23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_05881 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_05501  phage integrase family protein  78.96 
 
 
389 aa  635    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05881  phage integrase family protein  100 
 
 
392 aa  808    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.152318  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0524  phage integrase family protein  79.48 
 
 
389 aa  646    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.437413  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05801  phage integrase family protein  78.44 
 
 
389 aa  630  1e-179  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0844338  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05271  phage integrase family protein  52.22 
 
 
389 aa  428  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0715  phage integrase family protein  50.91 
 
 
384 aa  427  1e-118  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1856  XisA-like site specific recombinase  52.22 
 
 
386 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1644  phage integrase family protein  49.09 
 
 
384 aa  420  1e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05811  phage integrase family protein  53.12 
 
 
386 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07651  Phage integrase family  49.61 
 
 
387 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.131913 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4516  integrase family protein  44.68 
 
 
388 aa  356  5e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000228037  normal  0.358425 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0136  phage integrase  43.73 
 
 
435 aa  343  2e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.500047 
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0049  Phage integrase  30.24 
 
 
368 aa  175  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0716  hypothetical protein  28.94 
 
 
366 aa  150  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178112  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3928  Phage integrase  26.76 
 
 
472 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.281381  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4884  site-specific recombinase (xisC)-like  27.49 
 
 
484 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0319246  hitchhiker  0.00583369 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2243  phage integrase family protein  24.75 
 
 
404 aa  64.7  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.688916  normal  0.465096 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1443  phage integrase family protein  24.03 
 
 
380 aa  61.6  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0279808  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0565  hypothetical protein  22.73 
 
 
414 aa  54.3  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.44782  normal  0.562637 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12771  hypothetical protein  21.97 
 
 
386 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0568502 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1720  phage integrase family protein  22.34 
 
 
390 aa  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0253216 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1302  site-specific tyrosine recombinase XerS  24.54 
 
 
356 aa  45.8  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.287333  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1706  phage integrase family protein  21.84 
 
 
390 aa  43.9  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00461976 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>