150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1473 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1473  hypothetical protein  100 
 
 
393 aa  814    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01761  hypothetical protein  99.24 
 
 
393 aa  808    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.46624  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2342  hypothetical protein  55.24 
 
 
391 aa  486  1e-136  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0350  hypothetical protein  54.99 
 
 
391 aa  476  1e-133  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01201  hypothetical protein  54.87 
 
 
390 aa  472  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.640897  normal  0.481871 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02101  hypothetical protein  53.76 
 
 
378 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01201  hypothetical protein  53.16 
 
 
384 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01211  hypothetical protein  52.63 
 
 
384 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01171  hypothetical protein  53.11 
 
 
388 aa  421  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.173885  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0108  hypothetical protein  52.63 
 
 
384 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.139955  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1187  hypothetical protein  48.84 
 
 
391 aa  389  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.225085  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0804  hypothetical protein  47.21 
 
 
391 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0543  protein of unknown function DUF482  44.82 
 
 
395 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0560  protein of unknown function DUF482  44.82 
 
 
395 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4569  hypothetical protein  43.65 
 
 
403 aa  364  1e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3564  protein of unknown function DUF482  43.98 
 
 
391 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.221346 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1577  protein of unknown function DUF482  42.3 
 
 
396 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.187748 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0133  protein of unknown function DUF482  39.53 
 
 
403 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00342506  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1444  protein of unknown function DUF482  31.01 
 
 
411 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0896  hypothetical protein  32.73 
 
 
414 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2114  hypothetical protein  30.93 
 
 
391 aa  204  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0393548 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2555  hypothetical protein  32.47 
 
 
414 aa  202  7e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0252  hypothetical protein  31.79 
 
 
393 aa  199  6e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1140  hypothetical protein  30.46 
 
 
394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0437  hypothetical protein  32.96 
 
 
387 aa  197  4.0000000000000005e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0679  hypothetical protein  32.04 
 
 
374 aa  196  6e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.323848  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2734  hypothetical protein  29.97 
 
 
385 aa  196  6e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3017  hypothetical protein  33.04 
 
 
384 aa  195  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0657  hypothetical protein  30.39 
 
 
373 aa  193  4e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0822  hypothetical protein  30.77 
 
 
390 aa  192  8e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.295229  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0702  hypothetical protein  31.98 
 
 
378 aa  190  4e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0790  hypothetical protein  31.98 
 
 
378 aa  189  5e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2969  hypothetical protein  30.45 
 
 
381 aa  189  7e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4685  protein of unknown function DUF482  31.55 
 
 
406 aa  187  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3312  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2007  protein of unknown function DUF482  30.87 
 
 
392 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199374  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1865  hypothetical protein  31.9 
 
 
406 aa  188  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.164344  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3841  hypothetical protein  29.46 
 
 
416 aa  186  4e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.614644  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2458  hypothetical protein  30.53 
 
 
423 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2475  hypothetical protein  30.99 
 
 
395 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.407377  normal  0.0590595 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0063  hypothetical protein  30 
 
 
386 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.405281  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4316  hypothetical protein  31.55 
 
 
406 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2322  hypothetical protein  28.97 
 
 
427 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.483949 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2105  hypothetical protein  29.82 
 
 
438 aa  183  5.0000000000000004e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.261264  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1962  protein of unknown function DUF482  29.9 
 
 
456 aa  182  6e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.846465  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2871  hypothetical protein  30.61 
 
 
388 aa  182  9.000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1760  hypothetical protein  29.65 
 
 
406 aa  182  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0135  protein of unknown function DUF482  31.96 
 
 
406 aa  182  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2323  hypothetical protein  30.25 
 
 
392 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.471895  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1715  hypothetical protein  31.77 
 
 
377 aa  179  5.999999999999999e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06130  hypothetical protein  30.29 
 
 
388 aa  179  9e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.187585  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01036  hypothetical protein  30.29 
 
 
388 aa  179  9e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0479769  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5740  hypothetical protein  29.65 
 
 
392 aa  179  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2329  hypothetical protein  34 
 
 
392 aa  179  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.653635  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1294  hypothetical protein  28.79 
 
 
393 aa  178  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.724983  normal  0.811045 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1665  hypothetical protein  32.59 
 
 
418 aa  177  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.750799  normal  0.0965206 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2534  hypothetical protein  32.07 
 
 
384 aa  177  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2417  hypothetical protein  29.4 
 
 
392 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.673667  normal  0.0190965 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2359  protein of unknown function DUF482  29.35 
 
 
393 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.597494  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1116  protein of unknown function DUF482  33.24 
 
 
389 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.492606  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0943  hypothetical protein  28.89 
 
 
380 aa  177  3e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.118065  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4593  hypothetical protein  28.54 
 
 
405 aa  177  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1114  protein of unknown function DUF482  29.16 
 
 
392 aa  177  4e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.333144 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4092  hypothetical protein  27.94 
 
 
375 aa  176  6e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1801  hypothetical protein  29.15 
 
 
392 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2413  hypothetical protein  29.15 
 
 
392 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2348  hypothetical protein  28.75 
 
 
408 aa  176  9e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.291454  normal  0.220022 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4876  hypothetical protein  28.26 
 
 
407 aa  176  9e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.239884  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2458  hypothetical protein  29.74 
 
 
374 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3828  hypothetical protein  27.98 
 
 
375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210412  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4833  protein of unknown function DUF482  30.6 
 
 
406 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.261808  normal  0.379038 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0114  hypothetical protein  26.6 
 
 
421 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139598  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3397  hypothetical protein  32.49 
 
 
389 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.6252  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3005  hypothetical protein  31.17 
 
 
383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3548  protein of unknown function DUF482  31.37 
 
 
409 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459173  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0804  hypothetical protein  30.21 
 
 
402 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0877  hypothetical protein  28.89 
 
 
392 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1930  protein of unknown function DUF482  29.17 
 
 
374 aa  173  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.207995 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2170  hypothetical protein  31.99 
 
 
390 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164145  hitchhiker  0.00000155889 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1668  hypothetical protein  29.86 
 
 
427 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1249  hypothetical protein  28.72 
 
 
374 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.25813 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1736  hypothetical protein  28.82 
 
 
414 aa  172  7.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.327747 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3315  hypothetical protein  28.77 
 
 
406 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.479503  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3121  hypothetical protein  27.71 
 
 
438 aa  172  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0166  protein of unknown function DUF482  29.37 
 
 
405 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0717665  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2157  hypothetical protein  29.62 
 
 
455 aa  171  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.391826  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1930  hypothetical protein  30.08 
 
 
405 aa  171  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0856188 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2533  hypothetical protein  29.01 
 
 
402 aa  170  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.941945  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2563  protein of unknown function DUF482  29.43 
 
 
410 aa  171  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.871216  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2786  hypothetical protein  30.48 
 
 
381 aa  171  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2450  hypothetical protein  28.65 
 
 
417 aa  170  4e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.456626  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3045  hypothetical protein  30.62 
 
 
411 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19080  hypothetical protein  28.42 
 
 
374 aa  169  7e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2085  hypothetical protein  28.03 
 
 
446 aa  169  8e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.817202  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2159  protein of unknown function DUF482  29.43 
 
 
410 aa  169  9e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.296465  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2025  hypothetical protein  29.29 
 
 
405 aa  169  9e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1425  hypothetical protein  28.65 
 
 
414 aa  169  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.625932  normal  0.472174 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3481  hypothetical protein  28.02 
 
 
388 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.334127 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3885  protein of unknown function DUF482  27.36 
 
 
411 aa  168  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.854025  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1656  hypothetical protein  28.34 
 
 
433 aa  166  5e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.135069  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4753  hypothetical protein  29.67 
 
 
402 aa  166  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.51971 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>