71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5567 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5567  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  495  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4460  hypothetical protein  73.06 
 
 		 252 aa  362  3e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4412  hypothetical protein  70.4 
 
 		 250 aa  340  9e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2662  hypothetical protein  66.94 
 
 		 260 aa  330  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.339313  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2246  hypothetical protein  66.94 
 
 		 260 aa  330  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0647125  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1037  hypothetical protein  66.94 
 
 		 260 aa  330  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0963  hypothetical protein  66.94 
 
 		 260 aa  330  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.387944  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2116  hypothetical protein  66.94 
 
 		 260 aa  330  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1118  hypothetical protein  66.53 
 
 		 260 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17354  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0766  hypothetical protein  66.53 
 
 		 267 aa  327  9e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.275592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0967  hypothetical protein  66.53 
 
 		 260 aa  325  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.549462  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2541  hypothetical protein  69.26 
 
 		 256 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  hitchhiker  0.000000132976 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5848  hypothetical protein  68.6 
 
 		 256 aa  310  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.084342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2516  hypothetical protein  68.03 
 
 		 256 aa  305  6e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119945  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1905  hypothetical protein  68.03 
 
 		 256 aa  305  6e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2434  hypothetical protein  66.02 
 
 		 256 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.154358  hitchhiker  0.000000000557872 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0779  hypothetical protein  67.36 
 
 		 256 aa  300  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000797521 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3405  hypothetical protein  67.21 
 
 		 261 aa  275  7e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3455  hypothetical protein  47.81 
 
 		 262 aa  236  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.093168  normal  0.282174 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5041  hypothetical protein  49.37 
 
 		 251 aa  230  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.737372  normal  0.404949 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0689  hypothetical protein  47.11 
 
 		 256 aa  231  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1393  hypothetical protein  51.5 
 
 		 262 aa  229  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.770613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0999  hypothetical protein  46.67 
 
 		 260 aa  228  1e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0094  protein of unknown function DUF347  43.8 
 
 		 252 aa  227  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0092  hypothetical protein  43.8 
 
 		 248 aa  227  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1876  hypothetical protein  47.52 
 
 		 260 aa  219  3e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0571167  unclonable  0.00008342 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2113  protein of unknown function DUF347  46.53 
 
 		 252 aa  218  5e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2507  protein of unknown function DUF347  46.12 
 
 		 252 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.944064  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2299  hypothetical protein  46.31 
 
 		 252 aa  214  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0166488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5325  major facilitator protein family permease  49.79 
 
 		 254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.56518 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3900  hypothetical protein  46.56 
 
 		 252 aa  211  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0054  hypothetical protein  48.28 
 
 		 259 aa  208  7e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0571188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4103  protein of unknown function DUF347  49.79 
 
 		 258 aa  207  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4592  protein of unknown function DUF347  45.49 
 
 		 252 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3518  protein of unknown function DUF347  45.49 
 
 		 252 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4979  putative MFS superfamily permease  46.31 
 
 		 252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.547369 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4038  putative MFS superfamily permease  46.31 
 
 		 252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3003  hypothetical protein  46.31 
 
 		 252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.318216 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3899  hypothetical protein  37.96 
 
 		 269 aa  191  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0257  hypothetical protein  46 
 
 		 269 aa  191  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2752  hypothetical protein  44.92 
 
 		 269 aa  188  8e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4102  protein of unknown function DUF347  45.95 
 
 		 279 aa  185  5e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2301  hypothetical protein  39.59 
 
 		 260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0323626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1471  hypothetical protein  37.85 
 
 		 395 aa  178  8e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000124905  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5017  hypothetical protein  38.52 
 
 		 260 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.516573  normal  0.101315 
 
 
-
 
NC_003296  RS03008  hypothetical protein  38.06 
 
 		 260 aa  170  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3001  hypothetical protein  39.27 
 
 		 260 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.481618 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4036  putative MFS superfamily permease  39.27 
 
 		 260 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4981  putative MFS superfamily permease  39.27 
 
 		 260 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.864613  normal  0.384395 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2111  protein of unknown function DUF347  39.09 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2505  protein of unknown function DUF347  38.68 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.534446 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2596  hypothetical protein  35.92 
 
 		 254 aa  158  7e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502433 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1601  hypothetical protein  33.47 
 
 		 290 aa  156  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2371  hypothetical protein  38.24 
 
 		 424 aa  155  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.982412  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1206  hypothetical protein  38.36 
 
 		 296 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.360986  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3080  hypothetical protein  38.36 
 
 		 285 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1537  hypothetical protein  38.36 
 
 		 285 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0492  hypothetical protein  38.36 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.91251  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1410  hypothetical protein  38.36 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0661  hypothetical protein  38.36 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4100  protein of unknown function DUF347  34.68 
 
 		 258 aa  153  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2739  hypothetical protein  35 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00573503  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8898  protein of unknown function DUF347  34.76 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4177  hypothetical protein  34.58 
 
 		 319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1548  hypothetical protein  33.6 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.785401 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1967  protein of unknown function DUF347  34.45 
 
 		 264 aa  128  7.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.785052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2330  hypothetical protein  34.45 
 
 		 264 aa  128  7.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.551735  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2655  protein of unknown function DUF347  33.79 
 
 		 263 aa  122  6e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0483  hypothetical protein  36.59 
 
 		 252 aa  117  9.999999999999999e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0079  hypothetical protein  35.06 
 
 		 159 aa  90.5  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2650  hypothetical protein  80 
 
 		 53 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>