.53 
 
 		 326 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000460775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3530  Ppx/GppA phosphatase  26.84 
 
 		 550 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.984084 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0090  Ppx/GppA phosphatase  26.75 
 
 		 288 aa  109  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05201  putative exopolyphosphatase  26.22 
 
 		 531 aa  109  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2062  Ppx/GppA phosphatase  31.1 
 
 		 300 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06591  putative exopolyphosphatase  29.91 
 
 		 548 aa  109  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2413  Ppx/GppA phosphatase  27.49 
 
 		 501 aa  108  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.58803  hitchhiker  0.0004512 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03154  putative exopolyphosphatase  28.66 
 
 		 520 aa  108  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  24.48 
 
 		 513 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2154  Ppx/GppA phosphatase  30.18 
 
 		 300 aa  107  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0667  Ppx/GppA phosphatase family protein  31.35 
 
 		 568 aa  107  4e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1179  Ppx/GppA phosphatase  24.92 
 
 		 507 aa  106  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0508  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  29.22 
 
 		 498 aa  106  8e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.577686  normal  0.0821648 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4037  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  29.22 
 
 		 498 aa  106  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.868911  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0177  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  29.22 
 
 		 498 aa  106  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1235  exopolyphosphatase  27.06 
 
 		 509 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1160  Ppx/GppA phosphatase  26.02 
 
 		 550 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1789  putative exopolyphosphatase  26.44 
 
 		 544 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.810374  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1892  Ppx/GppA phosphatase  38.56 
 
 		 502 aa  105  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05121  putative exopolyphosphatase  26.18 
 
 		 544 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.434231 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1192  Ppx/GppA phosphatase  26.67 
 
 		 500 aa  104  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2740  exopolyphosphatase  27.98 
 
 		 526 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.778881 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5822  Ppx/GppA phosphatase  30.15 
 
 		 321 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  26.89 
 
 		 500 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0697  Ppx/GppA phosphatase  26.69 
 
 		 301 aa  103  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000153349  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0623  exopolyphosphatase  27.73 
 
 		 545 aa  103  5e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.797716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47430  Exopolyphosphatase  29.25 
 
 		 501 aa  103  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160528  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2071  Ppx/GppA phosphatase  28.86 
 
 		 511 aa  103  5e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0329  Ppx/GppA phosphatase  29.24 
 
 		 303 aa  103  6e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2160  exopolyphosphatase  28.86 
 
 		 511 aa  102  7e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2762  exopolyphosphatase  27.68 
 
 		 513 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.708148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2871  exopolyphosphatase  27.68 
 
 		 526 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2698  exopolyphosphatase  27.68 
 
 		 526 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2650  exopolyphosphatase  27.68 
 
 		 526 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2105  Ppx/GppA phosphatase  24.32 
 
 		 497 aa  102  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000081594  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1871  Ppx/GppA phosphatase  29.04 
 
 		 497 aa  102  9e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.855928  normal  0.965208 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2137  Ppx/GppA phosphatase  30.09 
 
 		 303 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00893545  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3323  Ppx/GppA phosphatase  26.02 
 
 		 509 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0154  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  30.09 
 
 		 500 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1861  Ppx/GppA phosphatase  27.49 
 
 		 505 aa  101  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.925382 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2673  exopolyphosphatase  28.28 
 
 		 509 aa  101  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>