42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0135 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0135  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  545  1e-154  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0127  hypothetical protein  69.4 
 
 		 269 aa  396  1e-109  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0384146  hitchhiker  0.00530729 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1171  hypothetical protein  65.67 
 
 		 269 aa  367  1e-101  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.51603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0102  hypothetical protein  63.06 
 
 		 270 aa  340  1e-92  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000654219 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0757  periplasmic binding protein  46.84 
 
 		 273 aa  238  1e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2214  periplasmic binding protein  30.25 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1584  periplasmic binding protein  30.51 
 
 		 264 aa  72  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.409039  normal  0.308354 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1104  periplasmic binding protein  23.6 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2460  periplasmic binding protein  26.32 
 
 		 272 aa  57  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  26.8 
 
 		 289 aa  53.5  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2762  periplasmic binding protein  25.25 
 
 		 272 aa  52  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.599111  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3846  periplasmic binding protein  26.64 
 
 		 264 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.907593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0512  iron(III) dicitrate-binding protein  28.72 
 
 		 314 aa  49.3  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.1381  normal  0.0960859 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3803  hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein  27.06 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.656087  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  26.15 
 
 		 309 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0648  hemin-binding periplasmic protein  27.06 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3891  periplasmic binding protein  27.06 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.815625  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2363  periplasmic binding protein  23.81 
 
 		 289 aa  47.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2093  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  23.53 
 
 		 278 aa  47.4  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.839257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2443  periplasmic binding protein  32.52 
 
 		 304 aa  46.6  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000910512  normal  0.674129 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  25.95 
 
 		 379 aa  45.8  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06845  predicted ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  25.58 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0226932  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0469  periplasmic binding protein  27.91 
 
 		 272 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.69845 
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  25.22 
 
 		 338 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  25.22 
 
 		 338 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1442  periplasmic binding protein  27.73 
 
 		 321 aa  45.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.181866  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2167  periplasmic binding protein  27.06 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.579619  normal  0.13229 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1393  periplasmic binding protein  31.5 
 
 		 317 aa  44.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.310826  normal  0.0475326 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2664  periplasmic binding protein  25.63 
 
 		 303 aa  43.9  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0250  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  29.41 
 
 		 356 aa  43.9  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0491648  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2792  periplasmic binding protein  27.5 
 
 		 292 aa  43.9  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.912226 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  24.35 
 
 		 338 aa  43.1  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_68  cobalamin-binding protein  29.41 
 
 		 517 aa  43.5  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  22.48 
 
 		 315 aa  43.1  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0748  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  20.99 
 
 		 315 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1518  periplasmic binding protein  28.05 
 
 		 315 aa  42.7  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2623  periplasmic binding protein  27.78 
 
 		 292 aa  42.7  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4030  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  28.45 
 
 		 288 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0135159  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0995  periplasmic binding protein  26.77 
 
 		 288 aa  42.7  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3079  periplasmic binding protein  25.83 
 
 		 291 aa  42.7  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498127  normal  0.441233 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4146  periplasmic binding protein  28.45 
 
 		 288 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0746656  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4249  iron ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.57 
 
 		 272 aa  42  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.231782 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>