79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02862 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02862  transposase  100 
 
 
104 aa  199  9e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03989  IS1112 transposase  94.59 
 
 
322 aa  144  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02914  transposase  93.33 
 
 
159 aa  141  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03884  IS1112 transposase  90.67 
 
 
322 aa  140  7e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00803  IS1112 transposase  90.67 
 
 
322 aa  140  8e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0987141  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01253  transposase  91.89 
 
 
159 aa  138  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00677  IS1112 transposase  91.89 
 
 
267 aa  138  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.16701  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00579  transposase  90.54 
 
 
299 aa  137  7e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02275  transposase  89.61 
 
 
289 aa  136  8.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04791  IS1112 transposase  89.19 
 
 
322 aa  135  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.030193  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03216  IS1112 transposase  89.19 
 
 
322 aa  135  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00575  transposase  90.79 
 
 
197 aa  135  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00109  transposase  89.19 
 
 
324 aa  135  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01251  IS1112 transposase  88 
 
 
322 aa  134  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03519  IS1112 transposase  89.19 
 
 
322 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05593  IS1112 transposase  88 
 
 
260 aa  134  5e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0119198  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04853  IS1112 transposase  87.84 
 
 
322 aa  132  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0362678  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02075  IS1112 transposase  86.67 
 
 
322 aa  131  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02992  IS1112 transposase  87.84 
 
 
322 aa  131  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00702  IS1112 transposase  86.67 
 
 
322 aa  131  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04719  IS1112 transposase  86.67 
 
 
322 aa  131  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.061639  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04709  IS1112 transposase  87.84 
 
 
322 aa  131  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04691  IS1112 transposase  87.84 
 
 
322 aa  131  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00233  IS1112 transposase  86.67 
 
 
322 aa  131  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03346  IS1112 transposase  86.67 
 
 
322 aa  131  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01527  IS1112 transposase  87.84 
 
 
322 aa  131  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374623  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01635  IS1112 transposase  87.84 
 
 
322 aa  131  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.085128  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03201  IS1112 transposase  87.84 
 
 
322 aa  131  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03302  transposase, IS30 family  96.3 
 
 
108 aa  104  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01240  transposase  89.19 
 
 
249 aa  73.9  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.839107  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0783  integrase catalytic subunit  42.7 
 
 
313 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.1506  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4557  integrase catalytic region  42.7 
 
 
313 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.839821 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0912  integrase catalytic subunit  42.7 
 
 
313 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4040  integrase catalytic subunit  42.7 
 
 
313 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3948  integrase catalytic subunit  42.7 
 
 
313 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3870  integrase catalytic subunit  42.7 
 
 
313 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3746  integrase catalytic subunit  42.7 
 
 
313 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.931365  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3686  integrase catalytic subunit  42.7 
 
 
313 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1076  integrase catalytic subunit  42.7 
 
 
313 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1268  integrase catalytic subunit  42.7 
 
 
313 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.813238  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1511  integrase catalytic subunit  42.7 
 
 
313 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.231243  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1571  integrase catalytic subunit  42.7 
 
 
313 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1634  integrase catalytic subunit  42.7 
 
 
313 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.891352  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2043  integrase catalytic subunit  42.7 
 
 
313 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.111705  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2109  integrase catalytic subunit  42.7 
 
 
313 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2138  integrase catalytic subunit  42.7 
 
 
313 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2153  integrase catalytic subunit  42.7 
 
 
313 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000207215  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0672  integrase catalytic subunit  42.7 
 
 
313 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3555  integrase catalytic subunit  42.7 
 
 
313 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3627  integrase catalytic subunit  42.7 
 
 
313 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3684  integrase catalytic subunit  42.7 
 
 
313 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3739  integrase catalytic subunit  42.7 
 
 
313 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1249  integrase, catalytic region  36.78 
 
 
246 aa  52.4  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0925898  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1322  integrase catalytic subunit  41.57 
 
 
313 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0238  integrase catalytic subunit  35.92 
 
 
313 aa  52.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0038  integrase catalytic subunit  35.92 
 
 
313 aa  51.6  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0037  integrase catalytic subunit  35.92 
 
 
313 aa  51.6  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0401  integrase catalytic subunit  35.92 
 
 
313 aa  51.6  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1879  integrase catalytic subunit  35.92 
 
 
313 aa  51.6  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4400  integrase catalytic subunit  39.08 
 
 
315 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2262  integrase catalytic subunit  35.92 
 
 
313 aa  51.6  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4284  integrase catalytic subunit  38.78 
 
 
273 aa  52  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1240  integrase catalytic subunit  36.78 
 
 
317 aa  51.6  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04127  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1574  integrase catalytic subunit  35.92 
 
 
313 aa  51.6  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3589  integrase catalytic subunit  35.92 
 
 
313 aa  51.6  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2599  integrase catalytic subunit  34 
 
 
335 aa  50.4  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0696438 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1485  integrase catalytic subunit  34 
 
 
335 aa  50.4  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436949  normal  0.458814 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04491  transposase  84 
 
 
219 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2645  integrase catalytic subunit  44.44 
 
 
251 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4419  Integrase catalytic region  35.63 
 
 
315 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000000630887  normal  0.64784 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1815  integrase catalytic subunit  32.69 
 
 
335 aa  46.2  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.284311 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1266  integrase catalytic subunit  35.63 
 
 
315 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.705785  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2850  integrase catalytic subunit  35.63 
 
 
315 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0884338  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3440  integrase catalytic subunit  35.63 
 
 
315 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1164  integrase catalytic subunit  32.69 
 
 
335 aa  46.2  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.504403  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2652  integrase catalytic subunit  32.69 
 
 
335 aa  46.2  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.888007  normal  0.0370521 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4403  integrase catalytic region  29 
 
 
290 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.291607  normal  0.47214 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4338  Integrase catalytic region  29 
 
 
290 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.97265  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4656  integrase catalytic region  29 
 
 
290 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.224377  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>