65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1055 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1055  PfkB family carbohydrate kinase  100 
 
 		 289 aa  592  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.18758  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11501  putative pfkB family carbohydrate kinase  87.89 
 
 		 289 aa  531  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.605527  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11491  putative pfkB family carbohydrate kinase  87.89 
 
 		 289 aa  530  1e-149  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0717159  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11351  putative pfkB family carbohydrate kinase  71.38 
 
 		 289 aa  435  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12381  putative pfkB family carbohydrate kinase  48.58 
 
 		 283 aa  296  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1813  pfkB family carbohydrate kinase  46.45 
 
 		 309 aa  295  7e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1746  pfkB family carbohydrate kinase  47.17 
 
 		 288 aa  290  2e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11481  putative pfkB family carbohydrate kinase  50.75 
 
 		 280 aa  270  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.036183  normal  0.108302 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0709  putative pfkB family carbohydrate kinase  48.31 
 
 		 280 aa  260  2e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.19808  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15431  putative pfkB family carbohydrate kinase  48.31 
 
 		 280 aa  259  3e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.345352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0531  PfkB domain protein  32.94 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0498  carbohydrate kinase, PfkB  32.7 
 
 		 285 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130991  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0526  PfkB domain protein  32.54 
 
 		 285 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.387077  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1085  PfkB domain protein  34.18 
 
 		 295 aa  122  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2912  ribokinase-like domain-containing protein  33.01 
 
 		 290 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.140234 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  27.51 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  21.61 
 
 		 305 aa  53.9  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2118  PfkB domain protein  27.19 
 
 		 307 aa  53.1  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  27.74 
 
 		 304 aa  52.4  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0752  ribokinase-like domain-containing protein  23.51 
 
 		 310 aa  51.6  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  23.08 
 
 		 308 aa  51.2  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1888  PfkB  27.5 
 
 		 323 aa  49.7  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.389987  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23000  sugar kinase, ribokinase  24.3 
 
 		 303 aa  50.1  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  22.54 
 
 		 306 aa  49.7  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1030  ribokinase-like domain-containing protein  34.88 
 
 		 316 aa  49.3  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2370  putative sugar kinase  34.88 
 
 		 316 aa  49.3  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.976267  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2548  carbohydrate kinase, PfkB  35.71 
 
 		 310 aa  48.9  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.636589  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2626  PfkB domain protein  34.21 
 
 		 311 aa  48.9  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2791  putative sugar kinase transferase protein  36.36 
 
 		 311 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00725009  normal  0.760664 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0173  PfkB domain protein  30.95 
 
 		 310 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00145747  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0471  PfkB  32.89 
 
 		 320 aa  47.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000138593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0225  PfkB domain protein  34.12 
 
 		 319 aa  47.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  24.3 
 
 		 291 aa  47  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0530  carbohydrate kinase, PfkB family  32.89 
 
 		 313 aa  47  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00148509  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0924  ribokinase-like domain-containing protein  24.3 
 
 		 305 aa  47  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.108155  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0688  PfkB domain protein  32.89 
 
 		 313 aa  47  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000405539  hitchhiker  0.000110738 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2117  PfkB domain protein  25.4 
 
 		 338 aa  46.6  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.496872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2870  PfkB  32.88 
 
 		 315 aa  46.6  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0148576  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  23.13 
 
 		 306 aa  46.2  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3036  PfkB domain protein  32.89 
 
 		 311 aa  46.2  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  27.47 
 
 		 332 aa  46.2  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  22.59 
 
 		 311 aa  46.2  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3069  hypothetical protein  31.51 
 
 		 315 aa  45.8  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.795207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3022  PfkB domain protein  36.92 
 
 		 333 aa  45.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523599  normal  0.417909 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2296  PfkB domain-containing protein  30.28 
 
 		 306 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2845  ribokinase-like domain-containing protein  21.71 
 
 		 270 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.50461  normal  0.552522 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1103  PfkB  31.58 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00948504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  24.72 
 
 		 319 aa  44.3  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3450  PfkB domain protein  45.71 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  29.87 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0171  carbohydrate kinase  31.87 
 
 		 310 aa  44.3  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.150341 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2945  PfkB domain protein  31.58 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3635  ribokinase-like domain-containing protein  31.58 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.151802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2113  PfkB domain protein  22.81 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  20.71 
 
 		 331 aa  44.3  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1402  ribokinase  20.38 
 
 		 318 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0972031 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0207  ribokinase-like domain-containing protein  30.59 
 
 		 319 aa  43.5  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000760585  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0386  ribokinase-like domain-containing protein  48.57 
 
 		 302 aa  43.5  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00477103 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  34.21 
 
 		 309 aa  42.7  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2067  Adenosine kinase  31.58 
 
 		 310 aa  42.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  27.5 
 
 		 329 aa  42.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1351  ribokinase-like domain-containing protein  22.87 
 
 		 309 aa  42.4  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0527  putative sugar kinase transferase, PfkB  30.59 
 
 		 312 aa  42.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1951  PfkB  24.05 
 
 		 318 aa  42.4  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.194411  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  23.32 
 
 		 305 aa  42.4  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>