More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1860 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4188  isocitrate lyase  63.76 
 
 		 545 aa  726    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0755941  normal  0.12145 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4878  isocitrate lyase  64.65 
 
 		 544 aa  720    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.347742  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4340  isocitrate lyase  66.79 
 
 		 528 aa  722    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.968792  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1232  isocitrate lyase  64.07 
 
 		 527 aa  702    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1090  isocitrate lyase  66.79 
 
 		 531 aa  741    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.198066  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1180  isocitrate lyase  67.45 
 
 		 534 aa  728    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1627  isocitrate lyase  99.24 
 
 		 528 aa  1096    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.125319 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0384  isocitrate lyase  66.73 
 
 		 528 aa  712    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2041  isocitrate lyase  66.79 
 
 		 527 aa  741    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3157  isocitrate lyase  66.6 
 
 		 542 aa  730    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0610  isocitrate lyase  67.05 
 
 		 527 aa  717    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01326  isocitrate lyase  70.27 
 
 		 531 aa  774    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.190818  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2407  isocitrate lyase  65.22 
 
 		 531 aa  724    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.210555  normal  0.138791 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12313  isocitrate lyase  70.48 
 
 		 552 aa  773    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5860  isocitrate lyase  67.17 
 
 		 527 aa  722    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0317025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2926  isocitrate lyase  64.33 
 
 		 531 aa  720    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.70995  normal  0.314009 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4199  isocitrate lyase  64.9 
 
 		 545 aa  731    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.747158 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1029  isocitrate lyase  68.04 
 
 		 531 aa  734    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3465  isocitrate lyase  67.74 
 
 		 530 aa  745    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.662087  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1379  isocitrate lyase  65.15 
 
 		 545 aa  734    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.378133 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0304  isocitrate lyase  67.7 
 
 		 531 aa  733    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0529  isocitrate lyase  66.67 
 
 		 528 aa  717    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4053  isocitrate lyase  64.58 
 
 		 545 aa  729    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2353  isocitrate lyase  68.95 
 
 		 527 aa  754    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000102131  decreased coverage  0.000000217224 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1860  isocitrate lyase  100 
 
 		 528 aa  1104    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0847952 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3724  isocitrate lyase  66.48 
 
 		 528 aa  715    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4737  isocitrate lyase  67.05 
 
 		 526 aa  714    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.613526  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0943  isocitrate lyase  67.76 
 
 		 530 aa  737    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.478615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3921  isocitrate lyase  67.17 
 
 		 527 aa  722    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0047  isocitrate lyase  64.39 
 
 		 530 aa  717    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1448  isocitrate lyase  90.34 
 
 		 527 aa  1007    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00397678  normal  0.373019 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2573  isocitrate lyase  65.78 
 
 		 531 aa  728    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157334  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28420  isocitrate lyase  65.6 
 
 		 531 aa  729    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.528136  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1215  isocitrate lyase  72.64 
 
 		 533 aa  779    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2234  isocitrate lyase  68.57 
 
 		 527 aa  751    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0305365  decreased coverage  0.0000429136 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0542  isocitrate lyase  66.86 
 
 		 528 aa  716    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2682  isocitrate lyase  66.98 
 
 		 531 aa  742    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000577171 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3139  isocitrate lyase  67.55 
 
 		 526 aa  741    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.87886  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3879  isocitrate lyase  66.79 
 
 		 528 aa  723    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51448  normal  0.0498655 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30050  isocitrate lyase  65.78 
 
 		 531 aa  726    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4801  isocitrate lyase  66.48 
 
 		 528 aa  715    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.815542 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4447  isocitrate lyase  67.17 
 
 		 527 aa  722    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1363  isocitrate lyase  59.06 
 
 		 535 aa  581  1e-164  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0583  isocitrate lyase  29.44 
 
 		 443 aa  163  9e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0665  isocitrate lyase  31.06 
 
 		 428 aa  162  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000467053  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2249  isocitrate lyase  30.57 
 
 		 428 aa  157  6e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.44014  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0854  isocitrate lyase  29.58 
 
 		 425 aa  157  6e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00269898  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4157  isocitrate lyase  28.79 
 
 		 425 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0289432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1287  isocitrate lyase  29.36 
 
 		 425 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000193732  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1052  isocitrate lyase  29.36 
 
 		 425 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203555  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1030  isocitrate lyase  29.36 
 
 		 425 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.593163  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1033  isocitrate lyase  27.95 
 
 		 425 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00237406  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1182  isocitrate lyase  28.79 
 
 		 425 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00317473  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1132  isocitrate lyase  29.36 
 
 		 425 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00988678  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1210  isocitrate lyase  29.36 
 
 		 425 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1027  isocitrate lyase  29.36 
 
 		 425 aa  155  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.156161  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2942  isocitrate lyase  29.12 
 
 		 440 aa  154  4e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.337122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2766  isocitrate lyase  29.12 
 
 		 440 aa  154  4e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0008216  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1229  isocitrate lyase  29.14 
 
 		 425 aa  154  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154992  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1739  isocitrate lyase  29.66 
 
 		 426 aa  154  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1480  isocitrate lyase  29.75 
 
 		 428 aa  153  7e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1865  isocitrate lyase  30.8 
 
 		 430 aa  153  8e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004371  isocitrate lyase  29.59 
 
 		 437 aa  152  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0267  isocitrate lyase  28.9 
 
 		 437 aa  152  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00619067  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0219  isocitrate lyase  29.85 
 
 		 434 aa  152  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0895016 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2963  malate synthase  30.94 
 
 		 1110 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.821485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2844  isocitrate lyase  28.91 
 
 		 440 aa  152  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166361  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1484  isocitrate lyase  28.91 
 
 		 440 aa  151  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2860  isocitrate lyase  29.98 
 
 		 439 aa  151  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1506  isocitrate lyase  28.02 
 
 		 432 aa  150  5e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3098  isocitrate lyase  29.39 
 
 		 432 aa  150  5e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.183218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4395  isocitrate lyase  29.42 
 
 		 434 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4520  isocitrate lyase  29.42 
 
 		 434 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4517  isocitrate lyase  29.42 
 
 		 434 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.924094  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1429  isocitrate lyase  29.39 
 
 		 432 aa  150  6e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1276  isocitrate lyase  28.91 
 
 		 450 aa  150  6e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57065 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1102  isocitrate lyase  29.21 
 
 		 438 aa  150  6e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4706  isocitrate lyase  28.97 
 
 		 438 aa  150  7e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.942851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1335  isocitrate lyase  29.89 
 
 		 439 aa  149  8e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.738901  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0711  isocitrate lyase  29.07 
 
 		 438 aa  149  9e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3778  isocitrate lyase  30.59 
 
 		 435 aa  149  9e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0366  isocitrate lyase  29.36 
 
 		 435 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4375  isocitrate lyase  28.91 
 
 		 428 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4430  isocitrate lyase  29.65 
 
 		 434 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0451  isocitrate lyase  29.36 
 
 		 436 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4593  isocitrate lyase  29.65 
 
 		 434 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1287  isocitrate lyase  29.22 
 
 		 443 aa  149  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.745788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01042  isocitrate lyase  28.9 
 
 		 437 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3198  malate synthase A  31.19 
 
 		 1111 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0295  isocitrate lyase  29.36 
 
 		 435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.474355  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1501  isocitrate lyase  29.6 
 
 		 461 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2380  isocitrate lyase  28.67 
 
 		 439 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.399534 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4502  isocitrate lyase  29.34 
 
 		 435 aa  149  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0106696 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0365  isocitrate lyase  29.36 
 
 		 435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3097  malate synthase A  30.97 
 
 		 1111 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.476348  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0640  isocitrate lyase  29.13 
 
 		 435 aa  147  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0281046 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02080  isocitrate lyase  29.05 
 
 		 435 aa  147  3e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6438  isocitrate lyase  31.41 
 
 		 443 aa  147  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0846232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3957  isocitrate lyase  30.14 
 
 		 435 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1239  isocitrate lyase  28.48 
 
 		 440 aa  147  5e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.18616  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>