25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_12771 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_12771  hypothetical protein  100 
 
 
386 aa  796    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0568502 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1720  phage integrase family protein  69.15 
 
 
390 aa  556  1e-157  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0253216 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1443  phage integrase family protein  69.39 
 
 
380 aa  544  1e-153  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0279808  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1706  phage integrase family protein  66.49 
 
 
390 aa  520  1e-146  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00461976 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28561  hypothetical protein  91.26 
 
 
105 aa  199  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2243  phage integrase family protein  28.31 
 
 
404 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.688916  normal  0.465096 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12991  hypothetical protein  67.74 
 
 
99 aa  132  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0831835 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0565  hypothetical protein  29.86 
 
 
414 aa  105  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.44782  normal  0.562637 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0939  phage integrase family protein  26.24 
 
 
413 aa  78.2  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039974  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13501  hypothetical protein  64.15 
 
 
91 aa  75.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.104266 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07651  Phage integrase family  25.68 
 
 
387 aa  70.1  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.131913 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0715  phage integrase family protein  25.65 
 
 
384 aa  64.3  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05811  phage integrase family protein  24.82 
 
 
386 aa  64.3  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0136  phage integrase  23.77 
 
 
435 aa  63.9  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.500047 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1856  XisA-like site specific recombinase  23.76 
 
 
386 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4516  integrase family protein  22.7 
 
 
388 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000228037  normal  0.358425 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1644  phage integrase family protein  23.53 
 
 
384 aa  56.6  0.0000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05801  phage integrase family protein  23.7 
 
 
389 aa  56.2  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0844338  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0524  phage integrase family protein  23.58 
 
 
389 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.437413  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05271  phage integrase family protein  22.7 
 
 
389 aa  53.5  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4884  site-specific recombinase (xisC)-like  23.71 
 
 
484 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0319246  hitchhiker  0.00583369 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05501  phage integrase family protein  22.73 
 
 
389 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05881  phage integrase family protein  22.46 
 
 
392 aa  47  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.152318  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4384  integrase family protein  27.14 
 
 
479 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666381  normal  0.543633 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_2073  hypothetical protein  65.52 
 
 
32 aa  43.9  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>