19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3928 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3928  Phage integrase  100 
 
 		 472 aa  978    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.281381  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4884  site-specific recombinase (xisC)-like  32.39 
 
 		 484 aa  209  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0319246  hitchhiker  0.00583369 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4516  integrase family protein  29.98 
 
 		 388 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000228037  normal  0.358425 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0136  phage integrase  27.03 
 
 		 435 aa  150  7e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.500047 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05811  phage integrase family protein  27.45 
 
 		 386 aa  147  5e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1856  XisA-like site specific recombinase  27.45 
 
 		 386 aa  146  8.000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1644  phage integrase family protein  25.91 
 
 		 384 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0715  phage integrase family protein  25.06 
 
 		 384 aa  130  5.0000000000000004e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07651  Phage integrase family  26.39 
 
 		 387 aa  130  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.131913 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05271  phage integrase family protein  26.92 
 
 		 389 aa  129  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05801  phage integrase family protein  26.7 
 
 		 389 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0844338  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05501  phage integrase family protein  26.51 
 
 		 389 aa  126  7e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0049  Phage integrase  28.28 
 
 		 368 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0524  phage integrase family protein  26.21 
 
 		 389 aa  118  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.437413  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05881  phage integrase family protein  26 
 
 		 392 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.152318  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0716  hypothetical protein  26.74 
 
 		 366 aa  104  4e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0565  hypothetical protein  36.04 
 
 		 414 aa  51.2  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.44782  normal  0.562637 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12991  hypothetical protein  41.3 
 
 		 99 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0831835 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2571  phage integrase family protein  27.06 
 
 		 425 aa  43.5  0.009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.460464 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>