31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0650 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0650  hypothetical protein  100 
 
 		 467 aa  936    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1070  hypothetical protein  73.68 
 
 		 475 aa  643    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0944  hypothetical protein  73.73 
 
 		 472 aa  619  1e-176  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000501517 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0028  hypothetical protein  70.51 
 
 		 470 aa  593  1e-168  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1007  extracellular solute-binding protein  35.58 
 
 		 485 aa  224  2e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.256846  decreased coverage  0.000168852 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0248  extracellular solute-binding protein  35.61 
 
 		 511 aa  218  2e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.370696 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1168  extracellular solute-binding protein  34.64 
 
 		 516 aa  215  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.731614  normal  0.0353149 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0075  extracellular solute-binding protein  34.48 
 
 		 498 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.735503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1808  extracellular solute-binding protein  30.41 
 
 		 514 aa  181  2e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52130  periplasmic binding protein  27.6 
 
 		 388 aa  80.1  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4801  extracellular solute-binding protein  30.3 
 
 		 442 aa  75.1  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.433474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3495  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 		 375 aa  67  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0500866  normal  0.246878 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4658  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 		 440 aa  66.6  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1485  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 		 470 aa  63.2  0.000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0472403  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3241  phosphoglycerate transport regulatory protein PgtC, putative  24.25 
 
 		 419 aa  62.4  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.560629 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1990  putative regulatory lipoprotein  30.36 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.307134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0644  putative phosphoglycerate transport regulatory protein PgtC  26.44 
 
 		 440 aa  54.3  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.788627  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2751  putative phosphoglycerate transport regulatory protein PgtC  23.41 
 
 		 437 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3281  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 		 343 aa  52  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4317  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 		 343 aa  51.2  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.362014 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4655  putative regulatory lipoprotein  23.71 
 
 		 395 aa  50.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2683  putative phosphoglycerate transport regulatory protein PgtC  23.02 
 
 		 437 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.322745  normal  0.30829 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2587  phosphoglycerate transport: protein for signal transmission  24.26 
 
 		 436 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2651  phosphoglycerate transport: protein for signal transmission  24.26 
 
 		 407 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0959912  hitchhiker  0.000467532 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2628  phosphoglycerate transport: protein for signal transmission  24.26 
 
 		 436 aa  47.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2539  phosphoglycerate transport: protein for signal transmission  24.26 
 
 		 436 aa  47.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4877  extracellular solute-binding protein  24.04 
 
 		 340 aa  45.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  0.38801 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0214  ABC transporter periplasmic-binding protein  28.7 
 
 		 337 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.308816 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2968  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 445 aa  45.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.812096 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0051  extracellular solute-binding protein family 1  24 
 
 		 378 aa  45.1  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.115612  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1958  ABC transporter periplasmic-binding protein  30.51 
 
 		 338 aa  43.5  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0213047  hitchhiker  1.86869e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>