46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0248 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1007  extracellular solute-binding protein  79.72 
 
 		 485 aa  725    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.256846  decreased coverage  0.000168852 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0248  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 511 aa  1030    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.370696 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0075  extracellular solute-binding protein  80.93 
 
 		 498 aa  732    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.735503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1168  extracellular solute-binding protein  78.84 
 
 		 516 aa  716    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.731614  normal  0.0353149 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1808  extracellular solute-binding protein  47.28 
 
 		 514 aa  412  1e-114  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1070  hypothetical protein  34.8 
 
 		 475 aa  219  1e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0028  hypothetical protein  35.2 
 
 		 470 aa  210  5e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0650  hypothetical protein  35.61 
 
 		 467 aa  206  6e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0944  hypothetical protein  33.33 
 
 		 472 aa  206  7e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000501517 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4801  extracellular solute-binding protein  28.49 
 
 		 442 aa  113  8.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.433474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4658  extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 		 440 aa  102  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3495  extracellular solute-binding protein  33.05 
 
 		 375 aa  99  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0500866  normal  0.246878 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1990  putative regulatory lipoprotein  25.28 
 
 		 419 aa  99  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.307134  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52130  periplasmic binding protein  26.82 
 
 		 388 aa  87.4  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2651  phosphoglycerate transport: protein for signal transmission  28.34 
 
 		 407 aa  84.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0959912  hitchhiker  0.000467532 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2628  phosphoglycerate transport: protein for signal transmission  28.34 
 
 		 436 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2539  phosphoglycerate transport: protein for signal transmission  28.34 
 
 		 436 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2587  phosphoglycerate transport: protein for signal transmission  28.34 
 
 		 436 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3241  phosphoglycerate transport regulatory protein PgtC, putative  25.07 
 
 		 419 aa  80.5  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.560629 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1485  extracellular solute-binding protein  28.05 
 
 		 470 aa  71.6  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0472403  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2968  extracellular solute-binding protein  23.29 
 
 		 445 aa  63.9  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.812096 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2683  putative phosphoglycerate transport regulatory protein PgtC  20.81 
 
 		 437 aa  62.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.322745  normal  0.30829 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2751  putative phosphoglycerate transport regulatory protein PgtC  20.56 
 
 		 437 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1586  extracellular solute-binding protein family 1  27.34 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3615  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component-like protein  26.86 
 
 		 572 aa  60.1  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1107  extracellular solute-binding protein  27.08 
 
 		 343 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.695758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0333  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 		 344 aa  58.2  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.853179  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4655  putative regulatory lipoprotein  30.43 
 
 		 395 aa  56.2  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1570  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 		 350 aa  55.1  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.840173  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2479  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.09 
 
 		 347 aa  54.7  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0644  putative phosphoglycerate transport regulatory protein PgtC  23.53 
 
 		 440 aa  54.7  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.788627  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0051  extracellular solute-binding protein family 1  25.91 
 
 		 378 aa  52.8  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.115612  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4877  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 		 340 aa  52  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  0.38801 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2070  extracellular solute-binding protein  24.49 
 
 		 322 aa  49.7  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3199  extracellular solute-binding protein  26.62 
 
 		 338 aa  49.3  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.680045  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2476  ABC-type iron(III)-binding periplasmic protein precursor  23.85 
 
 		 364 aa  48.5  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000339151  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0386  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.08 
 
 		 338 aa  48.5  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000551212  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1201  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 320 aa  48.5  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.941139  normal  0.523727 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04090  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  24.51 
 
 		 367 aa  48.1  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.510256 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3281  extracellular solute-binding protein  27.05 
 
 		 343 aa  47.4  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1221  extracellular solute-binding protein family 1  26.35 
 
 		 326 aa  47  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.141693  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1282  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  25.4 
 
 		 347 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1722  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 		 379 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000849376  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0214  ABC transporter periplasmic-binding protein  26.4 
 
 		 337 aa  46.6  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.308816 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1097  extracellular solute-binding protein family 1  28.14 
 
 		 337 aa  46.2  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0890714  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1991  extracellular solute-binding protein family 1  27.91 
 
 		 342 aa  43.9  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000248153  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>