More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0290 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0290  oxidoreductase-like  100 
 
 		 379 aa  785    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0348948  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  32.28 
 
 		 390 aa  95.5  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0483  oxidoreductase domain protein  28.07 
 
 		 368 aa  93.6  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.264242 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0948  oxidoreductase domain protein  25.33 
 
 		 382 aa  93.6  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.191297  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  31.53 
 
 		 384 aa  91.3  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  29.65 
 
 		 379 aa  90.5  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  31.28 
 
 		 386 aa  89.4  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  32.18 
 
 		 382 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  35.95 
 
 		 350 aa  87  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3305  oxidoreductase domain-containing protein  32.8 
 
 		 373 aa  87.4  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192693 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01590  predicted dehydrogenase  24.81 
 
 		 419 aa  85.5  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  28.69 
 
 		 377 aa  85.1  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  24.16 
 
 		 375 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  32.57 
 
 		 337 aa  84  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1039  oxidoreductase domain-containing protein  25.2 
 
 		 346 aa  84  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  28.93 
 
 		 364 aa  83.2  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  28.19 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1925  oxidoreductase domain protein  28.37 
 
 		 340 aa  83.6  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  27.09 
 
 		 388 aa  82.8  0.000000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  25.08 
 
 		 385 aa  82.8  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  27.94 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  30.05 
 
 		 382 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.64 
 
 		 349 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  23.79 
 
 		 387 aa  80.9  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  28.82 
 
 		 378 aa  80.5  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2855  oxidoreductase domain protein  28.87 
 
 		 375 aa  80.1  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0639382  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  28.44 
 
 		 367 aa  80.1  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  26.01 
 
 		 376 aa  80.1  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  26.9 
 
 		 370 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  30.3 
 
 		 347 aa  79.3  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2827  oxidoreductase domain-containing protein  27.38 
 
 		 373 aa  79.7  0.00000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  31.53 
 
 		 383 aa  79  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2763  oxidoreductase-like  29.35 
 
 		 375 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.495555  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  28.22 
 
 		 386 aa  79  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  26.52 
 
 		 377 aa  79  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4205  oxidoreductase-like  25.26 
 
 		 371 aa  79  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.819586 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  29.29 
 
 		 337 aa  79.3  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  26.9 
 
 		 370 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2947  oxidoreductase domain protein  29.35 
 
 		 375 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.59536  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0390  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  decreased coverage  0.00594685 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  24.06 
 
 		 378 aa  77.8  0.0000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  30.69 
 
 		 383 aa  77.8  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  27.84 
 
 		 373 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  27.8 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  28.25 
 
 		 371 aa  76.6  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  26.79 
 
 		 338 aa  76.3  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  27.59 
 
 		 387 aa  75.9  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 		 376 aa  75.5  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  25.53 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  26.01 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  27.09 
 
 		 385 aa  74.3  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  25.23 
 
 		 387 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  24.38 
 
 		 374 aa  74.3  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0294  oxidoreductase domain-containing protein  27.4 
 
 		 384 aa  74.3  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.950002  normal  0.780487 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  31.47 
 
 		 332 aa  74.7  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  24.64 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  26.19 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3549  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 356 aa  73.6  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.933406  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1190  oxidoreductase domain-containing protein  28.9 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0186482  hitchhiker  0.000025969 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3183  oxidoreductase domain-containing protein  31.21 
 
 		 369 aa  73.9  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0118755  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  26.6 
 
 		 380 aa  73.6  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  32.58 
 
 		 366 aa  73.2  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  25.66 
 
 		 378 aa  73.2  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  25.56 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  28.64 
 
 		 380 aa  73.2  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  26.21 
 
 		 344 aa  73.2  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2281  oxidoreductase domain-containing protein  31.68 
 
 		 337 aa  72.8  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.991839  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  28.5 
 
 		 347 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08211  putative oxidoreductase  26.18 
 
 		 366 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.839284 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3639  oxidoreductase domain-containing protein  31.41 
 
 		 373 aa  72  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.671652  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2173  oxidoreductase, NAD-binding  31.68 
 
 		 337 aa  72.4  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.312886  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0189  putative oxidoreductase  26.18 
 
 		 366 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.329829  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  21.67 
 
 		 377 aa  72  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1107  oxidoreductase domain protein  32.67 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.49503  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  28.24 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0619  oxidoreductase domain-containing protein  25.38 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000252275  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  28.24 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  24.3 
 
 		 396 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  31.06 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  26 
 
 		 369 aa  71.2  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  27.04 
 
 		 349 aa  70.9  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0117  oxidoreductase domain protein  27.36 
 
 		 398 aa  70.9  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1619  oxidoreductase domain protein  23.33 
 
 		 377 aa  70.9  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.699315 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0762  oxidoreductase domain protein  27.08 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3383  oxidoreductase domain protein  29.29 
 
 		 342 aa  71.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0605  oxidoreductase domain-containing protein  25.38 
 
 		 325 aa  71.2  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000161871  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  23.48 
 
 		 378 aa  70.5  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1858  putative oxidoreductase  29.29 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.371104  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1865  oxidoreductase domain protein  24.69 
 
 		 367 aa  70.5  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2957  oxidoreductase domain-containing protein  34.97 
 
 		 341 aa  70.5  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.677308  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3042  oxidoreductase domain-containing protein  26.42 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.42 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24600  predicted dehydrogenase  24.37 
 
 		 366 aa  70.5  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178343  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  25.82 
 
 		 386 aa  70.5  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08642  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04870)  31.01 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  24.66 
 
 		 387 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0893  NAD-dependent oxidoreductase  24.14 
 
 		 517 aa  70.1  0.00000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0250  oxidoreductase domain protein  25.91 
 
 		 403 aa  70.1  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2775  oxidoreductase domain protein  30.26 
 
 		 361 aa  69.7  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0108511  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>