23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0715 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0715  phage integrase family protein  100 
 
 
384 aa  778    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1644  phage integrase family protein  72.92 
 
 
384 aa  567  1e-160  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07651  Phage integrase family  66.93 
 
 
387 aa  522  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.131913 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05271  phage integrase family protein  58.38 
 
 
389 aa  470  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05801  phage integrase family protein  53.26 
 
 
389 aa  444  1e-123  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0844338  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1856  XisA-like site specific recombinase  53.79 
 
 
386 aa  441  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05811  phage integrase family protein  53.52 
 
 
386 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05501  phage integrase family protein  52.08 
 
 
389 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0524  phage integrase family protein  51.56 
 
 
389 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.437413  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05881  phage integrase family protein  50.91 
 
 
392 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.152318  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0136  phage integrase  54.62 
 
 
435 aa  366  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.500047 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4516  integrase family protein  49.22 
 
 
388 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000228037  normal  0.358425 
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0049  Phage integrase  31.07 
 
 
368 aa  170  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3928  Phage integrase  25.55 
 
 
472 aa  134  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.281381  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0716  hypothetical protein  30.83 
 
 
366 aa  131  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178112  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4884  site-specific recombinase (xisC)-like  25.25 
 
 
484 aa  109  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0319246  hitchhiker  0.00583369 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12771  hypothetical protein  24.12 
 
 
386 aa  67  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0568502 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1720  phage integrase family protein  25.33 
 
 
390 aa  64.7  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0253216 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1706  phage integrase family protein  25 
 
 
390 aa  63.2  0.000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00461976 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1443  phage integrase family protein  25.8 
 
 
380 aa  61.6  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0279808  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  31.82 
 
 
356 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0565  hypothetical protein  26.4 
 
 
414 aa  44.7  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.44782  normal  0.562637 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2243  phage integrase family protein  26.61 
 
 
404 aa  43.1  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.688916  normal  0.465096 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>