65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04597 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04597  DJ-1/PfpI family  100 
 
 
192 aa  388  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0569  ThiJ/PfpI domain protein  40.44 
 
 
212 aa  103  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2564  ThiJ/PfpI domain protein  32.66 
 
 
241 aa  96.3  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4040  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.53 
 
 
204 aa  95.5  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00474505 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4072  ThiJ/PfpI domain protein  36.93 
 
 
202 aa  94.4  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3165  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.85 
 
 
191 aa  93.6  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2690  thiJ/pfpI family protein  32.95 
 
 
210 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0560939  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0353  ThiJ/PfpI family intracellular protease  28.96 
 
 
208 aa  87.8  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2761  intracellular protease, ThiJ/PfpI family  32.16 
 
 
210 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000853116 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2475  thiJ/pfpI family protein  32.39 
 
 
210 aa  85.9  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0918447  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2657  thiJ/pfpI family protein  32.39 
 
 
210 aa  85.9  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1842  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.36 
 
 
210 aa  84.3  9e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000198171  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0808  hypothetical protein  35.33 
 
 
212 aa  84.3  9e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0613727 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2155  ThiJ/PfpI domain protein  33.52 
 
 
206 aa  84  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.663488 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2674  thiJ/pfpI family protein  32 
 
 
210 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000490961 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2512  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.04 
 
 
210 aa  83.2  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3645  ThiJ/PfpI domain protein  35.14 
 
 
210 aa  82.8  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.415005 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3678  ThiJ/PfpI  36.92 
 
 
196 aa  82.4  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2291  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.65 
 
 
210 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2402  ThiJ/PfpI family protein  31.25 
 
 
210 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247507  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1340  ThiJ/PfpI  29.94 
 
 
208 aa  76.3  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1843  ThiJ/PfpI domain protein  23.12 
 
 
190 aa  75.9  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0833  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  27.08 
 
 
196 aa  71.2  0.000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000524755  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1492  intracellular protease/amidase  23.16 
 
 
194 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.882955  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1648  thiJ/pfpI family protein  23.16 
 
 
194 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1529  thiJ/pfpI family protein  23.16 
 
 
194 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.695646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1501  thiJ/PfpI family protein  22.6 
 
 
194 aa  64.3  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000524776  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1791  thiJ/pfpI family protein  22.6 
 
 
194 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0125  transcriptional regulator  35.34 
 
 
325 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3688  thiJ/pfpI family protein  28.29 
 
 
190 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000554437  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  33.03 
 
 
358 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3683  thiJ/pfpI family protein  26.97 
 
 
190 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00698458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3357  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  27.63 
 
 
186 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000501015  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3763  thiJ/pfpI family protein  26.32 
 
 
190 aa  52  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00017711  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3408  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  26.97 
 
 
190 aa  50.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163373  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1553  thiJ/pfpI family protein  27.35 
 
 
190 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454916  normal  0.0345603 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3445  thiJ/pfpI family protein  26 
 
 
190 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000555251  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3715  thiJ/pfpI family protein  26 
 
 
190 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000105676  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3342  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.67 
 
 
190 aa  47  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000897289  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1101  DJ-1 family protein  23.94 
 
 
182 aa  47  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2090  ThiJ/PfpI domain protein  22.94 
 
 
192 aa  46.6  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.117884  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  25.91 
 
 
326 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4725  AraC family transcriptional regulator  32.8 
 
 
332 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  21.99 
 
 
189 aa  46.2  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00863935  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2562  ThiJ/PfpI domain protein  33.91 
 
 
198 aa  45.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0681  DJ-1 family protein  32.74 
 
 
203 aa  45.1  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.728078  normal  0.0428535 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4747  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 
320 aa  45.1  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0523  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  32.74 
 
 
203 aa  45.1  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.017348  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2566  DJ-1 family protein  29.17 
 
 
192 aa  45.1  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.290389  normal  0.0127226 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.94 
 
 
199 aa  44.7  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2327  transcriptional regulator  27.13 
 
 
316 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.223293  normal  0.02817 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  25.39 
 
 
326 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  25.39 
 
 
326 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1594  ThiJ/PfpI domain protein  28.57 
 
 
203 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.157689 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3843  transcriptional regulator, AraC family  37.89 
 
 
339 aa  42.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.295718  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1437  AraC family transcriptional regulator  26.56 
 
 
326 aa  42.4  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0070  transcriptional regulator  34.29 
 
 
347 aa  42  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.020859 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0072  transcriptional regulator  34.29 
 
 
347 aa  42.4  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000158985 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3263  transcriptional regulator  28.68 
 
 
322 aa  42  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  36.26 
 
 
320 aa  42  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0068  transcriptional regulator  34.29 
 
 
347 aa  41.6  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9264  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  28.79 
 
 
328 aa  41.6  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2119  metal dependent phosphohydrolase  25.15 
 
 
388 aa  41.2  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0158071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3664  DJ-1/PfpI family protein  26.67 
 
 
151 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0803  DJ-1 family protein  30.14 
 
 
182 aa  41.2  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>