119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0369 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0369  recombination protein O, RecO  100 
 
 		 254 aa  523  1e-148  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.589013  normal  0.0276101 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0335  DNA replication and repair protein RecO  85.04 
 
 		 254 aa  451  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0376  DNA repair protein RecO  48.05 
 
 		 235 aa  241  7.999999999999999e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.374162  hitchhiker  0.000248132 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1477  DNA repair protein RecO  34.68 
 
 		 229 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.451299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4747  DNA repair protein RecO  33.2 
 
 		 233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54300  DNA repair protein RecO  32.4 
 
 		 233 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13820  DNA repair protein RecO  32.93 
 
 		 230 aa  106  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4372  DNA repair protein RecO  32.66 
 
 		 227 aa  99  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197267 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1435  DNA repair protein RecO  31.2 
 
 		 227 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4286  DNA repair protein RecO  31.33 
 
 		 227 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0996  DNA repair protein RecO  32.26 
 
 		 229 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0594947 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1684  DNA repair protein RecO  29.03 
 
 		 234 aa  94.7  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0483  DNA repair protein  28.63 
 
 		 231 aa  92.4  6e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3710  DNA repair protein RecO  27.8 
 
 		 240 aa  90.1  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1075  DNA repair protein RecO  31.85 
 
 		 227 aa  89  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1461  DNA repair protein RecO  29.02 
 
 		 242 aa  88.6  9e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3949  DNA repair protein RecO  31.05 
 
 		 227 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2243  DNA repair protein RecO  27.67 
 
 		 246 aa  87  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4215  DNA repair protein RecO  30.65 
 
 		 227 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.322545  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002499  DNA recombination and repair protein RecO  27.34 
 
 		 243 aa  86.3  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0882  DNA repair protein RecO  28.46 
 
 		 224 aa  85.9  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0032  DNA repair protein RecO  27.31 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0736  DNA repair protein RecO  28.29 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.394466  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2241  DNA replication and repair protein RecO  28.28 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610692 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1350  DNA repair protein RecO  28.8 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2927  DNA repair protein RecO  27.09 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2764  DNA repair protein RecO  27.95 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.165076  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3024  DNA repair protein RecO  28.8 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.179108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2846  DNA repair protein RecO  29.2 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.403823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2523  DNA repair protein RecO  26.27 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0679966  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3667  DNA repair protein RecO  27.53 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2928  DNA repair protein RecO  28.8 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0642  DNA repair protein RecO  28.85 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.272971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1056  DNA repair protein RecO  27.67 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1161  DNA repair protein RecO  28.23 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.218287  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1248  DNA repair protein RecO  27.41 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1039  DNA repair protein RecO  26.48 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.109115  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2037  DNA repair protein RecO  26.09 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03534  recombinational DNA repair protein  27.5 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1757  DNA repair protein RecO  30.83 
 
 		 242 aa  75.1  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.108646  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1203  DNA repair protein RecO  27.82 
 
 		 236 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0374149  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03405  DNA repair protein RecO  26.36 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1280  DNA repair protein RecO  28.23 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.588723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3110  DNA repair protein RecO  27.82 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0026851  normal  0.0227356 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1247  DNA repair protein RecO  27.82 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00802629  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1245  DNA repair protein RecO  25 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000428511  unclonable  0.0000000123287 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1150  DNA repair protein RecO  25.5 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.674395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2416  DNA repair protein RecO  27.84 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01719  DNA repair protein RecO  29.22 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.748158  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2310  DNA repair protein RecO  27.97 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0770241  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1732  DNA repair protein RecO  26.8 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.467987  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1065  DNA repair protein RecO  25.1 
 
 		 272 aa  68.6  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0820208  normal  0.0227401 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1070  DNA repair protein RecO  27.17 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2250  DNA repair protein RecO  26.61 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1138  DNA repair protein RecO  26.09 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.146606  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3613  DNA repair protein RecO  26.09 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1191  DNA repair protein RecO  26.09 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2031  DNA repair protein RecO  25.2 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0971735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0794  recombination protein O, RecO  31.25 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2168  DNA repair protein RecO  25.81 
 
 		 278 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.239438  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0545  DNA repair protein RecO  25.4 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2893  DNA repair protein RecO  25.4 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2464  DNA repair protein RecO  25.4 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2817  DNA repair protein RecO  25.4 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2777  DNA repair protein RecO  25.4 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2838  DNA repair protein RecO  25.4 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1787  DNA repair protein RecO  25.4 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.806002  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2741  DNA repair protein RecO  24.9 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.184755  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2957  DNA repair protein RecO  24.6 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.118345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2782  DNA repair protein RecO  24.9 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2845  DNA repair protein RecO  24.9 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.316896  normal  0.789708 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2973  DNA repair protein RecO  28.98 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.318586  hitchhiker  0.00228518 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2822  DNA repair protein RecO  24.51 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4248  DNA repair protein RecO  25.1 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2720  DNA repair protein RecO  24.11 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2851  DNA repair protein RecO  24.11 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2718  DNA repair protein RecO  24.11 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.888529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0843  DNA repair protein RecO  26.46 
 
 		 336 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.236883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3069  DNA repair protein RecO  26.98 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.380225  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02459  DNA repair protein RecO  24.11 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1103  DNA repair protein RecO  24.11 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0298375  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3801  DNA repair protein RecO  24.11 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2783  DNA repair protein RecO  27.48 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1112  DNA repair protein RecO  24.11 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02423  hypothetical protein  24.11 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3633  DNA repair protein RecO  26.73 
 
 		 249 aa  62  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0656  DNA repair protein RecO  25.51 
 
 		 278 aa  62  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1136  DNA repair protein RecO  25.51 
 
 		 278 aa  62  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1094  DNA repair protein RecO  25.51 
 
 		 278 aa  62  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0995  DNA repair protein RecO  23.62 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0093  DNA repair protein RecO  28.1 
 
 		 202 aa  62  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3052  DNA repair protein RecO  23.72 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.0268872 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1386  DNA repair protein RecO  24.6 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.810395  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1012  DNA repair protein RecO  25.1 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.39895  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1016  DNA repair protein RecO  25.1 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2930  DNA repair protein RecO  23.72 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.4363  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1206  DNA repair protein RecO  26.48 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0930  DNA repair protein RecO  24 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133285  normal  0.103629 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0408  DNA repair protein RecO  25.5 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0415  DNA repair protein RecO  26.29 
 
 		 244 aa  58.5  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>