More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_69737 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_69737  mitochondrial ribosomal protein S9  100 
 
 
313 aa  642    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.383242  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06564  37S ribosomal protein S9 (AFU_orthologue; AFUA_6G04560)  42.51 
 
 
320 aa  169  5e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.270998  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1018  30S ribosomal protein S9  48.15 
 
 
152 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0821  30S ribosomal protein S9  45.8 
 
 
149 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.766995  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  46.83 
 
 
130 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2970  30S ribosomal protein S9  43.85 
 
 
159 aa  116  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0570988  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3285  30S ribosomal protein S9  45.11 
 
 
180 aa  115  7.999999999999999e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0797  30S ribosomal protein S9  45.97 
 
 
128 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000494469  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4594  30S ribosomal protein S9  44.27 
 
 
188 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0746  ribosomal protein S9  48.8 
 
 
134 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0244  30S ribosomal protein S9  43.61 
 
 
165 aa  114  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44376  Putative mitochondrial ribosomal protein S9  44.62 
 
 
137 aa  114  3e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.272268  normal  0.0615746 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2151  30S ribosomal protein S9  41.54 
 
 
158 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.45731  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4345  30S ribosomal protein S9  38.75 
 
 
160 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59912  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3025  30S ribosomal protein S9  38.96 
 
 
157 aa  112  7.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0021  30S ribosomal protein S9  43.08 
 
 
160 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849835  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1650  30S ribosomal protein S9  43.08 
 
 
160 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.377487 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2613  30S ribosomal protein S9  45.31 
 
 
169 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2938  ribosomal protein S9  43.15 
 
 
162 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000844995 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1234  30S ribosomal protein S9  41.35 
 
 
155 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745621  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0367  30S ribosomal protein S9  45.16 
 
 
130 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000448381  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1163  30S ribosomal protein S9  42.75 
 
 
160 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.456788  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0382  30S ribosomal protein S9  45.16 
 
 
130 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0184231  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2249  30S ribosomal protein S9  39.1 
 
 
163 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1476  30S ribosomal protein S9  41.54 
 
 
166 aa  110  4.0000000000000004e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.270542 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1321  30S ribosomal protein S9  41.35 
 
 
155 aa  109  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243338  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1513  SSU ribosomal protein S9P  41.22 
 
 
165 aa  109  7.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.472306 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0342  SSU ribosomal protein S9P  41.25 
 
 
170 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651444  hitchhiker  0.00386337 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1601  30S ribosomal protein S9  43.08 
 
 
164 aa  108  8.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.292372  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2120  SSU ribosomal protein S9P  44.72 
 
 
130 aa  108  9.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.39803  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1566  30S ribosomal protein S9  43.55 
 
 
128 aa  108  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000968491  normal  0.322438 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2175  30S ribosomal protein S9  42.31 
 
 
160 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0915323  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2454  30S ribosomal protein S9  40.58 
 
 
158 aa  108  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1748  30S ribosomal protein S9  43.55 
 
 
128 aa  108  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000973218  normal  0.252579 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3702  ribosomal protein S9  41.94 
 
 
130 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000244977  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0491  30S ribosomal protein S9  44.35 
 
 
130 aa  108  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0372353  normal  0.193269 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1422  30S ribosomal protein S9  40.58 
 
 
158 aa  108  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.51395  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2708  30S ribosomal protein S9  39.07 
 
 
158 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.421371  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5159  ribosomal protein S9  44.53 
 
 
169 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623801  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0839  ribosomal protein S9  40.88 
 
 
145 aa  107  3e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2703  30S ribosomal protein S9  43.55 
 
 
130 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490029  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0300  30S ribosomal protein S9  40.62 
 
 
130 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00212654  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1872  30S ribosomal protein S9  37.11 
 
 
159 aa  107  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.952658 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1681  30S ribosomal protein S9  40.6 
 
 
155 aa  107  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00362695  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1154  ribosomal protein S9  45.16 
 
 
132 aa  107  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.252489  normal  0.0143228 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3995  ribosomal protein S9  45.16 
 
 
132 aa  107  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.850021  hitchhiker  0.000512267 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2672  30S ribosomal protein S9  39.07 
 
 
158 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.569835  normal  0.132209 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2697  30S ribosomal protein S9  38.56 
 
 
161 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.145825  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0411  30S ribosomal protein S9  44.35 
 
 
130 aa  106  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000014619  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1384  30S ribosomal protein S9  41.54 
 
 
161 aa  106  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3638  ribosomal protein S9  40.62 
 
 
130 aa  106  5e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00994207  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2241  SSU ribosomal protein S9P  43.75 
 
 
130 aa  106  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.201316  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3107  30S ribosomal protein S9  37.97 
 
 
160 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.966484  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4348  30S ribosomal protein S9  40.62 
 
 
130 aa  106  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000012665  hitchhiker  0.00291766 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1379  30S ribosomal protein S9  38.36 
 
 
159 aa  106  7e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0851685 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1116  30S ribosomal protein S9  43.55 
 
 
130 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2342  30S ribosomal protein S9  43.55 
 
 
130 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3413  30S ribosomal protein S9  43.55 
 
 
130 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0107857  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3420  30S ribosomal protein S9  43.55 
 
 
130 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000202027  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3377  30S ribosomal protein S9  43.55 
 
 
130 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000325455  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0902  30S ribosomal protein S9  39.69 
 
 
161 aa  105  7e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.829966  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1234  30S ribosomal protein S9  42.74 
 
 
130 aa  105  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000854245  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0254  30S ribosomal protein S9  43.55 
 
 
130 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2520  30S ribosomal protein S9  43.55 
 
 
130 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2663  30S ribosomal protein S9  42.97 
 
 
130 aa  105  8e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00134428  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2843  30S ribosomal protein S9  39.69 
 
 
161 aa  105  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3517  30S ribosomal protein S9  42.98 
 
 
130 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143376  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3371  30S ribosomal protein S9  42.98 
 
 
130 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3453  30S ribosomal protein S9  42.98 
 
 
130 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2620  30S ribosomal protein S9  39.69 
 
 
161 aa  105  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.159482 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0600  30S ribosomal protein S9  42.97 
 
 
173 aa  105  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.458366 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0600  30S ribosomal protein S9  42.74 
 
 
130 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000648007  normal  0.790405 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1885  ribosomal protein S9  45.16 
 
 
133 aa  105  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000534939  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0006  ribosomal protein S9  44.63 
 
 
133 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.819912  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0861  30S ribosomal protein S9  39.1 
 
 
155 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0415089  normal  0.103809 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3766  30S ribosomal protein S9  42.74 
 
 
130 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.658387  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0093  30S ribosomal protein S9  45.67 
 
 
129 aa  105  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2425  30S ribosomal protein S9  40.77 
 
 
164 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149157  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0056  SSU ribosomal protein S9P  45.16 
 
 
130 aa  105  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0128063  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0647  30S ribosomal protein S9  42.74 
 
 
130 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00285977  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0197  30S ribosomal protein S9  42.74 
 
 
130 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.202545  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3796  ribosomal protein S9  39.84 
 
 
130 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000182281  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2297  ribosomal protein S9  41.94 
 
 
130 aa  105  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000207473  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0574  30S ribosomal protein S9  42.74 
 
 
130 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00443027  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0128  30S ribosomal protein S9  46.34 
 
 
130 aa  105  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000606121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0680  30S ribosomal protein S9  42.74 
 
 
130 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000222538  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2650  30S ribosomal protein S9  38.93 
 
 
161 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0215  30S ribosomal protein S9  45.53 
 
 
130 aa  104  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00249156  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0790  30S ribosomal protein S9  38.41 
 
 
158 aa  104  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.552498  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4591  30S ribosomal protein S9  40 
 
 
160 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0650  SSU ribosomal protein S9P  43.55 
 
 
130 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.4124e-16  normal  0.0939463 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0786  30S ribosomal protein S9  38.41 
 
 
158 aa  104  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.637937  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2496  30S ribosomal protein S9  38.41 
 
 
158 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1450  SSU ribosomal protein S9P  44.72 
 
 
131 aa  104  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188818  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3353  30S ribosomal protein S9  42.74 
 
 
130 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000507288  hitchhiker  0.0000404008 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0608  30S ribosomal protein S9  42.74 
 
 
130 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000451686  normal  0.262066 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0051  30S ribosomal protein S9  47.5 
 
 
128 aa  103  3e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2563  30S ribosomal protein S9  42.74 
 
 
130 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714908  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1394  ribosomal protein S9  45 
 
 
129 aa  103  3e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000135637  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2471  ribosomal protein S9  41.94 
 
 
130 aa  103  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>