22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4884 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4884  site-specific recombinase (xisC)-like  100 
 
 		 484 aa  1009    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0319246  hitchhiker  0.00583369 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3928  Phage integrase  32.39 
 
 		 472 aa  209  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.281381  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4516  integrase family protein  30 
 
 		 388 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000228037  normal  0.358425 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0136  phage integrase  28.12 
 
 		 435 aa  153  7e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.500047 
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0049  Phage integrase  29.66 
 
 		 368 aa  152  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1856  XisA-like site specific recombinase  26.39 
 
 		 386 aa  119  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05811  phage integrase family protein  26.93 
 
 		 386 aa  116  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05271  phage integrase family protein  27.61 
 
 		 389 aa  116  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0716  hypothetical protein  26 
 
 		 366 aa  109  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05501  phage integrase family protein  26.05 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0715  phage integrase family protein  25.25 
 
 		 384 aa  107  6e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05881  phage integrase family protein  27.32 
 
 		 392 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.152318  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05801  phage integrase family protein  24.81 
 
 		 389 aa  104  4e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0844338  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07651  Phage integrase family  27.53 
 
 		 387 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.131913 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0524  phage integrase family protein  24.81 
 
 		 389 aa  100  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.437413  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1644  phage integrase family protein  24.29 
 
 		 384 aa  92.4  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1443  phage integrase family protein  23.96 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0279808  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1720  phage integrase family protein  24.03 
 
 		 390 aa  56.6  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0253216 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1706  phage integrase family protein  25 
 
 		 390 aa  53.9  0.000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00461976 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12771  hypothetical protein  23.71 
 
 		 386 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0568502 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12991  hypothetical protein  38.18 
 
 		 99 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0831835 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28561  hypothetical protein  36.54 
 
 		 105 aa  43.5  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>