28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0136 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0136  phage integrase  100 
 
 
435 aa  876    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.500047 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4516  integrase family protein  59.69 
 
 
388 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000228037  normal  0.358425 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07651  Phage integrase family  51.55 
 
 
387 aa  375  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.131913 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05271  phage integrase family protein  49.61 
 
 
389 aa  363  3e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1644  phage integrase family protein  52.32 
 
 
384 aa  359  5e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05811  phage integrase family protein  48.28 
 
 
386 aa  354  1e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1856  XisA-like site specific recombinase  48.28 
 
 
386 aa  354  2e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0715  phage integrase family protein  54.62 
 
 
384 aa  352  5.9999999999999994e-96  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0524  phage integrase family protein  45.05 
 
 
389 aa  348  1e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.437413  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05501  phage integrase family protein  45.22 
 
 
389 aa  344  2e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05801  phage integrase family protein  45.26 
 
 
389 aa  344  2e-93  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0844338  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05881  phage integrase family protein  43.73 
 
 
392 aa  327  3e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.152318  n/a   
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0049  Phage integrase  33.16 
 
 
368 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0716  hypothetical protein  32.64 
 
 
366 aa  161  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178112  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4884  site-specific recombinase (xisC)-like  28.12 
 
 
484 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0319246  hitchhiker  0.00583369 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3928  Phage integrase  27.03 
 
 
472 aa  150  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.281381  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12771  hypothetical protein  23.77 
 
 
386 aa  63.9  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0568502 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0865  hypothetical protein  26.44 
 
 
374 aa  63.2  0.000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1443  phage integrase family protein  25.17 
 
 
380 aa  58.9  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0279808  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1706  phage integrase family protein  26.83 
 
 
390 aa  57.4  0.0000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00461976 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1720  phage integrase family protein  25.99 
 
 
390 aa  55.8  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0253216 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2243  phage integrase family protein  22.22 
 
 
404 aa  53.9  0.000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.688916  normal  0.465096 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0565  hypothetical protein  27.75 
 
 
414 aa  48.5  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.44782  normal  0.562637 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3265  phage integrase family protein  29.86 
 
 
313 aa  47  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  36.07 
 
 
356 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5349  integrase family protein  29.38 
 
 
313 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.447665 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2007  integrase family protein  29.38 
 
 
313 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16033  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2229  integrase family protein  29.38 
 
 
313 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.73098 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>