25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_05801 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_05501  phage integrase family protein  94.86 
 
 
389 aa  764    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05801  phage integrase family protein  100 
 
 
389 aa  800    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0844338  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0524  phage integrase family protein  88.17 
 
 
389 aa  710    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.437413  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05881  phage integrase family protein  78.44 
 
 
392 aa  604  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.152318  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0715  phage integrase family protein  53.26 
 
 
384 aa  441  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05271  phage integrase family protein  54.01 
 
 
389 aa  435  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1644  phage integrase family protein  50.91 
 
 
384 aa  435  1e-121  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07651  Phage integrase family  51.44 
 
 
387 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.131913 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1856  XisA-like site specific recombinase  52.47 
 
 
386 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05811  phage integrase family protein  52.47 
 
 
386 aa  425  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4516  integrase family protein  47 
 
 
388 aa  363  3e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000228037  normal  0.358425 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0136  phage integrase  45.26 
 
 
435 aa  344  1e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.500047 
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0049  Phage integrase  31.88 
 
 
368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0716  hypothetical protein  29.05 
 
 
366 aa  155  8e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178112  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3928  Phage integrase  26.7 
 
 
472 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.281381  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4884  site-specific recombinase (xisC)-like  24.81 
 
 
484 aa  104  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0319246  hitchhiker  0.00583369 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1443  phage integrase family protein  23.1 
 
 
380 aa  59.3  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0279808  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1720  phage integrase family protein  23.45 
 
 
390 aa  58.2  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0253216 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12771  hypothetical protein  23.7 
 
 
386 aa  56.2  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0568502 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1706  phage integrase family protein  21.28 
 
 
390 aa  51.6  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00461976 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2243  phage integrase family protein  22.38 
 
 
404 aa  50.4  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.688916  normal  0.465096 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0565  hypothetical protein  25.14 
 
 
414 aa  48.5  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.44782  normal  0.562637 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0865  hypothetical protein  25.29 
 
 
374 aa  43.9  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  20.8 
 
 
411 aa  43.1  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004441  site-specific recombinase XerD  26.54 
 
 
305 aa  43.1  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>