More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0655 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0655  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  100 
 
 
333 aa  671    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.952816  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3157  phosphate binding protein  67.3 
 
 
321 aa  438  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0618  phosphate binding protein  66.67 
 
 
321 aa  434  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4417  phosphate binding protein  62.97 
 
 
322 aa  410  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5041  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  60.95 
 
 
332 aa  391  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.503358 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2399  phosphate binding protein  60.98 
 
 
332 aa  385  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.427135  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5615  phosphate binding protein  62.37 
 
 
333 aa  386  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.426736  normal  0.391178 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0544  phosphate binding protein  63.29 
 
 
322 aa  384  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6148  hypothetical protein  60.81 
 
 
323 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470848  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0179  phosphate binding protein  60.68 
 
 
322 aa  382  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5376  phosphate binding protein  62.03 
 
 
332 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.572014 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70860  hypothetical protein  60.47 
 
 
323 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.60906 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5329  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  62.03 
 
 
332 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0861464  hitchhiker  0.00379996 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0145  phosphate binding protein  61.02 
 
 
332 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.528128  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5487  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  61.49 
 
 
332 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5237  phosphate binding protein  61.69 
 
 
332 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184797  normal  0.170384 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1380  phosphate binding protein  59.25 
 
 
323 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000270515  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1366  phosphate binding protein  59.25 
 
 
323 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00814513  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1405  phosphate binding protein  59.25 
 
 
323 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000717575  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2979  phosphate binding protein  59.25 
 
 
323 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0450601  normal  0.0144524 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2653  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  59.32 
 
 
323 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1560  phosphate-binding protein  58.82 
 
 
323 aa  369  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2747  phosphate binding protein  59.37 
 
 
323 aa  371  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000097067  hitchhiker  0.0000548451 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2707  phosphate binding protein  59.68 
 
 
323 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000109138  hitchhiker  0.00000175354 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2775  phosphate binding protein  59.68 
 
 
323 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000207455  decreased coverage  0.000220712 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48600  Phosphate-binding protein PstS  62.37 
 
 
322 aa  368  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2877  phosphate binding protein  59.68 
 
 
323 aa  369  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000027974  hitchhiker  0.000116468 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3450  phosphate binding protein  58.97 
 
 
323 aa  364  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00138297  hitchhiker  0.000178512 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1210  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  58.78 
 
 
319 aa  366  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2967  phosphate binding protein  61.22 
 
 
323 aa  367  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00749655  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2553  phosphate binding protein  59.11 
 
 
323 aa  367  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0177722  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1076  phosphate-binding protein  61.56 
 
 
323 aa  367  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000178631  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1298  phosphate binding protein  59.05 
 
 
323 aa  363  3e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000202068  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0957  phosphate binding protein  56 
 
 
324 aa  362  6e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.086307  normal  0.163139 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2766  phosphate binding protein  59.86 
 
 
323 aa  360  1e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00366631  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3301  phosphate binding protein  57.14 
 
 
323 aa  359  4e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212023  decreased coverage  0.0000000255714 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0096  phosphate binding protein  55.56 
 
 
321 aa  352  7e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1113  phosphate binding protein  54.55 
 
 
319 aa  351  8e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.847548 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1306  phosphate binding protein  54.78 
 
 
320 aa  350  2e-95  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.259605 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2455  hypothetical protein  53.38 
 
 
329 aa  322  8e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0255  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  50.65 
 
 
325 aa  321  9.999999999999999e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004383  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  47.48 
 
 
319 aa  320  3e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01028  hypothetical protein  49.83 
 
 
321 aa  318  1e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03438  putative phosphate ABC transporter  46.43 
 
 
316 aa  297  1e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.72664  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3300  phosphate binding protein  52.73 
 
 
312 aa  296  5e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1010  phosphate binding protein  51.62 
 
 
312 aa  296  5e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3274  phosphate binding protein  46.85 
 
 
354 aa  288  8e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3284  phosphate binding protein  46.85 
 
 
354 aa  288  1e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0271757 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3134  phosphate-binding protein  47.15 
 
 
348 aa  287  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3104  phosphate binding protein  50.74 
 
 
324 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2913  phosphate binding protein  50.9 
 
 
311 aa  264  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1043  phosphate binding protein  51.24 
 
 
312 aa  262  6e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.133585 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3268  phosphate binding protein  46.32 
 
 
330 aa  260  2e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.889504  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  39.16 
 
 
270 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  39.16 
 
 
272 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  39.16 
 
 
272 aa  159  9e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  39.16 
 
 
272 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  36.57 
 
 
268 aa  144  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  33.97 
 
 
285 aa  136  5e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1507  phosphate binding protein  34.6 
 
 
274 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0705  phosphate binding protein  33.33 
 
 
330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.125425  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21580  phosphate binding protein  36.16 
 
 
302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1556  phosphate binding protein  33.46 
 
 
274 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  36.88 
 
 
301 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1932  phosphate binding protein  32.44 
 
 
274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1428  phosphate binding protein  31.18 
 
 
278 aa  126  5e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  34.44 
 
 
284 aa  125  7e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  33.7 
 
 
285 aa  125  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1345  phosphate binding protein  33.47 
 
 
272 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.773694  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  32.85 
 
 
303 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1829  phosphate binding protein  32.45 
 
 
273 aa  117  3e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0480  phosphate binding protein  34.33 
 
 
332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2445  phosphate binding protein  31.85 
 
 
337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605633 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  31.48 
 
 
278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  33.45 
 
 
381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0047  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  27.8 
 
 
269 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.134705  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  30.68 
 
 
272 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0979  phosphate binding protein  30.14 
 
 
302 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.113095 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  30.51 
 
 
284 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0489  phosphate binding protein  30.79 
 
 
281 aa  106  7e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.895081  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  30.42 
 
 
267 aa  105  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5179  TonB family protein  27.21 
 
 
558 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0612  serine/threonine protein kinase  31.54 
 
 
734 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0347  phosphate binding protein  29.97 
 
 
281 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000432428 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  31.6 
 
 
272 aa  104  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  31.55 
 
 
281 aa  104  3e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1793  phosphate binding protein  27.27 
 
 
332 aa  103  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0472174 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0270  phosphate binding protein  34.07 
 
 
287 aa  103  4e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.100843  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0965  ompA family protein  32.65 
 
 
562 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0765  phosphate binding protein  32.06 
 
 
270 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.173796 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1917  phosphate binding protein  31.46 
 
 
328 aa  100  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.266865  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0960  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  28.87 
 
 
325 aa  100  4e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  27.5 
 
 
273 aa  99.8  5e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0420  phosphate binding protein  31.18 
 
 
279 aa  99  9e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2613  OmpA family protein  30.82 
 
 
482 aa  99  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.429058  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2587  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  29.89 
 
 
270 aa  98.2  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.705823  normal  0.898892 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  30.33 
 
 
218 aa  97.1  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3266  phosphate-binding protein  27.01 
 
 
307 aa  97.1  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.090565  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0286  phosphate binding protein  32.29 
 
 
281 aa  95.9  9e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.453711 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4359  OmpA/MotB domain-containing protein  29.79 
 
 
558 aa  95.1  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>