87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0756 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0756  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  260  6e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2164  hypothetical protein  48.06 
 
 		 128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2191  hypothetical protein  48.06 
 
 		 128 aa  123  9e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2866  hypothetical protein  48.78 
 
 		 127 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3371  hypothetical protein  47.66 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.994357  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4078  hypothetical protein  47.93 
 
 		 127 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000581683  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3728  hypothetical protein  45.67 
 
 		 127 aa  111  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.04039  normal  0.0800584 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2496  membrane protein-like protein  50.43 
 
 		 130 aa  110  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.040419  normal  0.199912 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1621  hypothetical protein  47.58 
 
 		 133 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.183989  normal  0.047816 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0720  hypothetical protein  49.57 
 
 		 128 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3708  hypothetical protein  48.7 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1022  hypothetical protein  46.96 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.833543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1010  hypothetical protein  46.96 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3004  hypothetical protein  46.96 
 
 		 127 aa  102  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.182987  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0849  hypothetical protein  46.96 
 
 		 127 aa  101  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3269  hypothetical protein  46.09 
 
 		 127 aa  101  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3353  hypothetical protein  46.09 
 
 		 127 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0988  hypothetical protein  46.09 
 
 		 127 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3173  hypothetical protein  46.09 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0906  hypothetical protein  46.28 
 
 		 127 aa  96.7  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1222  hypothetical protein  43.41 
 
 		 128 aa  96.7  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0936  hypothetical protein  48.08 
 
 		 127 aa  88.6  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000828174  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1928  transmembrane protein  39.2 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.696294  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1964  membrane protein-like  37.21 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3444  membrane protein-like protein  37.21 
 
 		 123 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.579203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0661  hypothetical protein  37.6 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.850631  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4503  membrane protein-like protein  40.62 
 
 		 123 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.151573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3491  membrane protein-like protein  37.29 
 
 		 123 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4079  membrane protein-like protein  36.43 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4287  membrane protein-like  36.43 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2042  hypothetical protein  38.17 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0752  hypothetical protein  38.17 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3977  membrane protein-like protein  37.29 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.109107  normal  0.438253 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1679  membrane protein-like protein  38.28 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.384201 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1027  hypothetical protein  31.09 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  hitchhiker  0.00407266  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2000  hypothetical protein  34.58 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2744  hypothetical protein  32.17 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.200077 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11061  hypothetical protein  31.93 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0277619  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1356  hypothetical protein  28.91 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0636538 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0552  inner membrane protein  32.32 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.642383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2271  membrane protein-like  33.87 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3416  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0788  hypothetical protein  32.52 
 
 		 127 aa  57  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.784909 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11071  hypothetical protein  29.41 
 
 		 134 aa  57  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0831  transmembrane protein  35.16 
 
 		 128 aa  57  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1826  hypothetical protein  32.8 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1852  hypothetical protein  32.8 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5274  hypothetical protein  33.83 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4798  hypothetical protein  33.88 
 
 		 133 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467764 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0835  inner membrane protein  30.91 
 
 		 136 aa  52.8  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.149897 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0380  hypothetical protein  34.11 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0493  hypothetical protein  32.06 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0734  putative transmembrane protein  38.46 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106149  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11021  hypothetical protein  28.85 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0927  hypothetical protein  30.51 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11791  hypothetical protein  29.91 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.469395  normal  0.0438894 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0464  hypothetical protein  29.91 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0321  membrane protein-like protein  36 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0441228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07020  hypothetical protein  33.08 
 
 		 128 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0816  hypothetical protein  32.79 
 
 		 127 aa  50.8  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0838282 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2333  membrane protein-like protein  29.46 
 
 		 130 aa  50.1  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4972  hypothetical protein  31.3 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4845  hypothetical protein  32.06 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.126737  normal  0.62859 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0294  membrane protein-like protein  33.88 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0804  hypothetical protein  37.61 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02203  hypothetical protein  25.2 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5021  hypothetical protein  32.06 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850985 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2623  inner membrane protein  31.01 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0963  inner membrane protein  31.01 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2885  hypothetical protein  27.45 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.241636  normal  0.197361 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2146  inner membrane protein  25.21 
 
 		 138 aa  47  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2647  hypothetical protein  29.57 
 
 		 153 aa  46.2  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00167697 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0182  hypothetical protein  32.65 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2531  hypothetical protein  35.79 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.247104  normal  0.592717 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2214  hypothetical protein  32.61 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.843648  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2308  hypothetical protein  31.09 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.868044 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0643  hypothetical protein  32.31 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0450  membrane protein-like protein  32.56 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0276  hypothetical protein  33.67 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.440842 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2432  hypothetical protein  35.9 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.687414  normal  0.0885444 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3506  inner membrane protein  28.3 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.701287  normal  0.583809 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2325  membrane protein-like protein  32.63 
 
 		 141 aa  41.2  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540964 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2347  membrane protein-like protein  30.89 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4900  membrane protein-like protein  41.41 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0546  hypothetical protein  32.61 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00496628  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1510  membrane protein-like protein  30.89 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2005  hypothetical protein  29.41 
 
 		 141 aa  40.4  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>