125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03992 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_06094  transposase (IS4 family) protein  98.68 
 
 
491 aa  311  1.9999999999999998e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05628  transposase (IS4 family) protein  98.68 
 
 
491 aa  311  1.9999999999999998e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.167373  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04446  tRNA nucleotidyltransferase  98.01 
 
 
713 aa  310  4.999999999999999e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0105255  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03992  transposase  100 
 
 
151 aa  307  2.9999999999999997e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03660  transposase  96.03 
 
 
259 aa  305  1.0000000000000001e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00902  transposase  97.35 
 
 
288 aa  303  4.0000000000000004e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00478777  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03921  transposase  96.03 
 
 
261 aa  303  6e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.266691  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03947  ISXoo4 transposase  96.03 
 
 
486 aa  302  1.0000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00613  transposase  96.03 
 
 
261 aa  300  4.0000000000000003e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03599  transposase  95.36 
 
 
259 aa  299  9e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01836  putative ISXoo4 transposase  94.04 
 
 
486 aa  297  4e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03939  transposase  94.7 
 
 
268 aa  297  4e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.796315  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00639  transposase  93.38 
 
 
259 aa  296  5e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374906  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01423  transposase  94.04 
 
 
259 aa  295  2e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03221  transposase  94.04 
 
 
259 aa  294  2e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00701  putative ISXoo4 transposase  93.38 
 
 
486 aa  294  3e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03204  transposase  94.04 
 
 
259 aa  294  3e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03541  transposase  93.38 
 
 
423 aa  293  4e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.497923  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02101  transposase  93.38 
 
 
344 aa  291  2e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04816  transposase  92.05 
 
 
306 aa  291  3e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03291  transposase  92.72 
 
 
230 aa  290  4e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05578  IS1478 transposase  93.38 
 
 
259 aa  290  6e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.957263  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02774  transposase  92.05 
 
 
302 aa  288  2e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02629  transposase  94.04 
 
 
151 aa  286  9e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03512  transposase  90.73 
 
 
261 aa  284  2.9999999999999996e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02554  transposase  92.05 
 
 
162 aa  281  2.0000000000000002e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0840457  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03677  putative ISXoo4 transposase  96.35 
 
 
472 aa  276  8e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03646  transposase  96.35 
 
 
267 aa  275  2e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02255  transposase  92.25 
 
 
186 aa  267  2.9999999999999997e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01571  transposase  96.92 
 
 
362 aa  267  4e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.805285  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01802  putative ISXoo4 transposase  90.14 
 
 
477 aa  260  4.999999999999999e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347621  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02654  transposase  89.73 
 
 
189 aa  256  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03350  ISXoo4 transposase  95.12 
 
 
458 aa  242  9.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02569  transposase  91.87 
 
 
388 aa  239  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06247  transposase  88.98 
 
 
128 aa  215  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100358  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01073  transposase  88.98 
 
 
128 aa  215  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.135334  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06213  transposase  87.67 
 
 
86 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.846656  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00953  transposase  87.67 
 
 
86 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172202  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4647  transposase, IS4 family protein  55.45 
 
 
426 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0672  transposase IS4  54.87 
 
 
442 aa  124  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1394  transposase, IS4 family protein  52.94 
 
 
426 aa  123  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0616685 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1749  transposase, IS4 family protein  52.94 
 
 
426 aa  123  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0425  transposase, IS4 family protein  52.1 
 
 
415 aa  123  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352527  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4039  hypothetical protein  54.55 
 
 
448 aa  121  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.415702 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0019  putative transposase  55.05 
 
 
440 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786306  normal  0.704407 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0478  transposase, IS4 family protein  54.55 
 
 
448 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0843  IRSO9 transposase protein  54.13 
 
 
440 aa  118  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3123  ISRSO9-transposase protein  54.13 
 
 
440 aa  118  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3145  ISRSO9-transposase protein  54.13 
 
 
440 aa  118  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.519223 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3421  ISRSO9-transposase protein  54.13 
 
 
440 aa  118  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0155  ISRSO9-transposase protein  54.13 
 
 
440 aa  118  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00277876  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0584  ISRSO9-transposase protein  54.13 
 
 
440 aa  118  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.21421  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0313  hypothetical protein  53.64 
 
 
287 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2758  transposase, IS4  48.18 
 
 
451 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0869213  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1771  putative transposase  54.55 
 
 
448 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0798  hypothetical protein  52.73 
 
 
166 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4246  hypothetical protein  49.53 
 
 
270 aa  111  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.780286  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3211  hypothetical protein  51.38 
 
 
280 aa  110  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.375208  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4205  transposase IS4 family protein  46.02 
 
 
451 aa  110  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4203  transposase, IS4  46.02 
 
 
231 aa  110  7.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3666  transposase IS4 family protein  41.18 
 
 
442 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.850388  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01849  transposase  84.13 
 
 
241 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1457  transposase, IS4 family protein  47.37 
 
 
460 aa  108  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3827  transposase IS4 family protein  47.97 
 
 
448 aa  108  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5151  transposase IS4 family protein  47.97 
 
 
448 aa  108  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0725  transposase IS4 family protein  47.97 
 
 
448 aa  108  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0105  transposase, IS4 family protein  42.42 
 
 
495 aa  105  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0281  transposase, IS4 family protein  42.42 
 
 
495 aa  105  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0508  transposase, IS4 family protein  42.42 
 
 
495 aa  105  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1377  transposase, IS4 family protein  42.42 
 
 
495 aa  105  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3679  transposase, IS4 family protein  42.42 
 
 
495 aa  105  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01376  hypothetical protein  82.26 
 
 
73 aa  102  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7278  transposase  54.65 
 
 
412 aa  99  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03520  transposase  96.08 
 
 
51 aa  98.6  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03661  ISXoo5 transposase  39.39 
 
 
491 aa  97.1  8e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2849  ISPg7, transposase  46.6 
 
 
438 aa  94  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01960  transposase  37.88 
 
 
159 aa  94  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0186456  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02758  ISXoo5 transposase  38.64 
 
 
529 aa  93.6  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00319  transposase  37.88 
 
 
390 aa  93.2  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00229  ISXoo5 transposase  37.88 
 
 
491 aa  92.4  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01949  ISXoo5 transposase  37.88 
 
 
491 aa  92.4  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03351  putative ISXoo5 transposase  37.88 
 
 
415 aa  92  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06224  ISXoo5 transposase  37.12 
 
 
491 aa  90.9  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01090  ISXoo5 transposase  37.12 
 
 
491 aa  90.9  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3127  hypothetical protein  50 
 
 
115 aa  87.8  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0461  ISPg7, transposase  40 
 
 
435 aa  87.8  5e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0812  hypothetical protein  32.69 
 
 
153 aa  70.5  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01808  transposase  50 
 
 
65 aa  65.5  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0952062  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00632  transposase  46.43 
 
 
408 aa  63.9  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.110086  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0722  transposase, IS5 family, putative  36.36 
 
 
498 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000096619 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0494  transposase, IS5 family, putative  36.36 
 
 
498 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0664  transposase, IS5 family, putative  36.36 
 
 
498 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1382  transposase, IS5 family, putative  36.36 
 
 
498 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1432  transposase, IS5 family, putative  36.36 
 
 
498 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2434  transposase, IS5 family, putative  36.36 
 
 
498 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1921  transposase, IS5 family, putative  36.36 
 
 
498 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0174  IS1478 transposase  60.47 
 
 
74 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0597653  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00697  transposase  44.64 
 
 
408 aa  60.1  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4186  hypothetical protein  29.41 
 
 
509 aa  59.7  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4524  ISPg7, transposase  32.61 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>