23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0565 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0565  hypothetical protein  100 
 
 		 414 aa  854    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.44782  normal  0.562637 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12771  hypothetical protein  29.86 
 
 		 386 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0568502 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0939  phage integrase family protein  25.45 
 
 		 413 aa  105  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1720  phage integrase family protein  27.07 
 
 		 390 aa  88.6  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0253216 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1706  phage integrase family protein  24.1 
 
 		 390 aa  82  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00461976 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2571  phage integrase family protein  25.75 
 
 		 425 aa  80.9  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.460464 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1443  phage integrase family protein  27.3 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0279808  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2243  phage integrase family protein  24.69 
 
 		 404 aa  72  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.688916  normal  0.465096 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11031  BRCA1 C-terminus domain-containing protein  34.07 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.795038 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28561  hypothetical protein  39.02 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0524  phage integrase family protein  22.89 
 
 		 389 aa  56.6  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.437413  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12991  hypothetical protein  37.97 
 
 		 99 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0831835 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05881  phage integrase family protein  22.38 
 
 		 392 aa  53.9  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.152318  n/a   
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0049  Phage integrase  28.4 
 
 		 368 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3928  Phage integrase  36.04 
 
 		 472 aa  51.2  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.281381  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05801  phage integrase family protein  25.14 
 
 		 389 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0844338  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0136  phage integrase  27.75 
 
 		 435 aa  48.5  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.500047 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4516  integrase family protein  24.56 
 
 		 388 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000228037  normal  0.358425 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05501  phage integrase family protein  20.26 
 
 		 389 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1644  phage integrase family protein  26.4 
 
 		 384 aa  45.4  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1856  XisA-like site specific recombinase  23.05 
 
 		 386 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0715  phage integrase family protein  26.4 
 
 		 384 aa  44.3  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05811  phage integrase family protein  22.37 
 
 		 386 aa  43.5  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>