43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3174 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3174  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  291  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0525  hypothetical protein  51.82 
 
 		 174 aa  134  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4017  hypothetical protein  54.4 
 
 		 207 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0579  hypothetical protein  52.34 
 
 		 185 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.336002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3074  hypothetical protein  44.78 
 
 		 177 aa  124  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.426221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3017  hypothetical protein  44.76 
 
 		 177 aa  104  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3838  hypothetical protein  47.83 
 
 		 163 aa  103  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0788301  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0712  hypothetical protein  49.19 
 
 		 205 aa  103  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3182  hypothetical protein  43.75 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00860952  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3529  hypothetical protein  52.38 
 
 		 176 aa  101  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.452767  normal  0.831541 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1206  hypothetical protein  52.38 
 
 		 176 aa  101  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1514  hypothetical protein  43.85 
 
 		 131 aa  95.1  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.338897 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3815  hypothetical protein  41.94 
 
 		 124 aa  87.8  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.757001 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3067  hypothetical protein  91.67 
 
 		 58 aa  87.8  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0761  hypothetical protein  41.27 
 
 		 169 aa  86.3  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2866  hypothetical protein  41.67 
 
 		 237 aa  85.5  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.0242431 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2247  hypothetical protein  37.14 
 
 		 248 aa  75.1  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0127  hypothetical protein  41.96 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.488443  normal  0.651433 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3365  hypothetical protein  42.02 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828629  normal  0.105235 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7429  hypothetical protein  35.59 
 
 		 185 aa  64.3  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751032 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3345  hypothetical protein  37.84 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.961104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7729  hypothetical protein  54.55 
 
 		 62 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0250143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3911  hypothetical protein  37.61 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3681  hypothetical protein  33.63 
 
 		 258 aa  51.2  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1810  hypothetical protein  35.9 
 
 		 261 aa  48.9  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187733  normal  0.988109 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2327  hypothetical protein  46.67 
 
 		 265 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1981  hypothetical protein  35.19 
 
 		 273 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1036  hypothetical protein  35.78 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.128051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3438  hypothetical protein  28.57 
 
 		 247 aa  45.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000158666  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3026  hypothetical protein  39.51 
 
 		 252 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3567  hypothetical protein  28.57 
 
 		 247 aa  45.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2727  hypothetical protein  39.51 
 
 		 254 aa  44.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.492193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0765  hypothetical protein  28.57 
 
 		 247 aa  45.1  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000339675  normal  0.0299181 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2796  hypothetical protein  29.73 
 
 		 203 aa  43.9  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3528  hypothetical protein  40.98 
 
 		 253 aa  43.9  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4164  hypothetical protein  42.62 
 
 		 265 aa  43.9  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1252  hypothetical protein  41.67 
 
 		 290 aa  43.5  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0855009 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2618  hypothetical protein  42.62 
 
 		 249 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0983  hypothetical protein  32.17 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0672895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1483  hypothetical protein  37.33 
 
 		 263 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1286  hypothetical protein  40 
 
 		 253 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0459  hypothetical protein  40.98 
 
 		 257 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.445694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2935  hypothetical protein  37.7 
 
 		 249 aa  40.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466313  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>