20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0348 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4855  hypothetical protein  54.28 
 
 		 934 aa  971    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0348  hypothetical protein  100 
 
 		 928 aa  1890    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.451074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0373  hypothetical protein  95.58 
 
 		 928 aa  1793    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.223606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0413  hypothetical protein  27.62 
 
 		 1074 aa  181  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.754384  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5119  hypothetical protein  26.99 
 
 		 1076 aa  160  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3631  hypothetical protein  21.4 
 
 		 1495 aa  59.7  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3300  leucine-rich repeat-containing protein  23.67 
 
 		 1496 aa  57  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377035 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2395  leucine-rich repeat-containing protein  22.94 
 
 		 1497 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1904  hypothetical protein  24.15 
 
 		 1498 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.748697 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4425  hypothetical protein  20.97 
 
 		 1148 aa  54.7  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.385232  normal  0.669526 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4884  hypothetical protein  21.34 
 
 		 768 aa  52.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2000  hypothetical protein  22.75 
 
 		 1498 aa  52.8  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2566  hypothetical protein  23.13 
 
 		 1609 aa  52  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.812581 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5059  hypothetical protein  22.1 
 
 		 1565 aa  48.5  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4099  leucine-rich repeat-containing protein  23.17 
 
 		 1611 aa  47.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5060  hypothetical protein  23.75 
 
 		 1571 aa  47.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1072  leucine-rich repeat-containing protein  22.4 
 
 		 1439 aa  47.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4933  hypothetical protein  23.52 
 
 		 1530 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  21.42 
 
 		 1395 aa  45.1  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1113  leucine-rich repeat-containing protein  23.2 
 
 		 1439 aa  44.7  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.469276 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>