More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1116 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1116  30S ribosomal protein S8  100 
 
 		 133 aa  272  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19901  30S ribosomal protein S8  99.25 
 
 		 133 aa  270  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1968  30S ribosomal protein S8  87.88 
 
 		 133 aa  243  8e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16651  30S ribosomal protein S8  87.12 
 
 		 133 aa  241  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0363  30S ribosomal protein S8  84.85 
 
 		 133 aa  236  8e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.10558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23161  30S ribosomal protein S8  85.61 
 
 		 133 aa  233  8e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17521  30S ribosomal protein S8  81.82 
 
 		 133 aa  232  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17361  30S ribosomal protein S8  81.06 
 
 		 133 aa  231  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1637  30S ribosomal protein S8  81.06 
 
 		 133 aa  230  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17271  30S ribosomal protein S8  80.3 
 
 		 133 aa  229  6e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2219  30S ribosomal protein S8  68.42 
 
 		 133 aa  196  9e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.969535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2999  30S ribosomal protein S8  66.67 
 
 		 133 aa  189  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402588  hitchhiker  0.00660095 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0704  30S ribosomal protein S8  63.91 
 
 		 133 aa  187  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000118286  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2572  30S ribosomal protein S8  63.16 
 
 		 133 aa  187  4e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.675088  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3716  30S ribosomal protein S8  62.12 
 
 		 133 aa  179  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1305  30S ribosomal protein S8  62.41 
 
 		 133 aa  178  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0239  30S ribosomal protein S8  61.36 
 
 		 133 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0236  30S ribosomal protein S8  61.36 
 
 		 133 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.88489 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4493  ribosomal protein S8  55.47 
 
 		 136 aa  146  8e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1925  30S ribosomal protein S8  56.39 
 
 		 132 aa  145  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.452799 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1947  30S ribosomal protein S8  54.89 
 
 		 132 aa  144  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2032  30S ribosomal protein S8  54.89 
 
 		 132 aa  144  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1932  30S ribosomal protein S8  56.06 
 
 		 132 aa  144  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2697  ribosomal protein S8  56.59 
 
 		 131 aa  144  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  54.14 
 
 		 132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6600  ribosomal protein S8  53.38 
 
 		 132 aa  142  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3981  ribosomal protein S8  51.56 
 
 		 131 aa  142  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2160  30S ribosomal protein S8  50.38 
 
 		 130 aa  141  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000012701  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0412  ribosomal protein S8  50.74 
 
 		 136 aa  142  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0162  30S ribosomal protein S8  51.88 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20730  SSU ribosomal protein S8P  51.13 
 
 		 132 aa  141  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0309  ribosomal protein S8  48.12 
 
 		 131 aa  141  3e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000138309  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3403  ribosomal protein S8  51.88 
 
 		 132 aa  141  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337748  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0184  30S ribosomal protein S8  51.88 
 
 		 130 aa  140  4e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050833  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3303  30S ribosomal protein S8  51.13 
 
 		 131 aa  140  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0633742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0198  30S ribosomal protein S8  49.62 
 
 		 130 aa  141  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421054  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00744  30S ribosomal protein S8  50.38 
 
 		 130 aa  140  5e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1840  30S ribosomal protein S8  55.04 
 
 		 133 aa  140  6e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0334  30S ribosomal protein S8  50.38 
 
 		 130 aa  140  6e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000236228  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0419  SSU ribosomal protein S8P  52.63 
 
 		 131 aa  140  7e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00478629  normal  0.230191 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0227  30S ribosomal protein S8  50.38 
 
 		 131 aa  140  7e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000103227  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3165  30S ribosomal protein S8  51.13 
 
 		 131 aa  140  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000492861  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0210  30S ribosomal protein S8  50.38 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000163512  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0351  30S ribosomal protein S8  55.04 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000194247  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4042  30S ribosomal protein S8  50.38 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000122909  unclonable  0.00000000000313714 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4156  30S ribosomal protein S8  50.38 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000345166  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0214  30S ribosomal protein S8  50.38 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000574735  hitchhiker  0.000110965 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0074  30S ribosomal protein S8  49.62 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000574269  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3653  30S ribosomal protein S8  48.87 
 
 		 133 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00001719  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3692  ribosomal protein S8  50.38 
 
 		 132 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0000284397  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1171  30S ribosomal protein S8  51.94 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0152092  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4307  ribosomal protein S8  51.88 
 
 		 132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.550875  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10732  30S ribosomal protein S8  49.62 
 
 		 132 aa  137  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.697308  normal  0.840798 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2936  30S ribosomal protein S8  50.38 
 
 		 131 aa  138  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000152051  hitchhiker  0.000000826655 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23660  SSU ribosomal protein S8P  51.88 
 
 		 132 aa  138  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.06742  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0337  ribosomal protein S8  51.52 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000518879  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0300  30S ribosomal protein S8  50.38 
 
 		 132 aa  138  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  normal  0.100936 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3283  30S ribosomal protein S8  50.38 
 
 		 131 aa  138  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000196614  hitchhiker  0.00000244921 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0172  30S ribosomal protein S8  48.87 
 
 		 130 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000595155  decreased coverage  0.000051786 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0064  30S ribosomal protein S8  51.88 
 
 		 131 aa  137  4.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000237116  hitchhiker  9.24625e-17 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  54.26 
 
 		 132 aa  137  4.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1271  ribosomal protein S8  50 
 
 		 131 aa  137  4.999999999999999e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001728  SSU ribosomal protein S8p (S15Ae)  49.62 
 
 		 130 aa  137  4.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000120739  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03157  30S ribosomal protein S8  51.49 
 
 		 130 aa  137  6e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000452809  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0407  ribosomal protein S8  51.49 
 
 		 130 aa  137  6e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000058536  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4629  30S ribosomal protein S8  51.49 
 
 		 130 aa  137  6e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000277802  normal  0.781469 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3601  30S ribosomal protein S8  51.49 
 
 		 130 aa  137  6e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000126765  normal  0.0104758 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0407  30S ribosomal protein S8  51.49 
 
 		 130 aa  137  6e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000202289  hitchhiker  0.00000218378 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2632  30S ribosomal protein S8  51.88 
 
 		 132 aa  137  6e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.17852  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03108  hypothetical protein  51.49 
 
 		 130 aa  137  6e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000188552  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3730  30S ribosomal protein S8  51.49 
 
 		 130 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0711258  normal  0.0251967 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3793  30S ribosomal protein S8  51.49 
 
 		 130 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.114774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3500  30S ribosomal protein S8  51.49 
 
 		 130 aa  137  6e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000345465  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3789  30S ribosomal protein S8  51.49 
 
 		 130 aa  137  6e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000933012  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3691  30S ribosomal protein S8  51.49 
 
 		 130 aa  137  6e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000772145  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3622  30S ribosomal protein S8  51.49 
 
 		 130 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000167775  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3695  30S ribosomal protein S8  51.49 
 
 		 130 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.068441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3622  30S ribosomal protein S8  51.49 
 
 		 130 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0133012  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3005  30S ribosomal protein S8  49.62 
 
 		 131 aa  137  7e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00104823  normal  0.0533117 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0702  30S ribosomal protein S8  49.62 
 
 		 132 aa  137  7e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4676  30S ribosomal protein S8  48.87 
 
 		 130 aa  137  7e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000540573  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4012  30S ribosomal protein S8  51.13 
 
 		 132 aa  137  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.0000631247 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1199  30S ribosomal protein S8  50.74 
 
 		 135 aa  137  7e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0257081 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0576  30S ribosomal protein S8  50.38 
 
 		 132 aa  136  7.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0245  30S ribosomal protein S8  49.62 
 
 		 130 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0341  30S ribosomal protein S8  48.12 
 
 		 131 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000242474  normal  0.012194 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3745  30S ribosomal protein S8  49.62 
 
 		 130 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000380848  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2825  30S ribosomal protein S8  48.12 
 
 		 131 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00378169  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0290  30S ribosomal protein S8  48.12 
 
 		 131 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000392794  normal  0.0211044 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2745  30S ribosomal protein S8  48.12 
 
 		 131 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000001061  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0213  30S ribosomal protein S8  49.62 
 
 		 130 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000264343  unclonable  0.0000000000147865 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0208  30S ribosomal protein S8  49.62 
 
 		 130 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000167533  hitchhiker  0.00729445 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0281  30S ribosomal protein S8  48.12 
 
 		 131 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00164678  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0362  30S ribosomal protein S8  48.12 
 
 		 131 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000109852  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0213  30S ribosomal protein S8  49.62 
 
 		 130 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000775754  hitchhiker  0.00000000141072 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0337  30S ribosomal protein S8  50.75 
 
 		 130 aa  135  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000118784  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3737  30S ribosomal protein S8  50.75 
 
 		 130 aa  135  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000362987  decreased coverage  0.00101243 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0641  ribosomal protein S8  50.38 
 
 		 132 aa  135  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.968083  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  49.61 
 
 		 131 aa  136  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3429  SSU ribosomal protein S8P  48.87 
 
 		 131 aa  135  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401313  normal  0.18397 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>