16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2893 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2893  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  490  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1563  hypothetical protein  46.67 
 
 		 258 aa  186  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1662  hypothetical protein  24.68 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.595279  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2818  peptidoglycan-binding LysM  24.24 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0927  hypothetical protein  25.79 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.171853 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1507  LysM domain-containing protein  25.22 
 
 		 204 aa  62  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26580  LysM domain-containing protein  25.83 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1052  Peptidoglycan-binding LysM  27.8 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0771  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  23.14 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1870  peptidoglycan-binding LysM  25.42 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1878  hypothetical protein  31.18 
 
 		 239 aa  57  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.133633  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1905  hypothetical protein  21.23 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211998  hitchhiker  0.0023156 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5385  Peptidoglycan-binding LysM  26.8 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0981  hypothetical protein  25.21 
 
 		 205 aa  47.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.787443  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2944  Peptidoglycan-binding LysM  26.53 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.34706  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3821  peptidoglycan-binding LysM  27.42 
 
 		 229 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.018492  normal  0.0696013 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>