27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1443 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1443  phage integrase family protein  100 
 
 		 380 aa  790    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0279808  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1720  phage integrase family protein  83.42 
 
 		 390 aa  672    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0253216 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1706  phage integrase family protein  81.57 
 
 		 390 aa  634  1e-180  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00461976 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12771  hypothetical protein  69.39 
 
 		 386 aa  544  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0568502 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2243  phage integrase family protein  29.5 
 
 		 404 aa  145  1e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.688916  normal  0.465096 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28561  hypothetical protein  68.63 
 
 		 105 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12991  hypothetical protein  57.61 
 
 		 99 aa  116  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0831835 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0565  hypothetical protein  27.3 
 
 		 414 aa  80.1  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.44782  normal  0.562637 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0939  phage integrase family protein  25.31 
 
 		 413 aa  79.3  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0524  phage integrase family protein  21.78 
 
 		 389 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.437413  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07651  Phage integrase family  24.4 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.131913 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4516  integrase family protein  25.48 
 
 		 388 aa  63.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000228037  normal  0.358425 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05881  phage integrase family protein  24.11 
 
 		 392 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.152318  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2571  phage integrase family protein  30.27 
 
 		 425 aa  60.5  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.460464 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05501  phage integrase family protein  23.1 
 
 		 389 aa  60.5  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05801  phage integrase family protein  23.1 
 
 		 389 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0844338  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1644  phage integrase family protein  26.52 
 
 		 384 aa  59.3  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0136  phage integrase  25.17 
 
 		 435 aa  58.9  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.500047 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4884  site-specific recombinase (xisC)-like  23.96 
 
 		 484 aa  57.4  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0319246  hitchhiker  0.00583369 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0715  phage integrase family protein  26.62 
 
 		 384 aa  57.4  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05811  phage integrase family protein  23.58 
 
 		 386 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1856  XisA-like site specific recombinase  24.59 
 
 		 386 aa  53.9  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13501  hypothetical protein  37.04 
 
 		 91 aa  53.5  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.104266 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05271  phage integrase family protein  23.05 
 
 		 389 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4384  integrase family protein  27.62 
 
 		 479 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666381  normal  0.543633 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0716  hypothetical protein  27.55 
 
 		 366 aa  44.7  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3051  integrase family protein  23.98 
 
 		 413 aa  44.7  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0515706  normal  0.125119 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>