21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_D0049 on replicon NC_014000
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014000  Ava_D0049  Phage integrase  100 
 
 		 368 aa  763    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4516  integrase family protein  35.98 
 
 		 388 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000228037  normal  0.358425 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0136  phage integrase  33.16 
 
 		 435 aa  190  2.9999999999999997e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.500047 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1644  phage integrase family protein  33.25 
 
 		 384 aa  188  1e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05801  phage integrase family protein  31.88 
 
 		 389 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0844338  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0524  phage integrase family protein  31.36 
 
 		 389 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.437413  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05501  phage integrase family protein  31.36 
 
 		 389 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0716  hypothetical protein  32.13 
 
 		 366 aa  169  6e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05881  phage integrase family protein  29.97 
 
 		 392 aa  166  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.152318  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0715  phage integrase family protein  31.07 
 
 		 384 aa  166  6.9999999999999995e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1856  XisA-like site specific recombinase  30.39 
 
 		 386 aa  163  3e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05811  phage integrase family protein  30.91 
 
 		 386 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05271  phage integrase family protein  28.39 
 
 		 389 aa  159  9e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4884  site-specific recombinase (xisC)-like  29.66 
 
 		 484 aa  152  7e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0319246  hitchhiker  0.00583369 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07651  Phage integrase family  29.23 
 
 		 387 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.131913 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3928  Phage integrase  28.28 
 
 		 472 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.281381  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0565  hypothetical protein  28.4 
 
 		 414 aa  51.2  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.44782  normal  0.562637 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  46.51 
 
 		 396 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2937  integrase, putative  40.38 
 
 		 139 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.456202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2523  Bbp50  43.18 
 
 		 69 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  41.86 
 
 		 356 aa  44.3  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>