More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1160 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1160  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 503 aa  1009    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1002  ABC transporter  93.64 
 
 		 503 aa  948    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4848  ABC transporter related  69.82 
 
 		 510 aa  674    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4233  ABC transporter related  62.23 
 
 		 513 aa  592  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.235353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4348  ABC transporter related  56.35 
 
 		 499 aa  524  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08780  ABC transporter related  41.04 
 
 		 513 aa  360  3e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000334619  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07930  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  42.51 
 
 		 534 aa  358  9.999999999999999e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1579  ABC transporter related protein  42.03 
 
 		 520 aa  355  8.999999999999999e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0143  ABC transporter related  40.86 
 
 		 509 aa  354  2e-96  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0402  ABC transporter related  40.96 
 
 		 509 aa  350  3e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.351513  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0421  ABC transporter related  39.34 
 
 		 510 aa  348  9e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0207744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2069  ABC transporter related protein  42.01 
 
 		 508 aa  347  2e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1781  ABC transporter related  40.84 
 
 		 503 aa  347  2e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000368661  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0955  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.66 
 
 		 511 aa  346  5e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0995  ABC transporter related protein  41.37 
 
 		 534 aa  341  1e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4192  ABC transporter related protein  41.35 
 
 		 545 aa  340  4e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1452  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  39.09 
 
 		 506 aa  340  5e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00705254  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2599  ABC transporter-like  41.03 
 
 		 491 aa  339  7e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.766453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1952  ABC transporter related  41.94 
 
 		 505 aa  339  7e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677494 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3948  ABC transporter related  42.89 
 
 		 504 aa  338  9e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718752 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1607  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  39.34 
 
 		 528 aa  338  9.999999999999999e-92  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0825  ABC transporter related  42.91 
 
 		 527 aa  338  1.9999999999999998e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.523889  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1177  ABC transporter related  40.78 
 
 		 509 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1353  ABC transporter related protein  41.68 
 
 		 516 aa  337  2.9999999999999997e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1153  ABC transporter related  40.44 
 
 		 510 aa  337  3.9999999999999995e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3642  sugar ABC transporter ATP-binding protein  39.64 
 
 		 508 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3532  ABC transporter, ATP-binding protein  39.24 
 
 		 510 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3926  sugar ABC transporter ATP-binding protein  39.24 
 
 		 510 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0557636  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0752  ABC transporter related  41.78 
 
 		 551 aa  336  7e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.971835  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1416  ABC transporter related  39.8 
 
 		 551 aa  335  7.999999999999999e-91  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.168356  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3550  ABC transporter, ATP-binding protein  39.24 
 
 		 510 aa  335  9e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119888  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0749  ABC transporter related protein  39.12 
 
 		 502 aa  335  1e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00961204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3803  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.24 
 
 		 510 aa  335  1e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000201894 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3051  ABC transporter related  40.21 
 
 		 511 aa  333  3e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2946  ABC transporter related  41.97 
 
 		 527 aa  333  3e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000498253 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3825  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.04 
 
 		 510 aa  333  5e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37688  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3838  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.04 
 
 		 510 aa  333  5e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2442  ABC transporter-related protein  38.92 
 
 		 510 aa  333  6e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142053  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1949  ABC transporter, ATP-binding protein  39.71 
 
 		 507 aa  332  1e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.740579  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21270  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  40.04 
 
 		 523 aa  332  1e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255586  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0032  ABC transporter related  41.77 
 
 		 512 aa  332  1e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0857  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  38.49 
 
 		 512 aa  331  2e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3889  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.84 
 
 		 510 aa  330  3e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228489  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04900  ATPase component of uncharacterized ABC-type transporter  41.5 
 
 		 532 aa  330  3e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2258  ABC transporter related  38.27 
 
 		 514 aa  330  3e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334051  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0527  ABC transporter related  40.33 
 
 		 541 aa  330  3e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1634  ABC transporter related  40.84 
 
 		 527 aa  330  5.0000000000000004e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1410  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.04 
 
 		 510 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0297132  hitchhiker  0.00935726 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1551  sugar ABC transporter ATP-binding protein  38.72 
 
 		 511 aa  329  6e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.048612  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0726  ABC transporter related  39.17 
 
 		 538 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1831  ABC transporter, ATP-binding protein  38.98 
 
 		 511 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.567476  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1313  ABC transporter related  41.07 
 
 		 534 aa  327  3e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.765078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3176  ABC transporter related  40.87 
 
 		 517 aa  324  2e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.111078  normal  0.67189 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0073  ABC-type uncharacterized transport systems, ATPase component  38.29 
 
 		 518 aa  325  2e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0808  ABC transporter related  40.72 
 
 		 604 aa  323  3e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2283  ABC transporter related  40.56 
 
 		 525 aa  323  3e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.693336 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3268  ABC transporter related  37.63 
 
 		 520 aa  323  3e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00516012  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0296  ABC transporter related  38.28 
 
 		 510 aa  323  3e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000067661  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0783  ABC transporter related  41.89 
 
 		 558 aa  323  4e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1668  ABC transporter-like protein  41.87 
 
 		 529 aa  323  7e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0834819  normal  0.0616705 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4459  ABC transporter related  39.1 
 
 		 503 aa  322  7e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1317  ABC transporter related  39.69 
 
 		 525 aa  322  7e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1211  ABC transporter related  38.83 
 
 		 524 aa  322  8e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000459128 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0756  ABC transporter related  38.06 
 
 		 509 aa  322  9.000000000000001e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2089  ABC transporter related protein  41.06 
 
 		 514 aa  322  9.999999999999999e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05400  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  41.26 
 
 		 517 aa  321  9.999999999999999e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1374  ABC transporter related  39.96 
 
 		 533 aa  321  1.9999999999999998e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.534066 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3652  ABC transporter related  39.61 
 
 		 515 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2210  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  40.39 
 
 		 525 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4171  ABC transporter related  39.1 
 
 		 503 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1138  ABC transporter related  38.37 
 
 		 547 aa  320  5e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0633  ABC transporter related  39.21 
 
 		 518 aa  319  6e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000912545 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2114  ABC transporter related protein  36.86 
 
 		 506 aa  318  1e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235727  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0156  ABC transporter related  41.16 
 
 		 518 aa  318  1e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2768  ABC transporter related  38.87 
 
 		 510 aa  317  2e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6453  ABC transporter related  40.4 
 
 		 514 aa  317  2e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0562  ABC transporter-related protein  41.05 
 
 		 546 aa  318  2e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.136503 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0017  ABC transporter related  36.98 
 
 		 507 aa  317  2e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0860  ABC transporter related  40.08 
 
 		 511 aa  317  4e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0483579 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl668  ribose ABC transporter ATP-binding component  35.94 
 
 		 511 aa  316  5e-85  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0885  ABC transporter related  40.2 
 
 		 525 aa  317  5e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.317541  normal  0.753629 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0677  ABC transporter-like protein  40.73 
 
 		 503 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.366203 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4194  ABC transporter related  39.92 
 
 		 515 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6358  ABC transporter related  41.48 
 
 		 507 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.189938  normal  0.105894 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0959  ABC transporter related protein  37.47 
 
 		 511 aa  313  4.999999999999999e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3561  ABC transporter related  39.59 
 
 		 510 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00305644  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25750  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  38.9 
 
 		 522 aa  313  5.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342553  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1679  ABC transporter related  37.63 
 
 		 528 aa  313  5.999999999999999e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0071828  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1021  ABC transporter related protein  40.28 
 
 		 505 aa  312  6.999999999999999e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.728711 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3540  ABC transporter related  39.72 
 
 		 506 aa  311  1e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0821  ABC transporter related  38.02 
 
 		 507 aa  311  2e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0844  ABC transporter related  38.02 
 
 		 507 aa  311  2e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6738  ABC transporter related protein  41.07 
 
 		 532 aa  310  2.9999999999999997e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3337  ABC transporter related  37.7 
 
 		 511 aa  310  4e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.700488 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0838  ABC transporter related protein  36.71 
 
 		 516 aa  310  4e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.624607  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3586  ABC transporter ATP-binding protein  37.6 
 
 		 529 aa  310  4e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2176  ABC transporter related  36.87 
 
 		 509 aa  309  6.999999999999999e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1298  ABC transporter ATP-binding protein  37.57 
 
 		 523 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0636  ABC transporter related protein  38.57 
 
 		 517 aa  308  2.0000000000000002e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2843  ribose import ATP-binding protein  39.07 
 
 		 548 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132709  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>