26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1070 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0944  hypothetical protein  74.49 
 
 		 472 aa  638    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000501517 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1070  hypothetical protein  100 
 
 		 475 aa  958    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0650  hypothetical protein  73.68 
 
 		 467 aa  634  1e-180  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0028  hypothetical protein  74.65 
 
 		 470 aa  632  1e-180  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1168  extracellular solute-binding protein  36.61 
 
 		 516 aa  240  4e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.731614  normal  0.0353149 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1007  extracellular solute-binding protein  35.27 
 
 		 485 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.256846  decreased coverage  0.000168852 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0075  extracellular solute-binding protein  35.12 
 
 		 498 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.735503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0248  extracellular solute-binding protein  34.8 
 
 		 511 aa  229  9e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.370696 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1808  extracellular solute-binding protein  29.72 
 
 		 514 aa  177  5e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4801  extracellular solute-binding protein  30.32 
 
 		 442 aa  72.4  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.433474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52130  periplasmic binding protein  26.89 
 
 		 388 aa  72.4  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3495  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 		 375 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0500866  normal  0.246878 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4658  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 		 440 aa  67  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3241  phosphoglycerate transport regulatory protein PgtC, putative  22.22 
 
 		 419 aa  59.7  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.560629 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2751  putative phosphoglycerate transport regulatory protein PgtC  24.45 
 
 		 437 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1990  putative regulatory lipoprotein  27.38 
 
 		 419 aa  57  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.307134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2683  putative phosphoglycerate transport regulatory protein PgtC  24.09 
 
 		 437 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.322745  normal  0.30829 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3281  extracellular solute-binding protein  27.72 
 
 		 343 aa  54.3  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1485  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 470 aa  52  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0472403  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2651  phosphoglycerate transport: protein for signal transmission  23.12 
 
 		 407 aa  47  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0959912  hitchhiker  0.000467532 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2587  phosphoglycerate transport: protein for signal transmission  23.12 
 
 		 436 aa  47  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2628  phosphoglycerate transport: protein for signal transmission  23.12 
 
 		 436 aa  47  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2539  phosphoglycerate transport: protein for signal transmission  23.12 
 
 		 436 aa  47  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2968  extracellular solute-binding protein  24.14 
 
 		 445 aa  45.8  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.812096 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0051  extracellular solute-binding protein family 1  23.67 
 
 		 378 aa  44.7  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.115612  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0644  putative phosphoglycerate transport regulatory protein PgtC  29.17 
 
 		 440 aa  43.5  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.788627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>