55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1168 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1168  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 516 aa  1039    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.731614  normal  0.0353149 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0248  extracellular solute-binding protein  78.84 
 
 		 511 aa  716    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.370696 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1007  extracellular solute-binding protein  78.37 
 
 		 485 aa  721    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.256846  decreased coverage  0.000168852 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0075  extracellular solute-binding protein  81.86 
 
 		 498 aa  750    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.735503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1808  extracellular solute-binding protein  45.4 
 
 		 514 aa  397  1e-109  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1070  hypothetical protein  36.61 
 
 		 475 aa  229  9e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0028  hypothetical protein  35.78 
 
 		 470 aa  211  2e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0944  hypothetical protein  33.97 
 
 		 472 aa  206  6e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000501517 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0650  hypothetical protein  34.84 
 
 		 467 aa  204  2e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4658  extracellular solute-binding protein  29.4 
 
 		 440 aa  129  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1990  putative regulatory lipoprotein  27.67 
 
 		 419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.307134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4801  extracellular solute-binding protein  29.02 
 
 		 442 aa  109  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.433474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3495  extracellular solute-binding protein  33.62 
 
 		 375 aa  97.8  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0500866  normal  0.246878 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3241  phosphoglycerate transport regulatory protein PgtC, putative  25.63 
 
 		 419 aa  94.4  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.560629 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2651  phosphoglycerate transport: protein for signal transmission  28.74 
 
 		 407 aa  91.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0959912  hitchhiker  0.000467532 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52130  periplasmic binding protein  24.53 
 
 		 388 aa  90.9  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2587  phosphoglycerate transport: protein for signal transmission  28.74 
 
 		 436 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2628  phosphoglycerate transport: protein for signal transmission  28.74 
 
 		 436 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2539  phosphoglycerate transport: protein for signal transmission  28.74 
 
 		 436 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2751  putative phosphoglycerate transport regulatory protein PgtC  21.79 
 
 		 437 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2968  extracellular solute-binding protein  23.01 
 
 		 445 aa  73.6  0.000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.812096 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2683  putative phosphoglycerate transport regulatory protein PgtC  22.06 
 
 		 437 aa  73.6  0.000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.322745  normal  0.30829 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1485  extracellular solute-binding protein  28.25 
 
 		 470 aa  67  0.0000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0472403  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0333  extracellular solute-binding protein  27.87 
 
 		 344 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.853179  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3199  extracellular solute-binding protein  29.75 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.680045  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0051  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 		 378 aa  57.4  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.115612  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0644  putative phosphoglycerate transport regulatory protein PgtC  20.67 
 
 		 440 aa  55.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.788627  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1107  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 		 343 aa  55.1  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.695758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2070  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 		 322 aa  54.3  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4655  putative regulatory lipoprotein  27.61 
 
 		 395 aa  54.3  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1221  extracellular solute-binding protein family 1  27.59 
 
 		 326 aa  53.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.141693  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1991  extracellular solute-binding protein family 1  29.02 
 
 		 342 aa  53.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000248153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1570  extracellular solute-binding protein  28.69 
 
 		 350 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.840173  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2479  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.05 
 
 		 347 aa  52.4  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1586  extracellular solute-binding protein family 1  24.13 
 
 		 333 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1282  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  26.32 
 
 		 347 aa  48.5  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0214  ABC transporter periplasmic-binding protein  29.35 
 
 		 337 aa  48.5  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.308816 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1201  extracellular solute-binding protein family 1  25.76 
 
 		 320 aa  47.8  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.941139  normal  0.523727 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04090  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  25.56 
 
 		 367 aa  47.4  0.0007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.510256 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3615  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component-like protein  24.23 
 
 		 572 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1287  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  27.62 
 
 		 355 aa  46.6  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.180605  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1436  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein, putative  25.52 
 
 		 346 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1235  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  25.52 
 
 		 358 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1212  iron ABC transporter solute-binding protein  25.52 
 
 		 358 aa  45.8  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1214  iron ABC transporter solute-binding protein  25.52 
 
 		 358 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1411  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.52 
 
 		 358 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1476  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.52 
 
 		 358 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1337  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  25.52 
 
 		 358 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3970  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25 
 
 		 358 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0544  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 		 322 aa  45.1  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1237  extracellular metal-binding protein  25 
 
 		 358 aa  44.3  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3135  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  27.85 
 
 		 351 aa  44.3  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1958  ABC transporter periplasmic-binding protein  26.79 
 
 		 338 aa  43.9  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0213047  hitchhiker  1.86869e-16 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2899  extracellular solute-binding protein  26.83 
 
 		 345 aa  43.5  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00994055 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1722  extracellular solute-binding protein  25.26 
 
 		 379 aa  43.9  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000849376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>