61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0581 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0581  TGS domain-containing protein  100 
 
 		 389 aa  788    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1844  TGS domain-containing protein  72.49 
 
 		 389 aa  604  9.999999999999999e-173  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0697  TGS domain-containing protein  73.26 
 
 		 387 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1670  TGS domain-containing protein  72.75 
 
 		 387 aa  568  1e-161  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00970961 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0982  TGS domain-containing protein  53.2 
 
 		 380 aa  388  1e-106  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.741056 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0678  TGS domain-containing protein  45.43 
 
 		 377 aa  294  2e-78  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0662  TGS domain-containing protein  42.6 
 
 		 357 aa  248  1e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00027327  normal  0.0103543 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0194  TGS domain protein  38.01 
 
 		 351 aa  223  4e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1848  small GTP-binding protein  30.77 
 
 		 371 aa  155  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2170  GTP-binding protein HSR1-related  28.21 
 
 		 324 aa  150  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000924799 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0627  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.46 
 
 		 370 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0262779  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1699  small GTP-binding protein  30.08 
 
 		 371 aa  146  5e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.473033  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0871  small GTP-binding protein  28.76 
 
 		 367 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.548847  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1400  hypothetical protein  28.23 
 
 		 370 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2546  small GTP-binding protein  29.62 
 
 		 370 aa  137  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.120198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0958  small GTP-binding protein  28.61 
 
 		 365 aa  136  7.000000000000001e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2526  TGS domain-containing protein  28.61 
 
 		 328 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00530169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0684  small GTP-binding protein  28.34 
 
 		 369 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0574  GTP-binding protein  29.22 
 
 		 364 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.437415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0688  small GTP-binding protein  29.76 
 
 		 369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.629301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0754  small GTP-binding protein  32 
 
 		 369 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1230  small GTP-binding protein  29.11 
 
 		 369 aa  133  6e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0093  TGS domain-containing protein  30.2 
 
 		 346 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0617741  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1541  small GTP-binding protein  28.23 
 
 		 363 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0135  small GTP-binding protein  29.92 
 
 		 369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03250  cytoplasm protein, putative  27.39 
 
 		 367 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.594558  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29231  predicted protein  27.49 
 
 		 374 aa  124  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2429  small GTP-binding protein  28.1 
 
 		 369 aa  124  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0250  small GTP-binding protein  29.09 
 
 		 370 aa  123  5e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.829825  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02790  cytoplasm protein, putative  26.56 
 
 		 368 aa  119  7e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0463275  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02244  GTP binding protein (Gtp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06770)  27.01 
 
 		 367 aa  119  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81735  predicted protein  27.54 
 
 		 367 aa  118  1.9999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0638  small GTP-binding protein  40.24 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_50671  predicted protein  27.92 
 
 		 407 aa  113  5e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42420  predicted protein  27.54 
 
 		 368 aa  113  7.000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.257266  normal  0.210698 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1559  TGS domain-containing protein  28.68 
 
 		 311 aa  111  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.397282  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35696  predicted protein  25.59 
 
 		 410 aa  106  7e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51277  predicted protein  25.33 
 
 		 373 aa  104  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1181  small GTP-binding protein  25.9 
 
 		 370 aa  103  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0782  small GTP-binding protein  29.75 
 
 		 371 aa  103  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04080  GTP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05560)  26.61 
 
 		 378 aa  101  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.256152 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2114  GTP-binding protein, HSR1-related  36.16 
 
 		 330 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1945  small GTP-binding protein  25.62 
 
 		 368 aa  99.8  8e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0191  TGS domain-containing protein  37.79 
 
 		 329 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.230896 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1762  GTP-binding protein HSR1-related  35.5 
 
 		 330 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1842  TGS domain protein  36.09 
 
 		 330 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.2616  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1246  GTP-binding proten HflX  31.13 
 
 		 356 aa  50.8  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2390  GTP-binding protein, HSR1-related  30.15 
 
 		 443 aa  48.5  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.817457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2010  small GTP-binding protein  31.07 
 
 		 348 aa  47.4  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1159  GTP-binding protein HSR1-related  26.38 
 
 		 322 aa  47.8  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  27.63 
 
 		 435 aa  47  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1574  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  21.39 
 
 		 365 aa  45.8  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1320  GTP-binding protein YchF  45.95 
 
 		 364 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2208  small GTP-binding protein  25.81 
 
 		 345 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.739861 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1800  GTPase of unknown function  42.86 
 
 		 401 aa  45.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.016533  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0918  small GTP-binding protein  31.01 
 
 		 351 aa  44.7  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.259421  normal  0.0321262 
 
 
-
 
NC_002950  PG0048  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  43.24 
 
 		 367 aa  44.3  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2626  GTP-binding protein Era  31.73 
 
 		 311 aa  43.1  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.303676  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  26.72 
 
 		 437 aa  43.1  0.008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2467  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  40.54 
 
 		 364 aa  42.7  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293996  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0773  GTP-binding protein Obg/CgtA  50 
 
 		 422 aa  42.7  0.01  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>