More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04056 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04056  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 307 aa  605  9.999999999999999e-173  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  80.53 
 
 		 307 aa  494  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  77.56 
 
 		 307 aa  474  1e-133  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1864  methionyl-tRNA formyltransferase  76.57 
 
 		 307 aa  473  1e-132  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  57 
 
 		 308 aa  317  2e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  55.05 
 
 		 314 aa  317  2e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  54.87 
 
 		 314 aa  315  8e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  56.03 
 
 		 310 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  54.87 
 
 		 310 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  54.58 
 
 		 319 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  54.87 
 
 		 310 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  54.87 
 
 		 310 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  55.19 
 
 		 310 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  52.81 
 
 		 312 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  56.31 
 
 		 318 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  50.49 
 
 		 311 aa  307  2.0000000000000002e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  54.55 
 
 		 314 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00190  methionyl-tRNA formyltransferase  55.88 
 
 		 314 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.767541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2868  methionyl-tRNA formyltransferase  57.84 
 
 		 325 aa  300  2e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  51.31 
 
 		 321 aa  299  3e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  54.18 
 
 		 307 aa  298  6e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  52.48 
 
 		 313 aa  298  6e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  50.82 
 
 		 313 aa  296  3e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  51.63 
 
 		 315 aa  293  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  50.33 
 
 		 312 aa  293  2e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  51.63 
 
 		 315 aa  293  3e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  51.63 
 
 		 315 aa  293  3e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  51.63 
 
 		 315 aa  293  3e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  51.63 
 
 		 315 aa  293  3e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  51.63 
 
 		 315 aa  293  3e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  51.63 
 
 		 315 aa  293  3e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  51.31 
 
 		 315 aa  292  4e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  52.15 
 
 		 315 aa  292  6e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  52.29 
 
 		 315 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  52.29 
 
 		 315 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  52.29 
 
 		 315 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  52.29 
 
 		 315 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  52.29 
 
 		 315 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  51.48 
 
 		 315 aa  289  4e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  51.47 
 
 		 315 aa  289  4e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  51.48 
 
 		 315 aa  289  4e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  51.48 
 
 		 315 aa  289  4e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  51.8 
 
 		 315 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  49.17 
 
 		 329 aa  288  6e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0590691 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2272  methionyl-tRNA formyltransferase  53.69 
 
 		 320 aa  288  8e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00775496 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00160  methionyl-tRNA formyltransferase  54.69 
 
 		 325 aa  287  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  51.01 
 
 		 302 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0181  methionyl-tRNA formyltransferase  54.52 
 
 		 299 aa  287  2e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  50 
 
 		 318 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  51.31 
 
 		 320 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.601603  normal  0.144256 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  53.18 
 
 		 297 aa  283  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  51.64 
 
 		 301 aa  283  3.0000000000000004e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0079  methionyl-tRNA formyltransferase  48.69 
 
 		 316 aa  283  4.0000000000000003e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  48.69 
 
 		 319 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2535  methionyl-tRNA formyltransferase  51.01 
 
 		 302 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.614949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2474  methionyl-tRNA formyltransferase  48.21 
 
 		 315 aa  281  7.000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  49.02 
 
 		 318 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  49.83 
 
 		 318 aa  281  1e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0875  methionyl-tRNA formyltransferase  49.84 
 
 		 302 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  49.02 
 
 		 318 aa  281  1e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  49.34 
 
 		 315 aa  280  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  50 
 
 		 314 aa  280  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  49.35 
 
 		 318 aa  279  4e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  49.02 
 
 		 318 aa  279  4e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  49.02 
 
 		 318 aa  278  7e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  48.86 
 
 		 318 aa  278  7e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  48.7 
 
 		 315 aa  278  8e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2627  methionyl-tRNA formyltransferase  57.81 
 
 		 314 aa  278  1e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.640895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  48.69 
 
 		 318 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2078  methionyl-tRNA formyltransferase  49.69 
 
 		 332 aa  277  2e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  48.69 
 
 		 318 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0037  methionyl-tRNA formyltransferase  46.89 
 
 		 320 aa  276  2e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  49.19 
 
 		 324 aa  277  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  48.69 
 
 		 314 aa  276  3e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  50.67 
 
 		 308 aa  276  4e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  48.69 
 
 		 314 aa  275  5e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  52.82 
 
 		 310 aa  275  5e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3015  methionyl-tRNA formyltransferase  51.33 
 
 		 323 aa  275  6e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  49.19 
 
 		 322 aa  275  6e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  48.01 
 
 		 315 aa  272  5.000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3354  methionyl-tRNA formyltransferase  50.49 
 
 		 327 aa  272  6e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4053  methionyl-tRNA formyltransferase  52.26 
 
 		 323 aa  271  1e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  48.52 
 
 		 314 aa  270  2e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  48.52 
 
 		 314 aa  270  2e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6477  methionyl-tRNA formyltransferase  51.47 
 
 		 327 aa  270  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.79537 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1777  methionyl-tRNA formyltransferase  46.67 
 
 		 332 aa  270  2e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3398  methionyl-tRNA formyltransferase  51.94 
 
 		 323 aa  270  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.726388  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3677  methionyl-tRNA formyltransferase  50.16 
 
 		 327 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2084  methionyl-tRNA formyltransferase  52.17 
 
 		 311 aa  269  4e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198796  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0074  methionyl-tRNA formyltransferase  45.93 
 
 		 321 aa  269  4e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0143  methionyl-tRNA formyltransferase  52.29 
 
 		 327 aa  269  4e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0284  methionyl-tRNA formyltransferase  50.47 
 
 		 315 aa  269  4e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0176978 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  48.99 
 
 		 312 aa  269  4e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2353  methionyl-tRNA formyltransferase  52.29 
 
 		 337 aa  269  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2805  methionyl-tRNA formyltransferase  52.29 
 
 		 337 aa  269  5e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  47.19 
 
 		 311 aa  269  5e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  52.29 
 
 		 327 aa  269  5e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  50.49 
 
 		 310 aa  269  5e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0160  methionyl-tRNA formyltransferase  52.29 
 
 		 327 aa  269  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.701485  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2275  methionyl-tRNA formyltransferase  52.29 
 
 		 337 aa  269  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>