20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0716 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0716  hypothetical protein  100 
 
 
366 aa  757    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178112  normal 
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0049  Phage integrase  32.13 
 
 
368 aa  169  6e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4516  integrase family protein  33.68 
 
 
388 aa  169  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000228037  normal  0.358425 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0136  phage integrase  32.64 
 
 
435 aa  161  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.500047 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0524  phage integrase family protein  29.12 
 
 
389 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.437413  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05801  phage integrase family protein  29.05 
 
 
389 aa  155  7e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0844338  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05501  phage integrase family protein  29.05 
 
 
389 aa  153  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1856  XisA-like site specific recombinase  31.61 
 
 
386 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05811  phage integrase family protein  31.01 
 
 
386 aa  144  3e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05881  phage integrase family protein  29.27 
 
 
392 aa  144  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.152318  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07651  Phage integrase family  32.11 
 
 
387 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.131913 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05271  phage integrase family protein  29.82 
 
 
389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1644  phage integrase family protein  30.1 
 
 
384 aa  130  3e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0715  phage integrase family protein  30.57 
 
 
384 aa  127  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4884  site-specific recombinase (xisC)-like  26 
 
 
484 aa  109  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0319246  hitchhiker  0.00583369 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3928  Phage integrase  26.74 
 
 
472 aa  104  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.281381  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  25.73 
 
 
306 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  26.89 
 
 
310 aa  50.4  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0939  phage integrase family protein  26.19 
 
 
413 aa  44.7  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039974  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1443  phage integrase family protein  27.55 
 
 
380 aa  44.7  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0279808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>