24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0524 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_05501  phage integrase family protein  89.2 
 
 
389 aa  720    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0524  phage integrase family protein  100 
 
 
389 aa  798    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.437413  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05801  phage integrase family protein  88.17 
 
 
389 aa  710    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0844338  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05881  phage integrase family protein  79.48 
 
 
392 aa  619  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.152318  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05271  phage integrase family protein  52.99 
 
 
389 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0715  phage integrase family protein  51.56 
 
 
384 aa  432  1e-120  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1644  phage integrase family protein  49.61 
 
 
384 aa  425  1e-118  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1856  XisA-like site specific recombinase  52.43 
 
 
386 aa  420  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07651  Phage integrase family  49.61 
 
 
387 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.131913 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05811  phage integrase family protein  52.43 
 
 
386 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4516  integrase family protein  44.94 
 
 
388 aa  354  1e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000228037  normal  0.358425 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0136  phage integrase  45.05 
 
 
435 aa  348  1e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.500047 
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0049  Phage integrase  31.36 
 
 
368 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0716  hypothetical protein  29.12 
 
 
366 aa  158  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178112  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3928  Phage integrase  26.21 
 
 
472 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.281381  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4884  site-specific recombinase (xisC)-like  24.81 
 
 
484 aa  100  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0319246  hitchhiker  0.00583369 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1443  phage integrase family protein  21.78 
 
 
380 aa  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0279808  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1720  phage integrase family protein  23.43 
 
 
390 aa  64.7  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0253216 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0565  hypothetical protein  22.89 
 
 
414 aa  56.6  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.44782  normal  0.562637 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1706  phage integrase family protein  21.2 
 
 
390 aa  55.5  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00461976 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12771  hypothetical protein  23.58 
 
 
386 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0568502 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2243  phage integrase family protein  21.38 
 
 
404 aa  50.8  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.688916  normal  0.465096 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004441  site-specific recombinase XerD  27.16 
 
 
305 aa  44.3  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  21.29 
 
 
411 aa  43.9  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.597607 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>