25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1856 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1856  XisA-like site specific recombinase  100 
 
 		 386 aa  798    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05811  phage integrase family protein  98.19 
 
 		 386 aa  785    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05271  phage integrase family protein  56.77 
 
 		 389 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07651  Phage integrase family  56.14 
 
 		 387 aa  465  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.131913 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1644  phage integrase family protein  53.26 
 
 		 384 aa  443  1e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0715  phage integrase family protein  53.79 
 
 		 384 aa  434  1e-120  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05801  phage integrase family protein  52.47 
 
 		 389 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0844338  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05501  phage integrase family protein  52.21 
 
 		 389 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0524  phage integrase family protein  52.43 
 
 		 389 aa  420  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.437413  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05881  phage integrase family protein  51.7 
 
 		 392 aa  408  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.152318  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0136  phage integrase  48.28 
 
 		 435 aa  354  1e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.500047 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4516  integrase family protein  45.95 
 
 		 388 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000228037  normal  0.358425 
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0049  Phage integrase  30.39 
 
 		 368 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3928  Phage integrase  27.45 
 
 		 472 aa  146  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.281381  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0716  hypothetical protein  31.61 
 
 		 366 aa  145  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4884  site-specific recombinase (xisC)-like  26.39 
 
 		 484 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0319246  hitchhiker  0.00583369 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12771  hypothetical protein  23.76 
 
 		 386 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0568502 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2243  phage integrase family protein  24.04 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.688916  normal  0.465096 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0865  hypothetical protein  26.52 
 
 		 374 aa  54.3  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1443  phage integrase family protein  24.59 
 
 		 380 aa  53.9  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0279808  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1720  phage integrase family protein  23.24 
 
 		 390 aa  50.8  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0253216 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1706  phage integrase family protein  23.62 
 
 		 390 aa  46.6  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00461976 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0565  hypothetical protein  23.05 
 
 		 414 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.44782  normal  0.562637 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  30.3 
 
 		 356 aa  44.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1349  integrase family protein  28.57 
 
 		 291 aa  42.7  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>