52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01768 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01768  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.228505  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2934  hypothetical protein  63.68 
 
 
200 aa  248  3e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0299987  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0173  hypothetical protein  47.89 
 
 
230 aa  156  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2134  hypothetical protein  38.71 
 
 
213 aa  112  5e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.181695 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1089  hypothetical protein  40.62 
 
 
209 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3938  hypothetical protein  38.62 
 
 
207 aa  96.3  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2080  hypothetical protein  31.32 
 
 
224 aa  94.7  8e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.884925 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1072  hypothetical protein  32.26 
 
 
206 aa  94  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.779846  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3924  hypothetical protein  32.99 
 
 
203 aa  92  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.924156 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5253  hypothetical protein  37.37 
 
 
220 aa  92  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.545904  normal  0.544108 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2551  hypothetical protein  37.71 
 
 
228 aa  87.8  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4276  hypothetical protein  35.38 
 
 
198 aa  87  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45090  hypothetical protein  38.55 
 
 
208 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1386  hypothetical protein  32.8 
 
 
446 aa  87  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3837  hypothetical protein  37.78 
 
 
208 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2015  hypothetical protein  33.33 
 
 
209 aa  84.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.043736 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4587  hypothetical protein  38.04 
 
 
182 aa  82  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1342  hypothetical protein  36.96 
 
 
226 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0667889  normal  0.429693 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2941  hypothetical protein  34.04 
 
 
236 aa  80.5  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0791  hypothetical protein  33.51 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2593  hypothetical protein  37.22 
 
 
280 aa  79  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5615  hypothetical protein  34.57 
 
 
179 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.279853  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1544  hypothetical protein  36.41 
 
 
226 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0293352  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0861  hypothetical protein  42.28 
 
 
223 aa  78.2  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.985431 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5832  hypothetical protein  32.61 
 
 
179 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.927263  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2810  hypothetical protein  28.88 
 
 
210 aa  77.8  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.339771  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7306  hypothetical protein  40.91 
 
 
225 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21700  hypothetical protein  34.74 
 
 
228 aa  77  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.174472 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0783  hypothetical protein  32.95 
 
 
218 aa  76.3  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3381  hypothetical protein  35.14 
 
 
208 aa  75.9  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6725  hypothetical protein  32.62 
 
 
225 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4748  hypothetical protein  27.27 
 
 
215 aa  75.1  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0918  hypothetical protein  33.71 
 
 
217 aa  72.4  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185457  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4116  hypothetical protein  36.36 
 
 
152 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1162  hypothetical protein  32.8 
 
 
231 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.437423  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3640  hypothetical protein  31.12 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.827146  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0831  hypothetical protein  32.98 
 
 
315 aa  67.8  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.812285  normal  0.831839 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8117  hypothetical protein  36.52 
 
 
208 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26500  hypothetical protein  30.94 
 
 
300 aa  67  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.542258  normal  0.407608 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3955  hypothetical protein  34.15 
 
 
201 aa  62.8  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116243  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3747  metal dependent phosphohydrolase  36.14 
 
 
207 aa  60.1  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0454823  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5830  hypothetical protein  34.03 
 
 
389 aa  58.2  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1382  hypothetical protein  36.46 
 
 
252 aa  56.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.141766 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6187  hypothetical protein  32.11 
 
 
250 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31500  hypothetical protein  30.35 
 
 
232 aa  53.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0449001  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0691  hypothetical protein  31.67 
 
 
312 aa  52.8  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23308  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3485  hypothetical protein  28.02 
 
 
289 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0715  hypothetical protein  27.68 
 
 
257 aa  46.6  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.178697  hitchhiker  0.00000364187 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2053  hypothetical protein  29.21 
 
 
242 aa  45.8  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0993318  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3751  hypothetical protein  27.89 
 
 
289 aa  44.7  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6907  hypothetical protein  34.07 
 
 
370 aa  43.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0548239  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04100  hypothetical protein  32.39 
 
 
310 aa  42  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>